More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0308 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  100 
 
 
481 aa  965  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  76.84 
 
 
482 aa  728  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  59.46 
 
 
475 aa  561  1e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  59.54 
 
 
480 aa  556  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  57.75 
 
 
473 aa  518  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  56.64 
 
 
476 aa  518  1e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  46.56 
 
 
457 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  46.58 
 
 
458 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  47.54 
 
 
476 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  46.24 
 
 
464 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.6609e-07  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  48.81 
 
 
462 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  44.68 
 
 
466 aa  361  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  8.36052e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  45.32 
 
 
464 aa  350  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  45.77 
 
 
485 aa  347  4e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  43.16 
 
 
461 aa  343  4e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  44.14 
 
 
475 aa  341  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  44.7 
 
 
471 aa  340  3e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  45.52 
 
 
476 aa  337  3e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.81376e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  40.2 
 
 
491 aa  333  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  45.6 
 
 
474 aa  332  7e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  42.94 
 
 
479 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  42.33 
 
 
477 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  44.3 
 
 
472 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  42.39 
 
 
500 aa  330  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  41.98 
 
 
492 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  42.48 
 
 
477 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  41.49 
 
 
485 aa  328  1e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  45.52 
 
 
476 aa  328  1e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  42.41 
 
 
473 aa  328  2e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  42.32 
 
 
502 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  42.47 
 
 
476 aa  325  8e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  41.76 
 
 
481 aa  325  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  42.62 
 
 
474 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  42.42 
 
 
474 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  41.21 
 
 
469 aa  323  6e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  42.01 
 
 
474 aa  321  2e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  41.88 
 
 
484 aa  321  2e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  42.83 
 
 
535 aa  320  3e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  41.24 
 
 
473 aa  319  6e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  40.08 
 
 
499 aa  319  7e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  41.99 
 
 
501 aa  319  8e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  41.72 
 
 
473 aa  317  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  41.7 
 
 
493 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  43.68 
 
 
511 aa  315  1e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  41.96 
 
 
492 aa  313  3e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  40.2 
 
 
502 aa  313  4e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  40.2 
 
 
502 aa  313  4e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  40.2 
 
 
502 aa  313  4e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  40.2 
 
 
502 aa  313  4e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  42.73 
 
 
502 aa  313  4e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  9.01531e-09  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  40.2 
 
 
502 aa  313  4e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  40.52 
 
 
494 aa  313  5e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  42.4 
 
 
473 aa  313  6e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  43.71 
 
 
501 aa  313  6e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  43.37 
 
 
498 aa  313  6e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  42.38 
 
 
506 aa  312  7e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  41.23 
 
 
477 aa  312  7e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  41.47 
 
 
485 aa  312  8e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  42.46 
 
 
477 aa  312  9e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  42.42 
 
 
493 aa  312  9e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  42.46 
 
 
477 aa  312  9e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  37.86 
 
 
517 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  40.52 
 
 
494 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  41.38 
 
 
461 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  41.76 
 
 
483 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  41.76 
 
 
483 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  42.98 
 
 
505 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  41.76 
 
 
483 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  41.38 
 
 
485 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  41.76 
 
 
495 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  41.76 
 
 
495 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  41.76 
 
 
495 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  41.76 
 
 
495 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  41.01 
 
 
509 aa  311  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  40.53 
 
 
478 aa  310  3e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  39.5 
 
 
513 aa  310  3e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  39.5 
 
 
513 aa  310  3e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  40.43 
 
 
494 aa  310  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  41.34 
 
 
500 aa  310  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  41.2 
 
 
496 aa  310  4e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  41.74 
 
 
502 aa  310  4e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  42.7 
 
 
471 aa  310  5e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  40.21 
 
 
494 aa  310  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  43.78 
 
 
503 aa  309  7e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  42.62 
 
 
503 aa  309  7e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  41.11 
 
 
499 aa  309  9e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  40.21 
 
 
493 aa  308  1e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  40.21 
 
 
493 aa  308  1e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  42.24 
 
 
490 aa  308  1e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  41.33 
 
 
495 aa  308  1e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  40.45 
 
 
473 aa  308  1e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  42.89 
 
 
498 aa  307  2e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  40.4 
 
 
499 aa  308  2e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  43.2 
 
 
478 aa  308  2e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  41.82 
 
 
500 aa  308  2e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  42.09 
 
 
472 aa  308  2e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.60419e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  40.21 
 
 
493 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  41.77 
 
 
482 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  41.67 
 
 
464 aa  307  3e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  42.67 
 
 
516 aa  307  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>