More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0334 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  100 
 
 
373 aa  740  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  54.17 
 
 
334 aa  355  5e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3450  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  52.23 
 
 
330 aa  337  2e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 
329 aa  335  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  51.73 
 
 
331 aa  317  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  46.52 
 
 
323 aa  278  9e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  47.51 
 
 
323 aa  270  3e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  46.24 
 
 
323 aa  262  7e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
318 aa  255  1e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  41.93 
 
 
311 aa  254  2e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  2.57577e-07  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  44.07 
 
 
327 aa  251  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  48.44 
 
 
337 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  43.27 
 
 
313 aa  246  3e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  39 
 
 
498 aa  244  1e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3343  Glutamate--tRNA ligase  41.36 
 
 
338 aa  243  6e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13470  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 
317 aa  235  1e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
468 aa  233  4e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 
472 aa  230  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  3.47292e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 
504 aa  228  9e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 
482 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 
535 aa  228  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
492 aa  226  5e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 
478 aa  226  7e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  37.68 
 
 
518 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 
485 aa  217  3e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.94011e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 
477 aa  216  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 
481 aa  216  5e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
477 aa  215  9e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
465 aa  214  3e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
465 aa  214  3e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 
508 aa  213  3e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 
482 aa  213  3e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 
490 aa  212  9e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.92193e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  39.77 
 
 
316 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0570  Glutamate--tRNA ligase  40.85 
 
 
319 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 
481 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 
494 aa  209  7e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
475 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1023  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  42.15 
 
 
303 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202098  hitchhiker  3.45941e-06 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3027  glutamate--tRNA ligase  39.81 
 
 
278 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.390374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 
483 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 
481 aa  206  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 
488 aa  206  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  32.11 
 
 
464 aa  206  7e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 
483 aa  206  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 
485 aa  205  8e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.49346e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2698  glutamyl- and glutaminyl- tRNA synthetase  40.74 
 
 
311 aa  205  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.86478e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 
480 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  35 
 
 
881 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
485 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.30888e-08  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 
481 aa  203  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  7.02508e-12  unclonable  1.80865e-07 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 
490 aa  202  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 
465 aa  202  7e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0414  Glutamate--tRNA ligase  38.44 
 
 
309 aa  201  1e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
469 aa  201  1e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
471 aa  201  2e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3985  glutamate--tRNA ligase  42.03 
 
 
298 aa  201  2e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 
495 aa  201  2e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 
469 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  4.34285e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 
488 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.04549e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 
501 aa  199  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
466 aa  199  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3764  Glutamate--tRNA ligase  40.25 
 
 
297 aa  199  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 
490 aa  199  7e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3110  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  43.43 
 
 
284 aa  197  2e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  35 
 
 
470 aa  198  2e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 
481 aa  197  2e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  4.48328e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 
496 aa  197  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
492 aa  196  4e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2388  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  42.68 
 
 
294 aa  196  5e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1811  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
477 aa  196  5e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.497016  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0510  glutamyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
466 aa  196  5e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 
463 aa  195  9e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  40.59 
 
 
314 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 
470 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1220  glutamyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
469 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  6.64891e-10  normal  0.415477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 
479 aa  193  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
467 aa  192  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 
469 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  1.4771e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 
469 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  3.43347e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0087  tRNA synthetase class I (E and Q), catalytic domain protein  34.07 
 
 
374 aa  192  6e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62423e-07 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 
469 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  35.6 
 
 
495 aa  192  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 
470 aa  192  6e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 
469 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 
471 aa  192  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0947  Glutamate--tRNA ligase  40.9 
 
 
313 aa  192  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.507725  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 
504 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  2.51622e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 
504 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 
464 aa  192  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 
504 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  1.91371e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
467 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 
491 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1586  glutamyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 
369 aa  191  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 
467 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 
477 aa  191  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
467 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  5.0225e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 
469 aa  190  3e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 
469 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  1.51116e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  42.56 
 
 
283 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>