More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0440 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0440  iojap-like protein  100 
 
 		 195 aa  397  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.178504 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1517  iojap-like protein  62.9 
 
 		 134 aa  177  8e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0831178  hitchhiker  0.0026713 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0560  iojap-like protein  52.78 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1756  Iojap-related protein  47.01 
 
 		 131 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000663767  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0798  iojap-like protein  49.51 
 
 		 120 aa  112  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.411993  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1140  iojap-like protein  42.16 
 
 		 130 aa  102  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000105704  normal  0.940401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  33.33 
 
 		 147 aa  85.5  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  34.48 
 
 		 142 aa  85.1  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  33.33 
 
 		 149 aa  85.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  38.04 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  33.7 
 
 		 137 aa  80.5  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  35.92 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  39.13 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  32.61 
 
 		 166 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  36.79 
 
 		 143 aa  80.9  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  39.13 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  37.07 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  38.04 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0986  iojap-like protein  36.79 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.254875  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  38.32 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  36.96 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  39.13 
 
 		 107 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  34.23 
 
 		 113 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  35 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  35.79 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  36.73 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  32.04 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  38.89 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  39.78 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5603199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1203  hypothetical protein  35.87 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  32.26 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1649  hypothetical protein  30.84 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1684  hypothetical protein  30.84 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0432873  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  36.17 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  34.38 
 
 		 117 aa  74.3  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2664  iojap-like protein  39.13 
 
 		 131 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000901507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  35.58 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0648  iojap-like protein  36.36 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131268 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  33.33 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  35.42 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0684  hypothetical protein  38.04 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184258  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0102  iojap-like protein  41.67 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000101684  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  38.04 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000295107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  38.04 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  38.04 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000107419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  30.11 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0744  hypothetical protein  38.04 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000588326  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  30.11 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00606  hypothetical protein  36.96 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  36.96 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  36.96 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000919857  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  36.96 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  36.96 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  36.96 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527237  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  36.96 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0657  hypothetical protein  36.96 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000777395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00595  hypothetical protein  36.96 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000476829  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  33.02 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  36.26 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4721  iojap-like protein  31.52 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0866912  normal  0.107877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1717  iojap-related protein  36.56 
 
 		 106 aa  70.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  39.8 
 
 		 131 aa  70.9  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000027247  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2079  Iojap-related protein  32.41 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  29.31 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0097  Iojap-related protein  40 
 
 		 131 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0187008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2990  iojap-like protein  31.96 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.923836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  33.7 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  35.16 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1401  Iojap family protein  31.91 
 
 		 121 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131748  hitchhiker  5.83181e-24 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  33.7 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2947  hypothetical protein  38.04 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0112244  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3019  hypothetical protein  38.04 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000113985  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  32.08 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  32.98 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  27.72 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  36.78 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3613  iojap-like protein  30.43 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208423  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0933  iojap-like protein  33.33 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.139948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1846  hypothetical protein  38.04 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  36.08 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3454  iojap-like protein  28.57 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0321  iojap-like protein  30.56 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  33.7 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0087  Iojap-related protein  38.26 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755827  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  34.41 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  32.98 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  28.85 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  36.96 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  32.97 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0781  Iojap-related protein  28 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11902  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0577  Iojap-related protein  31.62 
 
 		 132 aa  67.4  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.258721 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1094  hypothetical protein  35.16 
 
 		 105 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1172  hypothetical protein  34.07 
 
 		 105 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149943  normal  0.124229 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1732  iojap-like protein  27.84 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1511  iojap protein family  33.33 
 
 		 116 aa  67  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000252813  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  30.77 
 
 		 106 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  36.96 
 
 		 123 aa  67  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  30.84 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  30.77 
 
 		 106 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>