More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0776 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0776  CheW protein  100 
 
 		 228 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.01614 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1154  putative CheW protein  64.89 
 
 		 216 aa  285  5e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.239991  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1575  CheW protein  50.42 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0210476  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1381  CheW protein  36.33 
 
 		 245 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.519881  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  31.69 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  30.66 
 
 		 139 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  30.2 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  37.5 
 
 		 164 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  34.53 
 
 		 163 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  31.39 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  31.54 
 
 		 158 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  34.31 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  33.58 
 
 		 146 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  31.39 
 
 		 136 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  29.66 
 
 		 161 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  32.85 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  27.15 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.65 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  32.14 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  31.91 
 
 		 478 aa  76.3  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  32.14 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  32.58 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  30.66 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  32.61 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.19 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  25.71 
 
 		 160 aa  74.3  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  29.87 
 
 		 152 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  29.29 
 
 		 162 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  29.87 
 
 		 152 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  32.03 
 
 		 158 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  25.52 
 
 		 167 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.77 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  28.17 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  28.06 
 
 		 145 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  29.75 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  31.25 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0206  CheW domain protein  30.77 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00161643  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.95 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  34.58 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.95 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  28.66 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.95 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  29.08 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  28.26 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  32 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  31.43 
 
 		 154 aa  72  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  26.95 
 
 		 146 aa  72  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  31.25 
 
 		 169 aa  72  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  29.8 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  28.57 
 
 		 169 aa  72  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  33.94 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  29.93 
 
 		 163 aa  71.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  28.17 
 
 		 179 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  30.43 
 
 		 192 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  31.33 
 
 		 171 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  28.37 
 
 		 159 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  30.07 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  28.3 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  30.07 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  28.06 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  29.75 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  27.54 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  34.68 
 
 		 165 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  27.52 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  26.81 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  30.82 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  30.32 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  29.29 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  33.08 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  28.08 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  28.47 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  26.97 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  26.09 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  28.08 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  28.47 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  27.03 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  26.17 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  28.08 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  27.34 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  27.46 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  27.46 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  31.11 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  26.06 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  30.28 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  26.81 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  30 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1476  CheW protein  28.99 
 
 		 185 aa  68.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.331722  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  26.17 
 
 		 174 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  28.67 
 
 		 164 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0822  putative CheW protein  27.86 
 
 		 150 aa  67.8  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  27.7 
 
 		 161 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  28.38 
 
 		 167 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  27.46 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  28.38 
 
 		 167 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  26.95 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  28.37 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  32.31 
 
 		 174 aa  67  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  32.16 
 
 		 531 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  29.29 
 
 		 165 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  28.67 
 
 		 162 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>