More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0093 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0093  30S ribosomal protein S8  100 
 
 		 126 aa  255  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407651 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1751  30S ribosomal protein S8  86.51 
 
 		 126 aa  225  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327993  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2243  30S ribosomal protein S8  84.13 
 
 		 126 aa  221  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0125456  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0674  30S ribosomal protein S8  80.16 
 
 		 126 aa  214  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.973515  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2051  30S ribosomal protein S8  62.4 
 
 		 127 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00264712  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2760  30S ribosomal protein S8  60.98 
 
 		 127 aa  159  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000679663  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0333  30S ribosomal protein S8  56.35 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000752194  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  56.49 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 132 aa  145  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  56.59 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0419  SSU ribosomal protein S8P  54.76 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00478629  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  56.59 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  53.91 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  53.91 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  53.91 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  53.91 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  53.91 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  53.91 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  53.91 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  53.91 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  53.12 
 
 		 131 aa  140  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  53.12 
 
 		 131 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  53.12 
 
 		 131 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  53.12 
 
 		 131 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  53.12 
 
 		 131 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  53.12 
 
 		 131 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000109852  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3991  ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246659  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0263  30S ribosomal protein S8  53.12 
 
 		 131 aa  140  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000657656  hitchhiker  0.00182938 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0293  SSU ribosomal protein S8P  53.17 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000301121  hitchhiker  0.00000201574 
 
 
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  53.85 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3461  30S ribosomal protein S8  52.34 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000315626  decreased coverage  0.00455507 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0973  30S ribosomal protein S8  52.34 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000165521  hitchhiker  0.000000973471 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  55.38 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  53.12 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0781  ribosomal protein S8  53.97 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000256719  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  52.34 
 
 		 131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20730  SSU ribosomal protein S8P  57.69 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  52.67 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2310  30S ribosomal protein S8  54.76 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3630  30S ribosomal protein S8  52.34 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000497619  decreased coverage  0.00000000000124793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0328  30S ribosomal protein S8  52.34 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000354136  decreased coverage  0.00289436 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  53.44 
 
 		 134 aa  137  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  51.54 
 
 		 132 aa  137  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17030  SSU ribosomal protein S8P  54.62 
 
 		 132 aa  137  6e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158451  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 132 aa  136  7.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0861  SSU ribosomal protein S8P  52.31 
 
 		 132 aa  136  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118067  hitchhiker  0.00176948 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  56.15 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  52.67 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 133 aa  135  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0472  30S ribosomal protein S8  52.71 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  51.13 
 
 		 135 aa  136  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  50.77 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3324  30S ribosomal protein S8  50.79 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  52.8 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  51.91 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5033  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000369377  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  50.77 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  51.91 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1781  SSU ribosomal protein S8P  51.94 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0284489  normal  0.0855864 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1970  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00042719  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1336  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316434  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3005  30S ribosomal protein S8  52.34 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00104823  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2150  ribosomal protein S8  48.09 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23660  SSU ribosomal protein S8P  56.15 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.06742  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3935  ribosomal protein S8  49.22 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5056  ribosomal protein S8  52.34 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00882416  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0198  30S ribosomal protein S8  50.39 
 
 		 130 aa  134  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421054  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1339  30S ribosomal protein S8  49.61 
 
 		 131 aa  133  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2465  ribosomal protein S8  48.09 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2204  ribosomal protein S8  48.85 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184093  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl137  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 		 129 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5056  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 		 132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  53.08 
 
 		 132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2187  ribosomal protein S8  48.09 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.966556  normal  0.921197 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0299  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 132 aa  133  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3434  30S ribosomal protein S8  49.22 
 
 		 132 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133502  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  52.34 
 
 		 131 aa  133  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  52.67 
 
 		 132 aa  133  8e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4229  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 		 131 aa  133  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00128443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0351  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000194247  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0212  ribosomal protein S8  50 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  133  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  133  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  49.63 
 
 		 134 aa  132  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0844  30S ribosomal protein S8  49.61 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>