More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0532 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0532  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 346 aa  654    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249862 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1349  UbiA prenyltransferase  41.76 
 
 		 287 aa  202  6e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1827  protoheme IX farnesyltransferase, putative  39.29 
 
 		 282 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000128435  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0253  UbiA prenyltransferase  40 
 
 		 271 aa  136  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0707527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0223  protoheme IX farnesyl transferase, putative  42.51 
 
 		 270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0046  UbiA prenyltransferase  40.22 
 
 		 272 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000129053 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1537  UbiA prenyltransferase  36.17 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.626554  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2955  protoheme IX farnesyltransferase  34.39 
 
 		 326 aa  110  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0047  UbiA prenyltransferase  42.22 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2530  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  32.6 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0521  protoheme IX farnesyltransferase  31.67 
 
 		 300 aa  96.3  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1658  protoheme IX farnesyltransferase  29.15 
 
 		 315 aa  94.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  32.14 
 
 		 298 aa  90.9  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0297  protoheme IX farnesyltransferase  31.15 
 
 		 300 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116054 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3468  protoheme IX farnesyltransferase  31.84 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87130  predicted protein  33.33 
 
 		 363 aa  87.8  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000907307  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0946  protoheme IX farnesyltransferase  36.16 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.660231 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  30.32 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01175  cytochrome c oxidase assembly factor (CtaA) + protoheme IXfarnesyltransferase (CtaB)  30.96 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2204  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  27.78 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000348808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  35.96 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3771  protoheme IX farnesyltransferase  24.44 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.953397  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  31.11 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  32 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  28.32 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3857  protoheme IX farnesyltransferase  24.22 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00164429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3688  protoheme IX farnesyltransferase  24.22 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.583143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3705  protoheme IX farnesyltransferase  24.22 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000950979  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4155  protoheme IX farnesyltransferase  24.22 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0950  protoheme IX farnesyltransferase  33.98 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0901  protoheme IX farnesyltransferase  34.45 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0391219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3960  protoheme IX farnesyltransferase  24.22 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3992  protoheme IX farnesyltransferase  24.44 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4047  protoheme IX farnesyltransferase  24.44 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  32.56 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4063  protoheme IX farnesyltransferase  24.44 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  33.94 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0952  protoheme IX farnesyltransferase  34.45 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1192  protoheme IX farnesyltransferase  24.44 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  33.01 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  33.49 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1787  protoheme IX farnesyltransferase  29.62 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2647  protoheme IX farnesyltransferase  25.69 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1429  protoheme IX farnesyltransferase  30.27 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0844546  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2075  protoheme IX farnesyltransferase  32.61 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  30.31 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  29.41 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  33.87 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  33.87 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  29.14 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  30.73 
 
 		 535 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  36 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  31.73 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  29.17 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0918  protoheme IX farnesyltransferase  29.67 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5673  protoheme IX farnesyltransferase  26.81 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  33.87 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  30.81 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  30.23 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  30.3 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  30.3 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  32.09 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  32.39 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  30.58 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  31.75 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  31.75 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  29.53 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  31.06 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  32.67 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  30.92 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  30.74 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  33.79 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  32.8 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  30.31 
 
 		 622 aa  70.5  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  31.75 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  31.75 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  31.49 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  33.79 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  29.55 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03908  protoheme IX farnesyltransferase  28.64 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  29.55 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  32.04 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  30.41 
 
 		 443 aa  69.7  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  33.14 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  27.78 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  31.12 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0270  protoheme IX farnesyltransferase  25.6 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  29.55 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  31.35 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  28.57 
 
 		 534 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  34.81 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  31.37 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0335  protoheme IX farnesyltransferase  29.97 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0243688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  30.35 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  31.35 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0480  protoheme IX farnesyltransferase  29.39 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0953207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1086  protoheme IX farnesyltransferase  29.58 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000120352  hitchhiker  0.00000422281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  31.22 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0478  protoheme IX farnesyltransferase  29.39 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0633595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>