More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0575 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0575  PhoH family protein  100 
 
 
331 aa  669    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0928819 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1283  PhoH family protein  79.09 
 
 
333 aa  528  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.395155  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1653  phoH family protein  76.67 
 
 
332 aa  518  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1733  PhoH family protein  63.92 
 
 
326 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1558  PhoH family protein  63.27 
 
 
332 aa  411  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.400448  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0242  PhoH family protein  58.93 
 
 
344 aa  392  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2163  PhoH family protein  55.69 
 
 
344 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0763863  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  57.37 
 
 
339 aa  352  5e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2303  PhoH family protein  57.46 
 
 
361 aa  348  7e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76142  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2721  PhoH-like protein  56.47 
 
 
354 aa  345  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2713  PhoH family protein  55.84 
 
 
356 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2813  PhoH family protein  55.62 
 
 
359 aa  342  7e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2905  PhoH family protein  55.62 
 
 
359 aa  342  7e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.21329  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  53.82 
 
 
331 aa  333  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0255  PhoH family protein  52.88 
 
 
328 aa  329  4e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  50.79 
 
 
328 aa  322  6e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12600  PhoH family protein  50 
 
 
320 aa  317  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0593  PhoH-like protein  52.08 
 
 
333 aa  312  4.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.318782  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  51.94 
 
 
359 aa  311  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  49.39 
 
 
319 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1415  PhoH family protein  50.32 
 
 
332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2484  PhoH family protein  50.46 
 
 
320 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  50.79 
 
 
319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  50.79 
 
 
319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  50.79 
 
 
319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  50.79 
 
 
319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  50.79 
 
 
319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  50.79 
 
 
319 aa  305  7e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  50.47 
 
 
319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  50.47 
 
 
319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  48.77 
 
 
319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  50.47 
 
 
319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  68.54 
 
 
323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  48.77 
 
 
333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  49.23 
 
 
320 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  66.51 
 
 
329 aa  297  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1198  PhoH family protein  47.37 
 
 
348 aa  296  4e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331138  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4354  PhoH-like protein  49.67 
 
 
317 aa  295  5e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000244605  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1145  PhoH family protein  48.44 
 
 
317 aa  295  5e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0574  PhoH family protein  47.53 
 
 
322 aa  295  6e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184118  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1272  PhoH-like protein protein  50.15 
 
 
352 aa  295  9e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31699  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4256  PhoH family protein  47.84 
 
 
323 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0579  PhoH family protein  48.09 
 
 
318 aa  294  1e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.818814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2769  PhoH family protein  48.76 
 
 
320 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.405209 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  49.1 
 
 
333 aa  293  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0329  PhoH family protein  49.02 
 
 
316 aa  293  3e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0844  phosphate starvation-inducible protein PhoH ATPase  50.48 
 
 
381 aa  292  6e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  50.78 
 
 
342 aa  292  7e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2849  PhoH family protein  51.74 
 
 
338 aa  291  8e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.489478  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1024  PhoH family protein  51.63 
 
 
320 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2538  PhoH-like protein  46.58 
 
 
317 aa  290  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00160717  hitchhiker  0.00935106 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0735  PhoH family protein  47.04 
 
 
335 aa  289  4e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.855144  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1985  PhoH family protein  50.93 
 
 
323 aa  288  9e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.460583  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0474  PhoH-like protein  49.23 
 
 
322 aa  288  9e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3070  PhoH family protein  46.98 
 
 
324 aa  288  9e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000842405 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0986  phosphate starvation-inducible protein PhoH, ATPase  47.56 
 
 
328 aa  288  9e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00869262  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4346  PhoH-like protein  50 
 
 
340 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1285  PhoH family protein  47.73 
 
 
322 aa  288  1e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000129158  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  49.53 
 
 
340 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1401  PhoH family protein  47.73 
 
 
322 aa  287  1e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.100499  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  49.21 
 
 
340 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  50.32 
 
 
348 aa  287  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0789  PhoH family protein  50.49 
 
 
333 aa  287  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0567134 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3832  PhoH family protein  51.44 
 
 
351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4805  PhoH-like protein  50 
 
 
340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3159  PhoH family protein  50.16 
 
 
343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00307849  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  47.77 
 
 
315 aa  286  4e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1272  PhoH family protein  46.08 
 
 
325 aa  286  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3247  PhoH family protein  50.16 
 
 
348 aa  286  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12394  phoH-like protein phoH1 (phosphate starvation-inducible protein psiH)  50.16 
 
 
352 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1566  PhoH-like protein  47.92 
 
 
322 aa  285  5.999999999999999e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.359583  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2112  PhoH family protein  49.51 
 
 
354 aa  285  9e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0134  PhoH family protein  49.69 
 
 
319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4280  PhoH family protein  47.2 
 
 
323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  50.78 
 
 
327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0749  PhoH family protein  46.52 
 
 
327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019197 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1775  phosphate starvation-induced protein  47.42 
 
 
321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.901151  normal  0.888471 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0597  PhoH-like protein  46.52 
 
 
340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1267  PhoH-like protein  50.16 
 
 
345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3301  lipoate synthase  58.8 
 
 
364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09060  PhoH-like protein  49.53 
 
 
336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706372  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1658  PhoH family protein  47.22 
 
 
376 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  48.95 
 
 
360 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  48.75 
 
 
332 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3456  PhoH-like protein  49.84 
 
 
319 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.745001  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3467  PhoH family protein  49.84 
 
 
357 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  49.52 
 
 
332 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3519  PhoH family protein  49.84 
 
 
357 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0995  PhoH-like protein  48.53 
 
 
356 aa  282  6.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0457768  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2038  PhoH family protein  45.45 
 
 
319 aa  281  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2064  PhoH family protein  45.45 
 
 
319 aa  281  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  50.62 
 
 
353 aa  281  8.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  48.09 
 
 
315 aa  281  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  48.09 
 
 
315 aa  281  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2762  PhoH family protein  49.19 
 
 
361 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0978111  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3573  phoH family protein  46.61 
 
 
368 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189544  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  49.21 
 
 
332 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  49.4 
 
 
351 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000833124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13580  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  51.14 
 
 
349 aa  280  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.340051 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  47.56 
 
 
348 aa  280  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>