86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0176 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 
174 aa  340  9e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  72.09 
 
 
175 aa  254  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  73.26 
 
 
175 aa  249  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  72.25 
 
 
175 aa  236  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2857  hypothetical protein  68.6 
 
 
175 aa  223  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1596  hypothetical protein  72.67 
 
 
173 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  56.65 
 
 
176 aa  191  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2311  YeeE/YedE family protein  45.4 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.248702  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1628  YeeE/YedE family protein  44.1 
 
 
185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1169  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.1 
 
 
197 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0625  YeeE/YedE family protein  47.34 
 
 
186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1696  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.21 
 
 
185 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000839516 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3345  hypothetical protein  43.56 
 
 
192 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3683  hypothetical protein  36.05 
 
 
186 aa  94.4  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1462  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 
419 aa  90.9  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0802  YeeE/YedE family protein  40 
 
 
185 aa  89  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.09 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0348  hypothetical protein  36.84 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.176837  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  34.01 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 
647 aa  79  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  38.19 
 
 
237 aa  77.8  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1834  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.06 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  32.33 
 
 
373 aa  71.6  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0789  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.06 
 
 
352 aa  68.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0557  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.37 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000311209  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  42.15 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0170  hypothetical protein  30.65 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4107  hypothetical protein  34.11 
 
 
399 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159801  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12638  hypothetical protein  35.29 
 
 
137 aa  62.4  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.155305  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.97 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.77 
 
 
354 aa  58.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.59 
 
 
140 aa  57.4  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0517637  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4883  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.57 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0848134  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2810  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.55 
 
 
218 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151764  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3330  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.98 
 
 
159 aa  54.7  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  hitchhiker  0.00106524 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2715  hypothetical protein  31.55 
 
 
218 aa  54.3  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6935  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.16 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2629  hypothetical protein  34.92 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1029  transporter component  30.58 
 
 
136 aa  53.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489636  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0103  hypothetical protein  35.29 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2821  YeeE/YedE  32.28 
 
 
149 aa  51.2  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0259  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.06 
 
 
149 aa  50.8  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0761  hypothetical protein  28 
 
 
141 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3115  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.57 
 
 
152 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0743  hypothetical protein  28 
 
 
141 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5602  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 
143 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2607  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.33 
 
 
138 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11773  hypothetical protein  31.75 
 
 
137 aa  49.3  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1617  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.4 
 
 
155 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000235117  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.65 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2424  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.43 
 
 
151 aa  48.9  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3646  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.17 
 
 
142 aa  48.5  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.415893  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0192  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.08 
 
 
140 aa  48.5  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0179  hypothetical protein  30.08 
 
 
140 aa  48.1  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.07 
 
 
330 aa  47.8  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.65 
 
 
159 aa  47.8  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  28.09 
 
 
371 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.63 
 
 
332 aa  47.4  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2677  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.76 
 
 
157 aa  46.6  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0813  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.86 
 
 
148 aa  45.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.54396  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0328  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.15 
 
 
137 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5674  putative transporter component domain-containing protein  30.71 
 
 
143 aa  45.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2894  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.78 
 
 
152 aa  45.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.938885  normal  0.236588 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0313  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.15 
 
 
137 aa  45.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.03 
 
 
139 aa  45.1  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.522142  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3388  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48 
 
 
290 aa  44.7  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530669  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2518  hypothetical protein  60.61 
 
 
145 aa  44.7  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3633  hypothetical protein  29.1 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1494  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.93 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3704  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.67 
 
 
153 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546913  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  51.11 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2078  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.83 
 
 
144 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0437  hypothetical protein  30.71 
 
 
137 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.275295 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0232  YeeE/YedE  29.06 
 
 
143 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0584  hypothetical protein  29.73 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0812  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40 
 
 
462 aa  42.4  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1336  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.24 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377918 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6242  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.19 
 
 
151 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937255  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2717  putative transmembrane protein  50 
 
 
145 aa  42.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.430546  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5966  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.91 
 
 
141 aa  42  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0613425 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.47 
 
 
371 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3903  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.37 
 
 
142 aa  41.6  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0456636  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4847  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32 
 
 
145 aa  41.6  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.25 
 
 
141 aa  41.2  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2496  integral membrane protein  26.72 
 
 
145 aa  40.8  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>