More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0496 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1897  MutS2 family protein  47.64 
 
 		 767 aa  681    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.557227  normal  0.0324553 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0496  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 817 aa  1634    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00013691 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1087  Smr protein/MutS2  51.95 
 
 		 817 aa  751    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1368  Smr protein/MutS2  64.38 
 
 		 771 aa  1002    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2054  DNA mismatch repair protein MutS-like  59.54 
 
 		 771 aa  929    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2459  Smr protein/MutS2  47.8 
 
 		 765 aa  708    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  31.26 
 
 		 789 aa  352  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.67 
 
 		 784 aa  344  4e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  28.95 
 
 		 791 aa  341  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  30.43 
 
 		 800 aa  338  2.9999999999999997e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.86 
 
 		 786 aa  336  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  30.01 
 
 		 791 aa  332  2e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  30.67 
 
 		 785 aa  331  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  29.35 
 
 		 793 aa  331  4e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  32.66 
 
 		 784 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1568  MutS2 family protein  27.68 
 
 		 763 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  31.24 
 
 		 792 aa  328  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  29.09 
 
 		 792 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  30.74 
 
 		 782 aa  326  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  33.49 
 
 		 788 aa  326  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  31.29 
 
 		 786 aa  323  6e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.15 
 
 		 786 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.14 
 
 		 791 aa  321  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.99 
 
 		 786 aa  321  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.11 
 
 		 786 aa  320  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.03 
 
 		 786 aa  320  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  27.08 
 
 		 796 aa  320  7.999999999999999e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.11 
 
 		 786 aa  319  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.99 
 
 		 786 aa  319  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.11 
 
 		 786 aa  317  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.06 
 
 		 786 aa  318  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.11 
 
 		 786 aa  317  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  30.07 
 
 		 785 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  32.37 
 
 		 775 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.59 
 
 		 786 aa  314  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.91 
 
 		 786 aa  314  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  28.05 
 
 		 783 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.74 
 
 		 786 aa  313  6.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  28.23 
 
 		 778 aa  313  7.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.95 
 
 		 782 aa  312  2e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  28.54 
 
 		 783 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.7 
 
 		 782 aa  311  4e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  26.95 
 
 		 780 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  27.79 
 
 		 779 aa  308  3e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1152  MutS2 family protein  27.13 
 
 		 757 aa  308  3e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  30.87 
 
 		 785 aa  308  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  28.79 
 
 		 796 aa  307  5.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  30.58 
 
 		 801 aa  306  7e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  26.31 
 
 		 787 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  31.95 
 
 		 776 aa  303  6.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  30.35 
 
 		 804 aa  303  8.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  30.82 
 
 		 804 aa  301  3e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  26.21 
 
 		 779 aa  301  4e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  26.42 
 
 		 803 aa  300  8e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  27.92 
 
 		 781 aa  299  2e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1450  MutS2 family protein  27.52 
 
 		 818 aa  297  5e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  27.96 
 
 		 782 aa  296  8e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  27.96 
 
 		 782 aa  296  8e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  28.28 
 
 		 776 aa  296  1e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  30.74 
 
 		 806 aa  292  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  27.38 
 
 		 783 aa  291  4e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  28.34 
 
 		 788 aa  289  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  26.8 
 
 		 791 aa  284  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.39 
 
 		 798 aa  282  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  29.13 
 
 		 794 aa  281  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  28.47 
 
 		 795 aa  278  3e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  29.88 
 
 		 828 aa  278  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1920  MutS2 family protein  26.36 
 
 		 760 aa  278  4e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.380002  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  31.36 
 
 		 812 aa  270  5.9999999999999995e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2225  Smr protein/MutS2  27.96 
 
 		 793 aa  270  7e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  29.82 
 
 		 824 aa  270  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4901  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.46 
 
 		 803 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0668  Smr protein/MutS2  26.87 
 
 		 794 aa  265  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.529959  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3820  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  27.36 
 
 		 830 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  29.37 
 
 		 820 aa  263  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3771  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  27.25 
 
 		 830 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  28.1 
 
 		 757 aa  260  9e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  28.1 
 
 		 757 aa  259  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  27.92 
 
 		 793 aa  259  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.24 
 
 		 792 aa  258  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0699  DNA mismatch repair protein MutS-like  27.86 
 
 		 793 aa  256  9e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  29.37 
 
 		 826 aa  254  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  30.02 
 
 		 789 aa  253  8.000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  29.27 
 
 		 780 aa  252  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0098  MutS2 protein  25.8 
 
 		 780 aa  252  2e-65  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  28.33 
 
 		 797 aa  251  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  24.94 
 
 		 792 aa  251  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1732  Smr protein/MutS2  26.81 
 
 		 796 aa  251  5e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  27.76 
 
 		 840 aa  249  1e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3301  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  27.34 
 
 		 857 aa  248  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0896287  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  28.57 
 
 		 750 aa  247  6.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2338  MutS2 family protein  30.83 
 
 		 774 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1972  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.83 
 
 		 774 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.656834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1457  Smr protein/MutS2  30.82 
 
 		 805 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  27.81 
 
 		 805 aa  235  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1999  MutS2 family protein  28.27 
 
 		 825 aa  234  6e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  27.73 
 
 		 802 aa  234  7.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0611  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.26 
 
 		 796 aa  226  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.651644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2031  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.56 
 
 		 723 aa  220  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02371  DNA mismatch repair protein MutS family protein  25.93 
 
 		 803 aa  217  7e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>