More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0413 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 142 aa  283  5e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  82.01 
 
 		 142 aa  230  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  77.86 
 
 		 142 aa  213  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  61.7 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  59.29 
 
 		 154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  40.44 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004370  putative acetoin utilization protein AcuB  42.54 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  39.72 
 
 		 147 aa  97.4  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  39.29 
 
 		 169 aa  97.1  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  40.3 
 
 		 640 aa  95.9  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01043  hypothetical protein  39.55 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  43.18 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  40.15 
 
 		 214 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  43.28 
 
 		 146 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  43.28 
 
 		 146 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  43.28 
 
 		 146 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  35.82 
 
 		 214 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  31.39 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  31.16 
 
 		 172 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  31.16 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  32.12 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  32.12 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  32.12 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  35.34 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  36.76 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  33.59 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0958  CBS domain-containing protein  34.04 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2925  CBS domain-containing protein  32.85 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00660702  normal  0.275882 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  31.62 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  32.85 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  32.85 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  32.85 
 
 		 214 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  32.85 
 
 		 214 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  32.86 
 
 		 216 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  30.66 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0650  CBS domain-containing protein  30.66 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 225 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  30.66 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  32.85 
 
 		 214 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  32.85 
 
 		 214 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  32.85 
 
 		 214 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  32.85 
 
 		 214 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  32.85 
 
 		 214 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  32.85 
 
 		 214 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  31.78 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  33.09 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3655  CBS domain-containing protein  30.66 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  31.16 
 
 		 217 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  31.43 
 
 		 212 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  32.62 
 
 		 232 aa  71.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  32.59 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0909  CBS domain-containing protein  31.88 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  37.59 
 
 		 208 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  32.81 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  30.23 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  31.39 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  30.71 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  32.03 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  34.75 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  32.86 
 
 		 216 aa  67.8  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  30.66 
 
 		 215 aa  67.4  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 202 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  31.03 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  35.34 
 
 		 225 aa  67  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  34.11 
 
 		 282 aa  67  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0831  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  35.04 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  33.57 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  34.07 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  32.58 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  28.68 
 
 		 636 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  32.56 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  28.89 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  27.13 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  32.56 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  32.56 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  32.56 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  29.81 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1237  acetoin utilization protein AcuB, putative  31.01 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  30.43 
 
 		 224 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  28.67 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  34.11 
 
 		 769 aa  64.3  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  32.24 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 252 aa  63.5  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  31.78 
 
 		 209 aa  63.5  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  28.89 
 
 		 256 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  30.43 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  28.28 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  32.14 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2268  signal transduction protein  29.46 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220391  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  28.38 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  28.68 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>