More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0523 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0523  magnesium transporter  100 
 
 		 467 aa  935    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461011 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1354  magnesium transporter  76.79 
 
 		 456 aa  652    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0828283  normal  0.438937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  73.43 
 
 		 460 aa  624  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  69.43 
 
 		 542 aa  595  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  62.44 
 
 		 444 aa  509  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  34.88 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  34.5 
 
 		 445 aa  280  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  34.95 
 
 		 482 aa  271  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  36.99 
 
 		 450 aa  270  5e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0725  magnesium transporter  36.21 
 
 		 484 aa  266  4e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  36.57 
 
 		 449 aa  262  8.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  33.89 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  33.89 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  37.74 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  35.41 
 
 		 461 aa  250  3e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  37.32 
 
 		 481 aa  251  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  33.02 
 
 		 442 aa  248  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  36.26 
 
 		 471 aa  247  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  33.17 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  35.32 
 
 		 473 aa  239  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  35.42 
 
 		 479 aa  238  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  34.13 
 
 		 454 aa  237  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  36.93 
 
 		 473 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  33.49 
 
 		 454 aa  233  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  33.41 
 
 		 454 aa  233  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  33.01 
 
 		 454 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  33.49 
 
 		 454 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  32.77 
 
 		 454 aa  232  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  33.01 
 
 		 454 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  33.01 
 
 		 454 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  33.41 
 
 		 454 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  33.01 
 
 		 454 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  32.69 
 
 		 454 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  32.38 
 
 		 480 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  33.25 
 
 		 454 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  33.25 
 
 		 454 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  34.05 
 
 		 455 aa  229  7e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  32.38 
 
 		 480 aa  229  8e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  34.84 
 
 		 462 aa  229  9e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  32.62 
 
 		 480 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  32.14 
 
 		 480 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  32.62 
 
 		 480 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  32.78 
 
 		 450 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  37.8 
 
 		 470 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  33.81 
 
 		 465 aa  227  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  32.38 
 
 		 480 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  32.86 
 
 		 480 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  33.26 
 
 		 469 aa  226  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  31.67 
 
 		 480 aa  225  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  34.29 
 
 		 453 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  33.65 
 
 		 469 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  33.65 
 
 		 469 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  33.41 
 
 		 468 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  32.25 
 
 		 463 aa  224  4e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  33.41 
 
 		 468 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  31.75 
 
 		 482 aa  223  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  31.75 
 
 		 482 aa  223  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  32.64 
 
 		 459 aa  222  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  32.61 
 
 		 471 aa  222  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  32.64 
 
 		 444 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  33.41 
 
 		 468 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  31.97 
 
 		 452 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  34.16 
 
 		 463 aa  222  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  32.22 
 
 		 485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  33.41 
 
 		 452 aa  221  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1855  magnesium transporter  32.21 
 
 		 450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647183  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  35.39 
 
 		 471 aa  220  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  32.78 
 
 		 462 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  35.1 
 
 		 471 aa  219  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0681  transcriptional regulator  34.32 
 
 		 454 aa  219  7e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  34.38 
 
 		 471 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  32.78 
 
 		 462 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  31.92 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  31.58 
 
 		 491 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  34.14 
 
 		 462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  31.9 
 
 		 480 aa  217  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  31.58 
 
 		 491 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  31.58 
 
 		 491 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  31.82 
 
 		 478 aa  217  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0134  magnesium transporter  31.89 
 
 		 450 aa  216  8e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.149732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  35.73 
 
 		 472 aa  216  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  32.18 
 
 		 457 aa  216  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  32.02 
 
 		 476 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  30.98 
 
 		 446 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  32.79 
 
 		 459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  32.69 
 
 		 453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  32.46 
 
 		 463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  32.61 
 
 		 470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  34.44 
 
 		 453 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3159  magnesium transporter  36.74 
 
 		 489 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  33.1 
 
 		 481 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  30.46 
 
 		 480 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  31.6 
 
 		 447 aa  213  7e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  33.41 
 
 		 479 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  30.86 
 
 		 477 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  33.33 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  31.26 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  37.91 
 
 		 473 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  33.48 
 
 		 461 aa  211  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>