More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0764 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1588  ATP-dependent DNA helicase UvrD  48.27 
 
 		 1067 aa  997    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1166  UvrD/REP helicase  55.14 
 
 		 1152 aa  1194    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0764  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1161 aa  2331    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0979  UvrD/REP helicase  42.59 
 
 		 1173 aa  781    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.156033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1136  UvrD/REP helicase  27.84 
 
 		 1112 aa  157  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0229402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4180  Exodeoxyribonuclease V  24 
 
 		 1073 aa  154  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0648836 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0699  UvrD/REP helicase  25.78 
 
 		 1052 aa  152  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03180  putative helicase  21.6 
 
 		 1054 aa  143  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.927265  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0914  hypothetical protein  25 
 
 		 913 aa  140  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.230756 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0252  UvrD/REP helicase  23.79 
 
 		 1060 aa  133  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1797  Exodeoxyribonuclease V  26.21 
 
 		 1120 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00119316  normal  0.701381 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1561  UvrD/REP helicase  25.36 
 
 		 1054 aa  121  7e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04140  UvrD/REP helicase  21.3 
 
 		 1036 aa  119  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  25.1 
 
 		 1156 aa  117  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  28.06 
 
 		 1147 aa  110  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2072  UvrD/REP helicase domain-containing protein  25.29 
 
 		 1102 aa  109  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  26.86 
 
 		 1121 aa  106  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  26.29 
 
 		 1124 aa  104  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  28.78 
 
 		 1187 aa  102  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1560  UvrD/REP helicase  28.13 
 
 		 1054 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.538348  normal  0.490234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3622  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.69 
 
 		 1135 aa  99.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  21.31 
 
 		 1217 aa  97.4  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  21.31 
 
 		 1217 aa  97.4  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  25.68 
 
 		 1168 aa  96.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  24.08 
 
 		 1125 aa  94.7  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0344  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.13 
 
 		 1130 aa  94.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3578  UvrD/REP helicase  23.03 
 
 		 995 aa  94  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.41 
 
 		 1200 aa  93.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3118  UvrD/REP helicase  29.98 
 
 		 1061 aa  93.2  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674969 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2130  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.25 
 
 		 1223 aa  92.4  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1061 aa  92  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  22.64 
 
 		 1218 aa  91.7  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0324  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.13 
 
 		 1129 aa  90.9  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.904758 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  26.27 
 
 		 1230 aa  90.9  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  22.75 
 
 		 860 aa  90.5  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  26.07 
 
 		 665 aa  89  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  27.95 
 
 		 1240 aa  89  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3232  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.23 
 
 		 1240 aa  88.6  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0067022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  25.98 
 
 		 1089 aa  88.2  7e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  28.9 
 
 		 1185 aa  88.2  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  22.92 
 
 		 1121 aa  87.8  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0736  putative recombination protein RecB  28.52 
 
 		 939 aa  87.8  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  24.13 
 
 		 1162 aa  87  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0906  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.34 
 
 		 1115 aa  86.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.025647 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0910  putative recombination protein RecB  26.99 
 
 		 933 aa  86.3  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.646697  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0900  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.5 
 
 		 1115 aa  86.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0917  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.5 
 
 		 1115 aa  86.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45261  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1177 aa  86.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  24.96 
 
 		 1242 aa  85.9  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0090  putative recombination protein RecB  27.63 
 
 		 903 aa  85.5  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3814  exonuclease V subunit beta  27.33 
 
 		 1183 aa  85.5  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.0108471 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  25 
 
 		 1244 aa  85.5  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2681  double-strand break repair helicase AddA  27.83 
 
 		 1142 aa  84.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  21.9 
 
 		 1251 aa  83.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.22 
 
 		 1203 aa  83.2  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0644  UvrD/REP helicase  26.65 
 
 		 1109 aa  83.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1209  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.9 
 
 		 1097 aa  83.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686656 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1160  UvrD/REP helicase  26.62 
 
 		 1064 aa  83.2  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.737588 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2420  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.64 
 
 		 1238 aa  82.8  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415139  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0382  putative recombination protein RecB  23.84 
 
 		 915 aa  82.8  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309071  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1474  putative recombination protein RecB  24.18 
 
 		 921 aa  82.4  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000740501  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2171  Exodeoxyribonuclease V  24.41 
 
 		 1152 aa  82.8  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1654  putative recombination protein RecB  23.7 
 
 		 921 aa  82  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2967  exonuclease V subunit beta  23.84 
 
 		 1170 aa  82.4  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.483472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0178  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.69 
 
 		 796 aa  82.4  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.349073  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1169  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.53 
 
 		 1269 aa  82  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  26.82 
 
 		 1180 aa  82  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  26.1 
 
 		 1120 aa  81.6  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  26.63 
 
 		 1180 aa  81.6  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.23 
 
 		 1177 aa  81.6  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1901  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.63 
 
 		 1224 aa  81.6  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3377  double-strand break repair helicase AddA  28.27 
 
 		 1165 aa  81.3  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.291395  normal  0.767589 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  27.53 
 
 		 1180 aa  81.3  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  24.29 
 
 		 1226 aa  81.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  22.74 
 
 		 672 aa  80.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3300  double-strand break repair helicase AddA  28.01 
 
 		 1167 aa  79.7  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  27.51 
 
 		 681 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.72 
 
 		 1204 aa  79.3  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  28.75 
 
 		 1147 aa  79.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1828  putative recombination protein RecB  22.85 
 
 		 921 aa  79.3  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00117116  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03301  UvrD/REP helicase  23.43 
 
 		 809 aa  79.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.479147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1459  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.79 
 
 		 1226 aa  79.3  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  26.58 
 
 		 1123 aa  79  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4085  exonuclease V subunit beta  23.62 
 
 		 1180 aa  79  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2642  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.01 
 
 		 1229 aa  79  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1270  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.91 
 
 		 1240 aa  78.6  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02668  exonuclease V (RecBCD complex), beta subunit  24 
 
 		 1180 aa  78.2  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.501353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2279  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.99 
 
 		 1273 aa  78.2  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4565  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1273 aa  78.2  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02629  hypothetical protein  24 
 
 		 1180 aa  78.2  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0871  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24 
 
 		 1180 aa  78.2  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2966  exonuclease V subunit beta  24 
 
 		 1180 aa  78.2  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0895  exonuclease V subunit beta  24 
 
 		 1180 aa  78.2  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.861993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3042  exonuclease V subunit beta  23.44 
 
 		 1180 aa  77.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  28.83 
 
 		 1161 aa  77.4  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.14 
 
 		 773 aa  77.4  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2047  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.86 
 
 		 1273 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.680974  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  23.78 
 
 		 1217 aa  77.8  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.88 
 
 		 798 aa  77  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3140  exonuclease V subunit beta  23.89 
 
 		 1180 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>