53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0765 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  44.88 
 
 		 997 aa  868    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  42.33 
 
 		 1000 aa  689    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  100 
 
 		 1100 aa  2190    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  56 
 
 		 984 aa  1110    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1039 aa  151  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  23.09 
 
 		 968 aa  139  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  23.63 
 
 		 911 aa  136  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  23.58 
 
 		 909 aa  134  9e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  26.71 
 
 		 951 aa  129  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  21.47 
 
 		 919 aa  115  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  24.9 
 
 		 960 aa  99.4  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  21.57 
 
 		 969 aa  95.5  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  21.57 
 
 		 969 aa  95.5  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  25.23 
 
 		 780 aa  81.3  0.00000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  22.22 
 
 		 781 aa  78.6  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  23.62 
 
 		 803 aa  77.8  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  22.32 
 
 		 794 aa  75.1  0.000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  22.91 
 
 		 781 aa  73.6  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  22.49 
 
 		 783 aa  72  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.94 
 
 		 957 aa  69.3  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  23.08 
 
 		 788 aa  67.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  23.08 
 
 		 788 aa  66.2  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  22.56 
 
 		 788 aa  66.6  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  31.44 
 
 		 993 aa  62  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1049 aa  61.6  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  21.17 
 
 		 786 aa  61.6  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.64 
 
 		 915 aa  60.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1042 aa  59.3  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  27.81 
 
 		 976 aa  58.2  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  26.3 
 
 		 1049 aa  57.4  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  26.17 
 
 		 962 aa  57.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  25.31 
 
 		 951 aa  57  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  22.32 
 
 		 994 aa  56.6  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  31.1 
 
 		 913 aa  55.5  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  23.3 
 
 		 991 aa  55.1  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  24.92 
 
 		 947 aa  54.3  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08480  RecB family exonuclease  24.8 
 
 		 889 aa  53.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.198348 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1048 aa  51.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.88 
 
 		 1048 aa  50.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  29.94 
 
 		 1047 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  28.48 
 
 		 1045 aa  50.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.14 
 
 		 958 aa  50.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.36 
 
 		 989 aa  50.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1049 aa  49.3  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.78 
 
 		 1048 aa  48.5  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  45.45 
 
 		 1016 aa  48.5  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  29.39 
 
 		 1047 aa  47.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1053 aa  47.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  29.17 
 
 		 1049 aa  47.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2640  hypothetical protein  28.61 
 
 		 883 aa  47.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0600209  normal  0.0102086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  27.38 
 
 		 1054 aa  45.8  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.81 
 
 		 836 aa  45.8  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  36.17 
 
 		 991 aa  45.1  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>