More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0210 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0210  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 592 aa  1170    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  39.3 
 
 		 425 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1004  Extracellular ligand-binding receptor  36.19 
 
 		 416 aa  263  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1033  extracellular ligand-binding receptor  35.94 
 
 		 416 aa  261  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.000487812 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1661  hypothetical protein  38.57 
 
 		 430 aa  237  4e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429909  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  34.92 
 
 		 377 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  38.21 
 
 		 374 aa  180  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  32.54 
 
 		 386 aa  173  6.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  31.96 
 
 		 388 aa  173  9e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  32.99 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  32.99 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  33.82 
 
 		 408 aa  172  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  33.66 
 
 		 480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  34.43 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  35.53 
 
 		 423 aa  160  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  31.99 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  31.84 
 
 		 379 aa  159  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  35.92 
 
 		 411 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  35.92 
 
 		 411 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  32.38 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  30.09 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  32.61 
 
 		 386 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  33.51 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  33.16 
 
 		 393 aa  152  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  30.35 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  31.75 
 
 		 496 aa  148  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  32.63 
 
 		 378 aa  148  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  35.1 
 
 		 380 aa  148  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  34.03 
 
 		 385 aa  147  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  29.85 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  31.07 
 
 		 375 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  43 
 
 		 378 aa  142  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  33.78 
 
 		 382 aa  141  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  33.78 
 
 		 382 aa  140  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  32.02 
 
 		 426 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  28.94 
 
 		 403 aa  137  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0962  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  31.01 
 
 		 512 aa  136  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  30.8 
 
 		 517 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  29.35 
 
 		 392 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  30.1 
 
 		 539 aa  132  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  32.38 
 
 		 384 aa  130  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  29.85 
 
 		 342 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  28.91 
 
 		 386 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 		 367 aa  125  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  28.26 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  34.82 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 		 386 aa  123  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  29.74 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  29.7 
 
 		 377 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  28.18 
 
 		 368 aa  121  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 		 374 aa  122  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  28.42 
 
 		 497 aa  120  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  28.84 
 
 		 374 aa  120  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 		 370 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  27.86 
 
 		 370 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  28.35 
 
 		 370 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.29 
 
 		 388 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  27.91 
 
 		 519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 		 371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  28.27 
 
 		 373 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  29.87 
 
 		 385 aa  109  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  40.22 
 
 		 385 aa  108  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  29.19 
 
 		 394 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.78 
 
 		 425 aa  107  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0358  extracellular ligand-binding receptor  25.92 
 
 		 386 aa  106  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00342329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  28.92 
 
 		 363 aa  104  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  28.3 
 
 		 384 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  23.58 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  28.34 
 
 		 383 aa  101  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4394  extracellular ligand-binding receptor  30.24 
 
 		 406 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  31.18 
 
 		 438 aa  97.8  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5294  putative ABC-type branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  29.76 
 
 		 406 aa  97.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0666  ABC transporter substrate-binding protein  30.94 
 
 		 410 aa  97.4  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.112312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  36.77 
 
 		 368 aa  96.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  27.32 
 
 		 383 aa  94.4  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4684  extracellular ligand-binding receptor  29.27 
 
 		 406 aa  94.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4388  extracellular ligand-binding receptor  25.46 
 
 		 372 aa  94  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2248  Extracellular ligand-binding receptor  30.73 
 
 		 410 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0436  Extracellular ligand-binding receptor  29.81 
 
 		 379 aa  93.2  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  26.22 
 
 		 378 aa  92.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  29.23 
 
 		 382 aa  92  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3561  extracellular ligand-binding receptor  30.94 
 
 		 409 aa  92  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4409  extracellular ligand-binding receptor  23.78 
 
 		 383 aa  91.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1898  extracellular ligand-binding receptor  29.44 
 
 		 411 aa  90.9  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.193262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2001  Extracellular ligand-binding receptor  26.79 
 
 		 411 aa  90.9  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7081  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  30.27 
 
 		 407 aa  90.1  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3339  extracellular ligand-binding receptor  30.17 
 
 		 410 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.154352  normal  0.135284 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4103  extracellular ligand-binding receptor  31.49 
 
 		 401 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742112  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4000  Extracellular ligand-binding receptor  31.09 
 
 		 403 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  26.23 
 
 		 408 aa  89  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  26.37 
 
 		 392 aa  88.6  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 		 383 aa  88.2  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3566  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 		 411 aa  88.2  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172998  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3562  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  28.24 
 
 		 409 aa  87.8  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7651  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.39 
 
 		 415 aa  87.4  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99279  normal  0.165016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  28.85 
 
 		 412 aa  87.4  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7082  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  29.07 
 
 		 407 aa  87.4  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4246  Extracellular ligand-binding receptor  28.18 
 
 		 409 aa  87.4  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  28.38 
 
 		 403 aa  87  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>