More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0100 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0100  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
264 aa  537  1e-152  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.150888 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1744  methionine aminopeptidase, type I  83.92 
 
 
259 aa  441  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.289602  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2236  methionine aminopeptidase, type I  79.84 
 
 
254 aa  428  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0460012  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2044  methionine aminopeptidase, type I  69.8 
 
 
254 aa  363  2e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  2.36003e-05  hitchhiker  0.000194463 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0681  methionine aminopeptidase, type I  66.41 
 
 
264 aa  354  8e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2753  methionine aminopeptidase, type I  65.22 
 
 
254 aa  338  8e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01380  methionine aminopeptidase, type I  54.18 
 
 
251 aa  285  6e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.65586e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1577  methionine aminopeptidase, type I  57.49 
 
 
248 aa  285  6e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00040265  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  56.28 
 
 
248 aa  278  8e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  57.09 
 
 
248 aa  278  9e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  54 
 
 
249 aa  277  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  54 
 
 
249 aa  277  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  58.82 
 
 
236 aa  277  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1002  methionine aminopeptidase, type I  50.4 
 
 
250 aa  274  1e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  9.54293e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  54.92 
 
 
248 aa  273  3e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1368  methionine aminopeptidase, type I  54.66 
 
 
248 aa  273  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0648  methionine aminopeptidase, type I  59.75 
 
 
236 aa  272  4e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618158  hitchhiker  1.14545e-06 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  57.14 
 
 
269 aa  271  9e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  53.82 
 
 
249 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  54.84 
 
 
250 aa  270  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  4.62112e-06  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0955  methionine aminopeptidase, type I  59.66 
 
 
236 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.321891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3306  methionine aminopeptidase, type I  59.23 
 
 
236 aa  266  3e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.48834e-05 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  54.25 
 
 
248 aa  266  3e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  53.63 
 
 
248 aa  266  3e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  50.81 
 
 
248 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  2.3195e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2835  methionine aminopeptidase, type I  55.06 
 
 
248 aa  261  8e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  53.82 
 
 
249 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.66875e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3645  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
251 aa  259  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  8.62286e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  51 
 
 
256 aa  259  3e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 
248 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.84186e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2446  methionine aminopeptidase  47.22 
 
 
277 aa  258  8e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251132 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  49.2 
 
 
259 aa  258  9e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  2.54038e-08 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 
249 aa  257  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04771  methionine aminopeptidase  45.85 
 
 
280 aa  257  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215617  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1714  methionine aminopeptidase  48.22 
 
 
285 aa  257  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1809  methionine aminopeptidase  44.66 
 
 
279 aa  255  6e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00302878  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05331  methionine aminopeptidase  44.66 
 
 
279 aa  254  8e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.114757 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0768  methionine aminopeptidase, type I  49.19 
 
 
250 aa  254  1e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0333  methionine aminopeptidase  47.22 
 
 
276 aa  253  2e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  48.3 
 
 
274 aa  253  2e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  49.19 
 
 
251 aa  253  2e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  2.26178e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
256 aa  252  4e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.42158e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  48.99 
 
 
248 aa  252  4e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  3.8209e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1534  methionine aminopeptidase  48.62 
 
 
275 aa  252  5e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 
255 aa  252  5e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 
251 aa  251  7e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  3.38054e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  48.58 
 
 
248 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  6.71118e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1955  methionine aminopeptidase, type I  54.62 
 
 
264 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  48.58 
 
 
248 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.9178e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  48.58 
 
 
248 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  1.01117e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  48.58 
 
 
248 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  48.58 
 
 
248 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  3.83298e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  48.58 
 
 
248 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  9.06303e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0645  methionine aminopeptidase  46.25 
 
 
281 aa  250  2e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 
261 aa  250  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  47.77 
 
 
248 aa  249  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.27766e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  48.02 
 
 
256 aa  247  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  48.39 
 
 
251 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  8.8934e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  50.41 
 
 
249 aa  247  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2040  methionine aminopeptidase, type I  53.82 
 
 
264 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3676  methionine aminopeptidase  45.63 
 
 
275 aa  246  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  49.58 
 
 
236 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.61795e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  49.58 
 
 
236 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  49.58 
 
 
236 aa  246  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.01637e-07  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3973  methionine aminopeptidase, type I  46.09 
 
 
257 aa  243  2e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0176  methionine aminopeptidase  49.2 
 
 
257 aa  243  2e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.137768 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  48.39 
 
 
253 aa  243  2e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  48.39 
 
 
253 aa  243  2e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06841  methionine aminopeptidase  43.87 
 
 
303 aa  242  4e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05401  methionine aminopeptidase  42.69 
 
 
279 aa  242  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12992  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3984  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 
263 aa  241  9e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0405477  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1116  methionine aminopeptidase, type I  49.19 
 
 
250 aa  241  9e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000848605  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0818  methionine aminopeptidase, type I  47.77 
 
 
268 aa  240  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4490  methionine aminopeptidase  45.78 
 
 
281 aa  239  3e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0183  methionine aminopeptidase  47.64 
 
 
262 aa  239  3e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.275285  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0780  methionine aminopeptidase, type I  46.83 
 
 
255 aa  239  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  3.41129e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  48.06 
 
 
274 aa  239  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0402  methionine aminopeptidase  46.56 
 
 
255 aa  236  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05321  methionine aminopeptidase  42.29 
 
 
279 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0584  methionine aminopeptidase  45.08 
 
 
271 aa  236  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0623  methionine aminopeptidase, type I  46.56 
 
 
262 aa  236  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  47.18 
 
 
247 aa  236  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  6.64848e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05021  methionine aminopeptidase  41.9 
 
 
279 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0477  methionine aminopeptidase  41.5 
 
 
279 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0205  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
262 aa  236  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2580  methionine aminopeptidase  43.65 
 
 
290 aa  235  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1924  methionine aminopeptidase, type I  53.82 
 
 
264 aa  235  5e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  46.77 
 
 
253 aa  235  5e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0420  methionine aminopeptidase, type I  46.53 
 
 
251 aa  234  8e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1125  methionine aminopeptidase  44.05 
 
 
287 aa  234  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1154  methionine aminopeptidase  44.05 
 
 
287 aa  234  1e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0737  methionine aminopeptidase, type I  46.59 
 
 
248 aa  233  2e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2275  methionine aminopeptidase, type I  46.9 
 
 
258 aa  233  2e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  hitchhiker  0.00333924 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2311  hypothetical protein  47.64 
 
 
254 aa  233  2e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  3.22255e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1139  methionine aminopeptidase, type I  46.56 
 
 
262 aa  233  2e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  8.63177e-07  normal  0.0264901 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0269  methionine aminopeptidase, type I  48.16 
 
 
249 aa  233  2e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  49.39 
 
 
249 aa  233  3e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3883  methionine aminopeptidase, type I  44.87 
 
 
272 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  45.56 
 
 
266 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  48.8 
 
 
259 aa  232  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>