246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0485 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
185 aa  367  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.86 
 
 
182 aa  288  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2124  ATP-dependent protease peptidase subunit  78.77 
 
 
180 aa  284  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1556  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.39 
 
 
181 aa  281  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.910696  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1449  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.75 
 
 
177 aa  247  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.02 
 
 
176 aa  245  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  64 
 
 
176 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 
176 aa  239  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0555  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.14 
 
 
181 aa  234  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1338  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.77 
 
 
181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00663055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1313  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.77 
 
 
181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.71 
 
 
181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.3 
 
 
194 aa  232  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1029  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.71 
 
 
174 aa  231  6e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000258699  unclonable  0.0000000048858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.56 
 
 
181 aa  230  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  64 
 
 
178 aa  229  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.67 
 
 
182 aa  229  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  65 
 
 
181 aa  229  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0819  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.2 
 
 
180 aa  228  3e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2411  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.97 
 
 
177 aa  228  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0141789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.15 
 
 
180 aa  228  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1315  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.36 
 
 
180 aa  228  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  unclonable  7.14384e-26 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.11 
 
 
182 aa  228  4e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.22 
 
 
180 aa  227  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3571  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.22 
 
 
180 aa  227  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3589  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.22 
 
 
180 aa  227  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000154758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3968  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.22 
 
 
180 aa  227  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3842  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.22 
 
 
180 aa  227  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.01545e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3928  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.22 
 
 
180 aa  227  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00131744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1997  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.07 
 
 
180 aa  227  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.8 
 
 
180 aa  227  8e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3872  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.8 
 
 
180 aa  226  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0375524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3877  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.8 
 
 
180 aa  226  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.56 
 
 
181 aa  226  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2482  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.58 
 
 
180 aa  226  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.56 
 
 
193 aa  226  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.64 
 
 
178 aa  224  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.36 
 
 
183 aa  224  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  64 
 
 
184 aa  224  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.36 
 
 
179 aa  224  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.5 
 
 
177 aa  224  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.5 
 
 
178 aa  223  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1384  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.54 
 
 
181 aa  223  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000068782  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.64 
 
 
186 aa  222  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 
176 aa  221  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0782  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.95 
 
 
182 aa  221  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.64 
 
 
196 aa  221  4e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.93 
 
 
188 aa  221  4e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.16 
 
 
184 aa  220  8e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1384  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.54 
 
 
181 aa  220  9e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.36 
 
 
187 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4376  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.05 
 
 
183 aa  219  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.07 
 
 
186 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.58 
 
 
184 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.86 
 
 
176 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.16 
 
 
190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0214  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 
204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 
181 aa  218  5e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1261  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.64 
 
 
193 aa  217  7e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.01 
 
 
186 aa  216  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.8 
 
 
188 aa  216  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0576  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.71 
 
 
177 aa  216  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0413434  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1594  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.16 
 
 
188 aa  216  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.403262  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1699  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.43 
 
 
176 aa  216  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000408331  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 
176 aa  216  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.01 
 
 
187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.05 
 
 
172 aa  214  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.67 
 
 
206 aa  214  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  57.39 
 
 
180 aa  214  7e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0930  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.96 
 
 
182 aa  214  8e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.74 
 
 
182 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0603  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.28 
 
 
177 aa  213  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124989  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.09 
 
 
179 aa  213  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_002978  WD1189  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.95 
 
 
184 aa  213  1.9999999999999998e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.353132  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0400  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 
176 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000263629  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 
176 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00178551  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0310  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.58 
 
 
189 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.02 
 
 
182 aa  212  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.63 
 
 
185 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.12 
 
 
174 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.76 
 
 
183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.47 
 
 
174 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3389  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.74 
 
 
185 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0397838 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0804  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.28 
 
 
189 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.169738  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.47 
 
 
174 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1030  20S proteasome A and B subunits  57.31 
 
 
181 aa  210  7.999999999999999e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00131886  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.49 
 
 
189 aa  210  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3082  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.37 
 
 
199 aa  209  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.47 
 
 
183 aa  209  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3254  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.8 
 
 
178 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0386  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.8 
 
 
178 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0165  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 
214 aa  209  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183873  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 
179 aa  209  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5054  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.88 
 
 
187 aa  209  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2916  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.8 
 
 
178 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0771725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2173  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.8 
 
 
178 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0191  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.8 
 
 
178 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0201  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.8 
 
 
178 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3432  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.8 
 
 
178 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>