More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0536 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0219  cytochrome c oxidase, subunit I  72.06 
 
 		 541 aa  758    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1345  cytochrome-c oxidase  83.18 
 
 		 541 aa  879    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0187504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2526  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit I  70.53 
 
 		 543 aa  730    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000123308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  72.78 
 
 		 541 aa  776    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1823  cytochrome-c oxidase  82.07 
 
 		 543 aa  838    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200006  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  77.36 
 
 		 539 aa  830    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  70.08 
 
 		 539 aa  776    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  69.19 
 
 		 542 aa  710    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140919 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0536  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 		 541 aa  1082    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.091525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  58.7 
 
 		 542 aa  631  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0230  cytochrome c oxidase, subunit I  59.65 
 
 		 565 aa  611  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123434  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  56.46 
 
 		 548 aa  592  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  57.14 
 
 		 564 aa  591  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  56.24 
 
 		 552 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  54.92 
 
 		 556 aa  582  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  54.25 
 
 		 544 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5947  cytochrome c oxidase, subunit I  54.28 
 
 		 554 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  51.76 
 
 		 535 aa  555  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  53.18 
 
 		 563 aa  552  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  53.5 
 
 		 563 aa  550  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4436  cytochrome-c oxidase  52.9 
 
 		 545 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0196071  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0167  cytochrome c oxidase, subunit I  53.18 
 
 		 563 aa  551  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0110936 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0849  cytochrome c oxidase subunit I type  52.16 
 
 		 555 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0827  cytochrome c oxidase, subunit I  51.52 
 
 		 540 aa  540  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.541437  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  50.68 
 
 		 558 aa  532  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2274  cytochrome-c oxidase  52.56 
 
 		 554 aa  528  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.413145  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4179  cytochrome c oxidase, subunit I  53.04 
 
 		 557 aa  529  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.263418  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6230  cytochrome c oxidase, subunit I  51.74 
 
 		 565 aa  525  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33684  normal  0.0324677 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0804  cytochrome-c oxidase  51.61 
 
 		 554 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0852  cytochrome c oxidase, subunit I  51.04 
 
 		 554 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6885  cytochrome c oxidase, subunit I  52.14 
 
 		 558 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0856  cytochrome c oxidase, subunit I  51.04 
 
 		 554 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5816  cytochrome c oxidase, subunit I  51.75 
 
 		 558 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099341  hitchhiker  0.00453601 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1677  cytochrome c oxidase, subunit I  52.56 
 
 		 555 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1601  cytochrome c oxidase, subunit I  52.2 
 
 		 555 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171665  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2705  Cytochrome-c oxidase  52.14 
 
 		 528 aa  499  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  46.41 
 
 		 587 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  44.68 
 
 		 615 aa  473  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  45.91 
 
 		 541 aa  460  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  46 
 
 		 560 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  45.78 
 
 		 575 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  45.19 
 
 		 555 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  45.19 
 
 		 555 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  45.58 
 
 		 564 aa  454  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  43.52 
 
 		 541 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  45.07 
 
 		 661 aa  452  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  43.35 
 
 		 530 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  43.22 
 
 		 548 aa  448  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  43.15 
 
 		 539 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3557  cytochrome-c oxidase  44.88 
 
 		 569 aa  449  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0159482  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  43.71 
 
 		 541 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  43.37 
 
 		 534 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  42.83 
 
 		 546 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  43.52 
 
 		 541 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  43.02 
 
 		 546 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  44.9 
 
 		 542 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  43.66 
 
 		 590 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  43.4 
 
 		 552 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  43.55 
 
 		 556 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  43.98 
 
 		 555 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  42.05 
 
 		 546 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  42.8 
 
 		 543 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  42.13 
 
 		 529 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0238  cytochrome c oxidase, subunit I  43.02 
 
 		 534 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  42.38 
 
 		 547 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0219  cytochrome c oxidase, subunit I  43.02 
 
 		 534 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  44.26 
 
 		 542 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  43.93 
 
 		 641 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  42.06 
 
 		 558 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  42.53 
 
 		 527 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  43.22 
 
 		 530 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  42.83 
 
 		 527 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0262  cytochrome c oxidase subunit I  43.58 
 
 		 536 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  41.67 
 
 		 540 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  42.72 
 
 		 532 aa  435  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  43.03 
 
 		 530 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  42.24 
 
 		 529 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  41.51 
 
 		 535 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  41.89 
 
 		 530 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  41.51 
 
 		 535 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  41.51 
 
 		 535 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1675  cytochrome c oxidase, subunit I  42.28 
 
 		 556 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  41.63 
 
 		 531 aa  433  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  41.3 
 
 		 526 aa  435  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3819  cytochrome c oxidase, subunit I  43.25 
 
 		 544 aa  433  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.247666 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  44.01 
 
 		 559 aa  434  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  42.44 
 
 		 530 aa  435  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0184  cytochrome-c oxidase  42.72 
 
 		 526 aa  432  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  41.51 
 
 		 535 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  42.04 
 
 		 529 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  42.04 
 
 		 529 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  42.44 
 
 		 536 aa  432  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  42.88 
 
 		 516 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  41.51 
 
 		 535 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  42.91 
 
 		 543 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2859  cytochrome c oxidase, subunit I  42.52 
 
 		 544 aa  434  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.605233  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  41.54 
 
 		 543 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  42.04 
 
 		 529 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  41.78 
 
 		 531 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  43.35 
 
 		 641 aa  435  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0739643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>