More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0550 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 409 aa  817    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1333  diaminopimelate aminotransferase  67.73 
 
 		 407 aa  571  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  62.09 
 
 		 410 aa  511  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  53.81 
 
 		 406 aa  448  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  52.71 
 
 		 409 aa  435  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  52.99 
 
 		 413 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  46.29 
 
 		 411 aa  377  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  41.69 
 
 		 411 aa  359  6e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  44.44 
 
 		 413 aa  352  8.999999999999999e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  41.03 
 
 		 407 aa  348  7e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  38.92 
 
 		 407 aa  314  1.9999999999999998e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  40.35 
 
 		 396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  40.9 
 
 		 396 aa  311  2e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.34 
 
 		 404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  41.96 
 
 		 411 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  41.06 
 
 		 421 aa  298  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  34.71 
 
 		 415 aa  278  1e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  34.95 
 
 		 415 aa  270  4e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  34.79 
 
 		 415 aa  270  4e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  34.36 
 
 		 423 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  35.37 
 
 		 415 aa  267  2e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.94 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.8 
 
 		 395 aa  103  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.3 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  27.82 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  29.37 
 
 		 404 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  29.4 
 
 		 416 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.74 
 
 		 423 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  28.57 
 
 		 419 aa  93.6  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.74 
 
 		 439 aa  93.6  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.55 
 
 		 399 aa  92.8  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  25.35 
 
 		 409 aa  91.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  30.3 
 
 		 586 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  29.14 
 
 		 434 aa  90.5  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.07 
 
 		 411 aa  90.1  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  28.29 
 
 		 406 aa  90.1  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  30.3 
 
 		 389 aa  90.1  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  30.3 
 
 		 389 aa  90.1  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  28.03 
 
 		 421 aa  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  24.71 
 
 		 422 aa  89.7  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  30.3 
 
 		 405 aa  89.7  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  30.3 
 
 		 405 aa  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  30.3 
 
 		 405 aa  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  30.3 
 
 		 405 aa  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  28.29 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  30.04 
 
 		 419 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  26.75 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  27.34 
 
 		 442 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  26.75 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  30 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  28.05 
 
 		 451 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  26.75 
 
 		 444 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  26.29 
 
 		 462 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  32.42 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  27.34 
 
 		 411 aa  87  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  26.81 
 
 		 440 aa  86.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.35 
 
 		 395 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  26.99 
 
 		 442 aa  86.3  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  28.05 
 
 		 443 aa  86.3  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.4 
 
 		 410 aa  86.3  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.94 
 
 		 423 aa  86.3  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  27.59 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  26.54 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  23.76 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  28.96 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  24.71 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  26.68 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  26.41 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  26.97 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  27.64 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  27.46 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  30.49 
 
 		 448 aa  84  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  27.2 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.64 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  32.47 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1610  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.09 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  26.91 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  27.46 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  27.46 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  31.95 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.62 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  23.41 
 
 		 422 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  26.6 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1278  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.5 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.645839 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  21.83 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  31.82 
 
 		 430 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.12 
 
 		 409 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  23.18 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  23.18 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  27.58 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  23.18 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  27.16 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.49 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  24.07 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.14 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  25.28 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  27.32 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  23.19 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  22.27 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.7 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>