More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0865 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  217  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  86.61 
 
 		 115 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  81.25 
 
 		 112 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2268  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  160  7e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  160  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  66.96 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  66.96 
 
 		 112 aa  157  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  156  9e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  68.87 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  68.87 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3047  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.414736  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  64.29 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 136 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  62.5 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  62.5 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  67.92 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1710  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.619022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  151  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  151  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  62.5 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  63.39 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 136 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  61.61 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>