More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0099 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  81.46 
 
 
437 aa  725  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
437 aa  880  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  72.02 
 
 
437 aa  664  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  86.04 
 
 
437 aa  783  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  72.07 
 
 
437 aa  632  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  66.67 
 
 
435 aa  585  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.7617e-05  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  60.69 
 
 
435 aa  563  1e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  59.54 
 
 
435 aa  556  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  59.95 
 
 
437 aa  557  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  59.44 
 
 
435 aa  557  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  60.09 
 
 
435 aa  555  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  58.85 
 
 
435 aa  550  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02472e-07 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  59.4 
 
 
435 aa  550  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  8.11889e-07 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  58.35 
 
 
429 aa  538  1e-152  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  59.54 
 
 
442 aa  538  1e-151  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  1.52006e-07  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  58.16 
 
 
435 aa  522  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  58.31 
 
 
447 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  59.02 
 
 
447 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  57.71 
 
 
445 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  57.48 
 
 
447 aa  492  1e-138  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  53.92 
 
 
443 aa  489  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  2.66535e-11 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  53.92 
 
 
443 aa  489  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  53.01 
 
 
435 aa  486  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  55.01 
 
 
440 aa  485  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  7.06243e-08 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  54.21 
 
 
442 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  8.98122e-06  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  53.74 
 
 
443 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  53.99 
 
 
440 aa  478  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  53.74 
 
 
443 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  54.21 
 
 
442 aa  476  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  54.65 
 
 
437 aa  475  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  53.74 
 
 
443 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  4.33507e-06 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  53.74 
 
 
443 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  53.74 
 
 
444 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  53.74 
 
 
444 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  55.35 
 
 
444 aa  469  1e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  4.20552e-06 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  53.61 
 
 
441 aa  471  1e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  52.91 
 
 
443 aa  469  1e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  53.42 
 
 
442 aa  471  1e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  53.42 
 
 
442 aa  471  1e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  54.31 
 
 
453 aa  466  1e-130  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  53.52 
 
 
437 aa  466  1e-130  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  55.12 
 
 
436 aa  463  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  53.85 
 
 
442 aa  464  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  53.9 
 
 
439 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4256  preprotein translocase subunit SecY  52.75 
 
 
443 aa  463  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  1.93642e-05  unclonable  4.48849e-12 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  53.38 
 
 
443 aa  462  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2305  preprotein translocase subunit SecY  53.77 
 
 
437 aa  459  1e-128  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  51.87 
 
 
434 aa  461  1e-128  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  53.66 
 
 
439 aa  458  1e-128  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  54.15 
 
 
439 aa  461  1e-128  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  51.69 
 
 
444 aa  459  1e-128  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  53.66 
 
 
439 aa  458  1e-128  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  51.4 
 
 
441 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  53.6 
 
 
440 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  6.31755e-08  hitchhiker  3.21163e-06 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  52.93 
 
 
436 aa  452  1e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  51.05 
 
 
446 aa  453  1e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  5.09869e-07  unclonable  1.21988e-08 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  51.74 
 
 
444 aa  454  1e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  50.58 
 
 
446 aa  452  1e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  4.08952e-07  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  51.52 
 
 
446 aa  452  1e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.14541e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  51.05 
 
 
446 aa  454  1e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.58427e-07  unclonable  8.37901e-11 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  50.11 
 
 
439 aa  452  1e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  51.84 
 
 
448 aa  448  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  51.17 
 
 
446 aa  450  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.81445e-07  unclonable  1.05897e-05 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  50.81 
 
 
446 aa  448  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3277  preprotein translocase subunit SecY  53.17 
 
 
440 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.821024  hitchhiker  0.000244814 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2930  preprotein translocase subunit SecY  53.17 
 
 
440 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  7.99077e-06 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2999  preprotein translocase subunit SecY  52.94 
 
 
448 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0377089  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0495  preprotein translocase subunit SecY  54.59 
 
 
439 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  51.52 
 
 
446 aa  451  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  7.11222e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5050  preprotein translocase subunit SecY  53.04 
 
 
437 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  53.83 
 
 
447 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06450  Sec-dependent preprotein translocase, SecY subunit  55.7 
 
 
395 aa  448  1e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  51.97 
 
 
443 aa  446  1e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0340  preprotein translocase subunit SecY  52.66 
 
 
435 aa  447  1e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670272  hitchhiker  0.000594925 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3048  preprotein translocase subunit SecY  54.46 
 
 
448 aa  446  1e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20022  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2819  preprotein translocase subunit SecY  55.07 
 
 
448 aa  446  1e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.83211  normal  0.30071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  53.04 
 
 
436 aa  447  1e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  51.14 
 
 
448 aa  441  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0220  preprotein translocase subunit SecY  50.58 
 
 
446 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  7.98254e-06  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  51.85 
 
 
443 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  50.35 
 
 
446 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  6.62692e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  50.58 
 
 
446 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.58721e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  50.58 
 
 
446 aa  444  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  52.2 
 
 
443 aa  443  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  50.58 
 
 
446 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.10874e-07  hitchhiker  1.76689e-09 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0216  preprotein translocase subunit SecY  50.58 
 
 
446 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  6.5492e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  50.58 
 
 
446 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  7.44124e-08  unclonable  3.04117e-11 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  50.58 
 
 
446 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  9.2283e-06  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3624  preprotein translocase subunit SecY  54.84 
 
 
448 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0024204  hitchhiker  3.16341e-11 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4036  preprotein translocase subunit SecY  50.58 
 
 
446 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.84742e-08  unclonable  4.35138e-12 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0334  preprotein translocase subunit SecY  54.84 
 
 
448 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507904  decreased coverage  0.00438746 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3739  preprotein translocase subunit SecY  50.35 
 
 
446 aa  439  1e-122  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  6.05107e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3159  preprotein translocase subunit SecY  52.49 
 
 
447 aa  438  1e-122  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453709  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0073  preprotein translocase, SecY subunit  52.21 
 
 
445 aa  441  1e-122  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.867918  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  51.28 
 
 
442 aa  439  1e-122  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3297  preprotein translocase subunit SecY  52.49 
 
 
447 aa  439  1e-122  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2154  preprotein translocase subunit SecY  50.58 
 
 
444 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.17062e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  50.81 
 
 
446 aa  438  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0838  preprotein translocase subunit SecY  52.08 
 
 
434 aa  436  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  50.58 
 
 
446 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>