More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0620 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  100 
 
 		 212 aa  400  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  50.32 
 
 		 167 aa  141  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  45.58 
 
 		 162 aa  141  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  41.78 
 
 		 163 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  42.58 
 
 		 164 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  46.01 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  45.77 
 
 		 164 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  41.18 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  45.21 
 
 		 164 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  49.32 
 
 		 164 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  41.55 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  41.1 
 
 		 157 aa  128  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.36 
 
 		 164 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.56 
 
 		 164 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  40.26 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  45.33 
 
 		 173 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.67 
 
 		 164 aa  125  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  43.84 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  42.47 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  42.67 
 
 		 163 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  42.5 
 
 		 185 aa  118  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  41.29 
 
 		 160 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  42.5 
 
 		 185 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  45.21 
 
 		 179 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  37.58 
 
 		 171 aa  115  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  42.47 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  40.13 
 
 		 179 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  38.78 
 
 		 176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  42.68 
 
 		 194 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  42.47 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  38.82 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  43.33 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  43.33 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  36.81 
 
 		 169 aa  106  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  36.24 
 
 		 187 aa  104  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  38.36 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  38.1 
 
 		 163 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  37.67 
 
 		 185 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  33.33 
 
 		 168 aa  101  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  41.78 
 
 		 169 aa  99.8  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1529  CheW protein  41.61 
 
 		 183 aa  99  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205941 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  33.56 
 
 		 167 aa  97.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  32.65 
 
 		 165 aa  97.1  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  32.65 
 
 		 165 aa  97.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  36.67 
 
 		 164 aa  96.3  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  37.16 
 
 		 167 aa  93.6  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  35.2 
 
 		 158 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  31.97 
 
 		 168 aa  93.2  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  35.37 
 
 		 162 aa  92.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  35.57 
 
 		 185 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  38.3 
 
 		 175 aa  92.4  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  32.41 
 
 		 171 aa  92  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  34.23 
 
 		 158 aa  91.7  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  34.46 
 
 		 160 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  34.4 
 
 		 158 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  32.88 
 
 		 174 aa  90.9  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  33.55 
 
 		 159 aa  90.9  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  36.73 
 
 		 165 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  34.4 
 
 		 158 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  34.25 
 
 		 158 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  37.25 
 
 		 162 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  36.36 
 
 		 164 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  33.78 
 
 		 163 aa  90.1  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  31.72 
 
 		 169 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  30.77 
 
 		 177 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  30.77 
 
 		 171 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  30.77 
 
 		 177 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  33.33 
 
 		 165 aa  89.7  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  30.77 
 
 		 171 aa  89.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  37.25 
 
 		 157 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  34.44 
 
 		 159 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  30.77 
 
 		 171 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  29.17 
 
 		 180 aa  89.4  4e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  31.79 
 
 		 159 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  33.56 
 
 		 162 aa  89  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  31.76 
 
 		 163 aa  89  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  31.41 
 
 		 174 aa  89  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  30.77 
 
 		 171 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  34.48 
 
 		 147 aa  88.6  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  31.29 
 
 		 164 aa  88.6  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  35.57 
 
 		 163 aa  88.6  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  34.69 
 
 		 194 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  34.13 
 
 		 194 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  34.13 
 
 		 194 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  32.64 
 
 		 262 aa  88.2  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  30.61 
 
 		 165 aa  88.2  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  30.61 
 
 		 165 aa  88.2  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  33.78 
 
 		 164 aa  88.2  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  31.13 
 
 		 159 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.13 
 
 		 159 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  30.61 
 
 		 175 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  30.61 
 
 		 175 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  30.61 
 
 		 175 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  34.69 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  31.13 
 
 		 159 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  31.13 
 
 		 159 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  30.61 
 
 		 175 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  30.61 
 
 		 175 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  30.61 
 
 		 175 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  29.8 
 
 		 162 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>