More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0628 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0628  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 391 aa  768    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0398137 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1164  ABC transporter, permease protein  67.62 
 
 		 387 aa  482  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0988  protein of unknown function DUF214  62.44 
 
 		 388 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3263  protein of unknown function DUF214  62.69 
 
 		 388 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2405  hypothetical protein  63.31 
 
 		 387 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0262818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1459  hypothetical protein  62.95 
 
 		 388 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.789839  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1986  hypothetical protein  63.24 
 
 		 388 aa  435  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  56.41 
 
 		 388 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  58.55 
 
 		 388 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  57.55 
 
 		 388 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3709  hypothetical protein  57.44 
 
 		 388 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392463  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  57.44 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3400  ABC efflux pump, inner membrane subunit  56.92 
 
 		 388 aa  408  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.089365  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2805  hypothetical protein  56.67 
 
 		 388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.275109  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0301  hypothetical protein  56.67 
 
 		 388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157711  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0282  hypothetical protein  56.67 
 
 		 388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.548142  hitchhiker  0.0000619818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  55.64 
 
 		 388 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  55.38 
 
 		 388 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0255  hypothetical protein  55.21 
 
 		 389 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.58 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1512  hypothetical protein  40.79 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03340  ABC transporter permease  37.05 
 
 		 431 aa  219  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0251  protein of unknown function DUF214  35.67 
 
 		 440 aa  213  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0817  hypothetical protein  33.59 
 
 		 393 aa  199  7e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  33.68 
 
 		 396 aa  186  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2580  protein of unknown function DUF214  32.6 
 
 		 400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2023  hypothetical protein  29.46 
 
 		 395 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2258  protein of unknown function DUF214  32.25 
 
 		 402 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3164  protein of unknown function DUF214  27.23 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  28.22 
 
 		 371 aa  96.3  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  25.77 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  27.67 
 
 		 640 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  25.17 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  29.23 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.29 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  27.97 
 
 		 488 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  32.87 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  36 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  27.82 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  26.33 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  24.26 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  32.17 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  25.87 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  38.46 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  25.94 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  32.93 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  24.71 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  27.01 
 
 		 443 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  30.86 
 
 		 414 aa  67  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  25.89 
 
 		 642 aa  66.6  0.0000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  33.95 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  26.46 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  28.17 
 
 		 400 aa  66.2  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  24.83 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  29.37 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  26.97 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  26.79 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  35.17 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  26.92 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  26.1 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0320  hypothetical protein  34.93 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.895075  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  35.34 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  34.68 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  34.68 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3411  ABC transporter, inner membrane subunit  25 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  30.07 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  37.19 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0832  protein of unknown function DUF214  22.08 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  28.85 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  26.56 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  26.3 
 
 		 856 aa  63.9  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.71 
 
 		 664 aa  63.9  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  25.67 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  28.47 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  32 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  35.62 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1472  ABC transporter permease protein  26.07 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  38.71 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  29.75 
 
 		 842 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  26.42 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  36.52 
 
 		 642 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3560  protein of unknown function DUF214  25.19 
 
 		 405 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  29.19 
 
 		 403 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  34.48 
 
 		 454 aa  62.8  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  36.36 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2811  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.58 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0243258  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  32.37 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  31.97 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  31.06 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  32.5 
 
 		 651 aa  62.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  25.42 
 
 		 652 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  22.3 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  27.41 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0635  ABC transporter, inner membrane subunit  29.27 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000706682  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5199  putative permease of ABC transporter  29 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520248  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  32.88 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  24.38 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  35.9 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  26.64 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>