33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0892 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0892  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  665    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000863231 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1921  hypothetical protein  36.79 
 
 
308 aa  162  6e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2398  hypothetical protein  41.15 
 
 
254 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00182976  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  36.24 
 
 
188 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2213  hypothetical protein  32.17 
 
 
186 aa  90.1  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.267822  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2004  hypothetical protein  38.89 
 
 
205 aa  90.1  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  hitchhiker  0.00247338 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1820  hypothetical protein  33.56 
 
 
187 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000198777  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2886  hypothetical protein  42.18 
 
 
190 aa  87.4  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0826  hypothetical protein  38.66 
 
 
199 aa  86.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0368  hypothetical protein  38.76 
 
 
161 aa  85.1  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.278582  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1607  hypothetical protein  29.05 
 
 
194 aa  84  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2373  hypothetical protein  41.5 
 
 
184 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1155  hypothetical protein  32.37 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3401  hypothetical protein  36.72 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  31.06 
 
 
205 aa  75.1  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1731  hypothetical protein  30.77 
 
 
194 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  28.99 
 
 
260 aa  67  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2212  hypothetical protein  32.35 
 
 
313 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0947  hypothetical protein  31.86 
 
 
204 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0113  hypothetical protein  29.51 
 
 
191 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0852347 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1729  putative lipoprotein  28.44 
 
 
276 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2325  hypothetical protein  29.17 
 
 
210 aa  54.3  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.927905  normal  0.207292 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0115  hypothetical protein  28.39 
 
 
313 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167532 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2213  hypothetical protein  26.45 
 
 
265 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3399  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.71 
 
 
251 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  28.95 
 
 
212 aa  50.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  28.95 
 
 
212 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1338  hypothetical protein  28.37 
 
 
208 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  27.19 
 
 
222 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1590  hypothetical protein  25.83 
 
 
208 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  24.56 
 
 
211 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3094  hypothetical protein  28.07 
 
 
208 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1252  hypothetical protein  23.66 
 
 
210 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>