130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0539 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0539  cytochrome c class I  100 
 
 		 108 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1821  cytochrome c-553  58.97 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000401467  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  59.77 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0538  cytochrome c class I  51.85 
 
 		 102 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0164881 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1543  cytochrome c-553  45.92 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.31178  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0335  cytochrome c, class I  44.33 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0741  cytochrome c, class I  39.33 
 
 		 179 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1817  cytochrome c class I  43.62 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0578  cytochrome c-553  44.78 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00244376  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0127  cytochrome c class I  35.42 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  39.09 
 
 		 211 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0739  putative cytochrome c  33.33 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  34.33 
 
 		 205 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  34.33 
 
 		 205 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 219 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  37.66 
 
 		 192 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  38.89 
 
 		 219 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0084  glutamate racemase 2  31.48 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000295238  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 206 aa  50.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  36.54 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  33.9 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  34.48 
 
 		 287 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  34.72 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0241  cytochrome c-553 (cytochrome c553) (low-potential cytochromec)  29.63 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1289  cytochrome c553  34.23 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1170  cytochrome c553  34.23 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1109  conserved hypothetical protein, putative cytochrome c family protein  29.52 
 
 		 145 aa  48.1  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.594522  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 224 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  35.14 
 
 		 216 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1460  hypothetical protein  38.16 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  35.14 
 
 		 221 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  35.58 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  40 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  36.23 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 266 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0575  cytochrome c553  33.33 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.673779  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  38.64 
 
 		 205 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  32.86 
 
 		 213 aa  47  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  35.71 
 
 		 318 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2802  cytochrome c, class I  36.25 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190296  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  43.06 
 
 		 262 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1404  cytochrome c, class I  37.66 
 
 		 263 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  30.88 
 
 		 229 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1616  cytochrome c class I  36.49 
 
 		 219 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.016754 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  35.62 
 
 		 221 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 221 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  37.33 
 
 		 208 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  41.67 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  35.71 
 
 		 271 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  33.82 
 
 		 216 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  38.03 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  31.43 
 
 		 206 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  35.8 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0123  cytochrome c class I  37.35 
 
 		 418 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.266844  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  38.57 
 
 		 212 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  29.52 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 238 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  37.04 
 
 		 220 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  40.28 
 
 		 217 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2099  cytochrome c class I  33.78 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149898 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  35.14 
 
 		 214 aa  43.5  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2134  cytochrome c family protein  33.67 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  30.61 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1164  cytochrome c family protein  34.25 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  37.84 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  40.28 
 
 		 262 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  31.65 
 
 		 284 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  32.65 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1039  cytochrome c family protein  34.25 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.49098  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  30.61 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  40.28 
 
 		 262 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  40.28 
 
 		 262 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  30.61 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0768  cytochrome c family protein  34.25 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0274597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  30.61 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0934  cytochrome c class I  37.33 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  33.33 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  38.89 
 
 		 217 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3313  putative cytochrome C precursor-related protein  31.51 
 
 		 127 aa  42  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477709  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  40.54 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  38.03 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  32.65 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0908  cytochrome c, class I  36.71 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.413276  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  36.11 
 
 		 105 aa  42  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1108  hypothetical protein  31.18 
 
 		 248 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  34.72 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  40.58 
 
 		 222 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2138  cytochrome c family protein  33.67 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.203882 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  36.11 
 
 		 105 aa  42  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  30.7 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  36.11 
 
 		 105 aa  42  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2244  cytochrome c class I  33.67 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  32.47 
 
 		 127 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  26.74 
 
 		 205 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0474  cytochrome c family protein  34.34 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  34.34 
 
 		 207 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  34.34 
 
 		 207 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  33.8 
 
 		 206 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>