More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0774 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  65.68 
 
 
1031 aa  1239    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  92.75 
 
 
1089 aa  747    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1030 aa  2043    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  57.39 
 
 
954 aa  553  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
770 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
681 aa  405  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  49.24 
 
 
655 aa  388  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
598 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  46.68 
 
 
607 aa  389  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  39.3 
 
 
785 aa  387  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  38.08 
 
 
769 aa  383  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 
713 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  38.38 
 
 
770 aa  386  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  45.6 
 
 
770 aa  383  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  37.36 
 
 
769 aa  382  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  38.11 
 
 
774 aa  382  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  49.49 
 
 
677 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  48.96 
 
 
610 aa  379  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  48.22 
 
 
673 aa  378  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  48.05 
 
 
606 aa  379  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  43.83 
 
 
601 aa  379  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  37.46 
 
 
769 aa  379  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  47.7 
 
 
729 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  47.78 
 
 
783 aa  373  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  47.24 
 
 
666 aa  371  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  45.93 
 
 
927 aa  372  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  47.63 
 
 
675 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
604 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  47.56 
 
 
666 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  46.27 
 
 
660 aa  369  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  41.68 
 
 
691 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  47.15 
 
 
603 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  31.41 
 
 
801 aa  365  3e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  46.96 
 
 
558 aa  362  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  45.29 
 
 
701 aa  361  3e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  46.48 
 
 
685 aa  360  5e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 
695 aa  360  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
920 aa  359  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 
759 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  47.14 
 
 
671 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  43.88 
 
 
803 aa  358  2.9999999999999997e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  43.61 
 
 
919 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  46.11 
 
 
674 aa  357  8.999999999999999e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  44.1 
 
 
767 aa  355  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 
697 aa  355  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  46.09 
 
 
671 aa  355  2e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  42.89 
 
 
736 aa  354  4e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 
679 aa  354  5e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
696 aa  354  5e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 
747 aa  354  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  41.25 
 
 
751 aa  354  5e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  43.13 
 
 
919 aa  354  5.9999999999999994e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  42.89 
 
 
760 aa  353  7e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 
957 aa  353  7e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 
673 aa  353  7e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  43.93 
 
 
720 aa  353  1e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  43.6 
 
 
747 aa  351  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 
745 aa  350  6e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  44.42 
 
 
701 aa  349  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  46.53 
 
 
785 aa  348  4e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  41.52 
 
 
766 aa  346  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  44.78 
 
 
741 aa  345  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  36.55 
 
 
639 aa  345  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0577  putative CheA signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 
556 aa  345  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.482834  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 
741 aa  346  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  40.04 
 
 
738 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
724 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 
746 aa  344  5e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
652 aa  342  1e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 
719 aa  342  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  45.27 
 
 
746 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  45.32 
 
 
692 aa  341  4e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 
733 aa  340  9e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  47.45 
 
 
686 aa  340  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1009  chemotaxis protein CheA  44.64 
 
 
761 aa  339  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 
728 aa  339  1.9999999999999998e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  42.36 
 
 
669 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  41.19 
 
 
806 aa  339  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  44.5 
 
 
762 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  47.19 
 
 
682 aa  337  5e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  44.25 
 
 
762 aa  337  9e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2327  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.93 
 
 
862 aa  336  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 
733 aa  336  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
871 aa  336  1e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  44.22 
 
 
734 aa  335  2e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  39.37 
 
 
754 aa  335  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
685 aa  334  4e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
650 aa  335  4e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  35.5 
 
 
681 aa  334  5e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2736  CheA signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
687 aa  334  5e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  46.23 
 
 
691 aa  334  6e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
685 aa  334  6e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  43.72 
 
 
744 aa  333  8e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  32.59 
 
 
887 aa  333  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1771  CheA signal transduction histidine kinases  41.63 
 
 
727 aa  333  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  42.37 
 
 
801 aa  333  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 
732 aa  332  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  41.18 
 
 
1010 aa  332  2e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 
687 aa  332  2e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  45.85 
 
 
614 aa  332  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>