188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0263 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0263  tol-pal system protein YbgF  100 
 
 		 333 aa  682    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067735 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  58.86 
 
 		 312 aa  332  4e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  34.52 
 
 		 335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  36.26 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  39.14 
 
 		 325 aa  176  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  42.42 
 
 		 292 aa  122  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 		 287 aa  88.2  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  24.44 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  32.91 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  32.26 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  27.43 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  25.78 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  26.29 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  26.21 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  32.58 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  23.84 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  32.48 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  30.95 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  31.75 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  30.71 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 275 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  34.21 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  26.97 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  30.51 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  30.14 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  23.63 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  30.89 
 
 		 271 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0889  hypothetical protein  29.27 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  30.33 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  29.57 
 
 		 242 aa  67  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  29.11 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  28.7 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  31.34 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  30.99 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4143  hypothetical protein  27.55 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  26.92 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0862  membrane lipoprotein lipid attachment site  23.8 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.349098  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  26.32 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  24.28 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  25.89 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  27.5 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  27.5 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  23.55 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  29.14 
 
 		 262 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  27.36 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  23.55 
 
 		 263 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  29.14 
 
 		 262 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  23.55 
 
 		 263 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  28.78 
 
 		 255 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3081  Tol-Pal system YbgF  25.87 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  28.05 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  28.05 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  28.05 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  28.44 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  27.36 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000538849  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  30.61 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  28.05 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  28.44 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  28.05 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  28.8 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  28.44 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  28.05 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  30.91 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  26.85 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  30.91 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  28.97 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  27.64 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  27.64 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1315  tol-pal system protein YbgF  32.35 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  26.32 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1278  tol-pal system protein YbgF  28.03 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  25.15 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2713  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0957329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5388  tol-pal system protein YbgF  27.03 
 
 		 339 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.986897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  29.31 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  28.17 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  28.95 
 
 		 271 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  31.37 
 
 		 251 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  27.66 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4842  tol-pal system protein YbgF  27.4 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  0.989146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  28.07 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  28.95 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  28.07 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5310  tol-pal system protein YbgF  27.03 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  31.01 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  25.3 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  23.46 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  28.7 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  28.7 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>