225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0376 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 379 aa  748    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  73.58 
 
 		 380 aa  535  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  60.61 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1296  permease YjgP/YjgQ family protein  52.88 
 
 		 395 aa  326  5e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00381796  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  48.18 
 
 		 392 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  30.25 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  30.23 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  33.71 
 
 		 391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  31.11 
 
 		 391 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  32.7 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  31.39 
 
 		 391 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  30.64 
 
 		 399 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  27.33 
 
 		 423 aa  146  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  32.5 
 
 		 418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  31.99 
 
 		 379 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  24.34 
 
 		 392 aa  97.8  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 365 aa  96.3  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  24.65 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  25.69 
 
 		 792 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  26.25 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 391 aa  87  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  23.51 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  27.01 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  25.27 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  21.96 
 
 		 444 aa  82.8  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  21.83 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  30.92 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  26.7 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  27.6 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  24.87 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  25.93 
 
 		 401 aa  79.3  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  26.36 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  22.51 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  26.15 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  21.14 
 
 		 1061 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  26.36 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  24.12 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  23.24 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  24.07 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  25.37 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  25.37 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  26.35 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  23.8 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  26.63 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  20.86 
 
 		 1061 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  26.35 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  25.87 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  25.96 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  26.04 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  20.69 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  25.95 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  24.91 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  26.63 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  25.94 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  25.13 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  24.19 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  25.96 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  26.02 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  25.96 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  27.19 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  20.34 
 
 		 1040 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  24.79 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  27.7 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2743  permease YjgP/YjgQ family protein  24.41 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.731454  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  23.55 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  25.16 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  24.1 
 
 		 398 aa  66.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  24.62 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  25.23 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  25.9 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  23.18 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  22.89 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  24.57 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  24.34 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  26.72 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  26.78 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  28.07 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  25.73 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  18.8 
 
 		 1153 aa  64.3  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  25.5 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  29.14 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  24.78 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  25.89 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  23.58 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  23.49 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  26.47 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  28.22 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  20.11 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  25.18 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  19.64 
 
 		 1096 aa  62  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  25.59 
 
 		 372 aa  62  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  24.5 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  23.76 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  23.63 
 
 		 498 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  19.35 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  20.62 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  24.23 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>