More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0428 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  486  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  79.25 
 
 		 241 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  75.73 
 
 		 240 aa  380  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  67.92 
 
 		 242 aa  349  2e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  69.46 
 
 		 240 aa  344  8.999999999999999e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  61.25 
 
 		 247 aa  304  9.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  56.43 
 
 		 244 aa  295  5e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  58.09 
 
 		 244 aa  294  7e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  55.42 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  56.43 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  60.09 
 
 		 246 aa  291  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  54.77 
 
 		 244 aa  289  2e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  56.02 
 
 		 244 aa  289  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  56.25 
 
 		 241 aa  288  7e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  55.6 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  56.96 
 
 		 243 aa  285  2.9999999999999996e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  56.3 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  57.56 
 
 		 243 aa  284  8e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  56.84 
 
 		 240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.05 
 
 		 336 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  57.92 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  55.6 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  56.85 
 
 		 246 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  57.5 
 
 		 316 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  57.68 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.08 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  54.62 
 
 		 245 aa  282  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  55.51 
 
 		 255 aa  281  4.0000000000000003e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  53.94 
 
 		 244 aa  281  5.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  57.74 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  55.04 
 
 		 243 aa  279  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  58.19 
 
 		 332 aa  279  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  54.2 
 
 		 277 aa  278  4e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0587  ABC transporter related  56.3 
 
 		 256 aa  278  4e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.410332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0507  ABC transporter-related protein  56.9 
 
 		 240 aa  278  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.302089  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  56.96 
 
 		 247 aa  278  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  55.83 
 
 		 241 aa  278  6e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  55.83 
 
 		 241 aa  278  6e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  57.33 
 
 		 333 aa  278  6e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  53.75 
 
 		 246 aa  277  9e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  55.83 
 
 		 241 aa  277  9e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  55.79 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  55.79 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4313  ABC transporter related  55.42 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  56.72 
 
 		 246 aa  276  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  57.76 
 
 		 317 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  53.33 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.25 
 
 		 241 aa  276  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  55.47 
 
 		 251 aa  275  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.25 
 
 		 241 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  57.33 
 
 		 317 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  55.1 
 
 		 255 aa  276  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  56.5 
 
 		 268 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  57.76 
 
 		 314 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  54.29 
 
 		 262 aa  274  8e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  55.65 
 
 		 264 aa  274  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  53.36 
 
 		 265 aa  273  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4299  ABC transporter-related protein  54.81 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  57.76 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  53.88 
 
 		 262 aa  272  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  53.88 
 
 		 262 aa  272  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  55.83 
 
 		 241 aa  272  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  52.92 
 
 		 252 aa  272  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  55.17 
 
 		 271 aa  272  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  55.65 
 
 		 268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4208  ABC transporter related  53.97 
 
 		 259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216792  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  56.9 
 
 		 240 aa  271  5.000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  55.6 
 
 		 258 aa  271  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 		 246 aa  271  5.000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  55.79 
 
 		 243 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  51.67 
 
 		 241 aa  271  6e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  54.29 
 
 		 266 aa  271  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  52.94 
 
 		 265 aa  271  7e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  54.69 
 
 		 263 aa  271  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  53.62 
 
 		 239 aa  271  8.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  55.51 
 
 		 268 aa  271  8.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0369  ABC transporter related protein  54.96 
 
 		 242 aa  271  8.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  55.04 
 
 		 264 aa  271  9e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0826  ABC transporter related  53.45 
 
 		 271 aa  271  9e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3391  ABC transporter related  57.74 
 
 		 245 aa  270  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  54.69 
 
 		 265 aa  270  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  56.49 
 
 		 321 aa  270  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  54.62 
 
 		 263 aa  270  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2580  ABC transporter-like protein  55.36 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0868  ABC transporter related protein  57.74 
 
 		 245 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463879  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  51.25 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  56.52 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  51.48 
 
 		 246 aa  270  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  54.39 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  55.46 
 
 		 256 aa  269  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0709  ABC transporter related  56.49 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  55.17 
 
 		 264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  53.75 
 
 		 249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  53.33 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0644  ABC transporter, ATP-binding protein  53.94 
 
 		 245 aa  269  4e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00234663  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  52.5 
 
 		 250 aa  268  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  55.42 
 
 		 241 aa  268  4e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 277 aa  268  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>