61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0873 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0873  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 146 aa  288  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.485227 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1025  nuclease  63.96 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0861238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  49.12 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2807  nuclease (SNase-like)  46.3 
 
 		 178 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00150481  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2567  nuclease  36.23 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.190384 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3415  nuclease (SNase-like)  37.61 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1381  micrococcal nuclease-like protein  44.29 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0429202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3035  nuclease (SNase-like)  37.96 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.376528  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0580  nuclease (SNase-like)  35.45 
 
 		 168 aa  50.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  32.41 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45339  predicted protein  31.03 
 
 		 334 aa  48.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1330  nuclease  38.33 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000142245 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  35.59 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  40.59 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  24.66 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  36.27 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  39.09 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  29.52 
 
 		 228 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  29.52 
 
 		 228 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  32.41 
 
 		 408 aa  47.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  32.38 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  36.79 
 
 		 258 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  33.71 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  36.94 
 
 		 259 aa  46.2  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  29.3 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  34.95 
 
 		 205 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  29.73 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  34.95 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  35.09 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  33.71 
 
 		 237 aa  44.3  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  30.1 
 
 		 206 aa  44.7  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  31.43 
 
 		 202 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0154  nuclease  31.9 
 
 		 190 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  26.47 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  27.81 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  29.81 
 
 		 227 aa  42.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  29.41 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  33.08 
 
 		 273 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  34.26 
 
 		 201 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  35.96 
 
 		 372 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  30.3 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  32.38 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  33.01 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  31.78 
 
 		 153 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  29.63 
 
 		 225 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  30.43 
 
 		 160 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  31.85 
 
 		 171 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  31.43 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  32.04 
 
 		 214 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  35.96 
 
 		 263 aa  41.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0088  SNase-like nuclease  32.2 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0715  nuclease (SNase-like)  33.05 
 
 		 193 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.680905 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  31.9 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  24.27 
 
 		 233 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0029  nuclease (SNase-like)  30.91 
 
 		 196 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  30.1 
 
 		 227 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8127  nuclease  29.53 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  33.64 
 
 		 374 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  27.78 
 
 		 190 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  27.78 
 
 		 190 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  30.08 
 
 		 286 aa  40  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>