More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0852 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  100 
 
 
267 aa  521  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  84.27 
 
 
267 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  72.18 
 
 
270 aa  395  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  68.9 
 
 
267 aa  361  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  59.7 
 
 
263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  60.7 
 
 
256 aa  300  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  57.25 
 
 
261 aa  280  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  55.98 
 
 
256 aa  280  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  58.04 
 
 
257 aa  269  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  57.09 
 
 
257 aa  264  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  54.12 
 
 
269 aa  264  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  50.79 
 
 
256 aa  246  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  52.53 
 
 
258 aa  240  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  46.28 
 
 
258 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  42.91 
 
 
260 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  42.91 
 
 
260 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  41.2 
 
 
258 aa  202  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  42.47 
 
 
259 aa  202  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  46.12 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3703  hypothetical protein  43.51 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  43.94 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  45.98 
 
 
261 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  43.63 
 
 
263 aa  198  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  44.64 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  42.52 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  46.88 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  46.85 
 
 
255 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  41.63 
 
 
260 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  41.41 
 
 
258 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  47.3 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  44.2 
 
 
262 aa  196  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  45.69 
 
 
261 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  45.69 
 
 
261 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  45.69 
 
 
261 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  45.69 
 
 
261 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  46.85 
 
 
255 aa  195  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  43.11 
 
 
258 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  45.69 
 
 
261 aa  194  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  44.8 
 
 
265 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  46.85 
 
 
260 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.336602 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  45.98 
 
 
261 aa  193  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  45.69 
 
 
261 aa  193  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  44.49 
 
 
255 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2886  ABC-type transporter inner membrane protein  44.74 
 
 
234 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.201575  normal  0.797194 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  44.84 
 
 
255 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  44.84 
 
 
255 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  44.84 
 
 
255 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  40.23 
 
 
263 aa  192  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  41.86 
 
 
262 aa  193  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  44.84 
 
 
255 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4232  hypothetical protein  45.54 
 
 
260 aa  192  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  45.98 
 
 
261 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  45.98 
 
 
261 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  42.35 
 
 
260 aa  192  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  44.39 
 
 
255 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  44.39 
 
 
255 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  42.86 
 
 
259 aa  191  9e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1014  hypothetical protein  41.63 
 
 
260 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  46.22 
 
 
260 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  46.22 
 
 
260 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  40.61 
 
 
255 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  46.22 
 
 
260 aa  190  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  46.22 
 
 
260 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  42.15 
 
 
250 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  42.37 
 
 
260 aa  189  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  43.75 
 
 
251 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0794  hypothetical protein  40.08 
 
 
264 aa  188  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213597  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3100  hypothetical protein  42.26 
 
 
260 aa  188  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.496882 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  43.75 
 
 
251 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0980  hypothetical protein  42.15 
 
 
261 aa  188  8e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03657  hypothetical protein  41.47 
 
 
263 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  41.48 
 
 
265 aa  187  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  43.75 
 
 
251 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1172  ABC transporter permease  43.56 
 
 
261 aa  187  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  40.77 
 
 
265 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  39.92 
 
 
246 aa  187  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002410  uncharacterized ABC transporter permease component YrbE  41.98 
 
 
263 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  40.38 
 
 
265 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  40.07 
 
 
266 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  40.71 
 
 
265 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  40.7 
 
 
258 aa  186  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  40.94 
 
 
257 aa  185  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  42.41 
 
 
259 aa  185  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  39.92 
 
 
265 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  39.92 
 
 
265 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  44 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  43.56 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  44.09 
 
 
260 aa  183  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  39.16 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3649  protein of unknown function DUF140  44 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  44.44 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  41.15 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5535  hypothetical protein  42.73 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3807  protein of unknown function DUF140  43.11 
 
 
260 aa  182  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0513  protein of unknown function DUF140  41.29 
 
 
260 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0661254  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1155  protein of unknown function DUF140  41.28 
 
 
260 aa  181  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4516  toluene ABC transporter, permease protein  41.29 
 
 
260 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  0.870987 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3576  toluene ABC transporter, permease protein  41.29 
 
 
260 aa  181  8.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.884023  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3490  toluene ABC transporter, permease protein  41.29 
 
 
260 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3387  toluene ABC transporter, permease protein  41.29 
 
 
260 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>