More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0092 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0092  30S ribosomal protein S14  100 
 
 
61 aa  125  2e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0813012 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1752  30S ribosomal protein S14  96.72 
 
 
61 aa  123  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2244  30S ribosomal protein S14  91.8 
 
 
61 aa  119  1e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00320341  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0673  30S ribosomal protein S14  90.16 
 
 
61 aa  117  4e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.676771  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2761  ribosomal protein S14  86.89 
 
 
61 aa  114  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  2.81664e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0721  30S ribosomal protein S14  77.05 
 
 
61 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.152627  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2052  ribosomal protein S14  75.41 
 
 
61 aa  101  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0017138  normal  0.052251 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1568  30S ribosomal protein S14  73.77 
 
 
61 aa  101  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.837036  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1239  SSU ribosomal protein S14P  72.13 
 
 
78 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.362958  hitchhiker  0.000818098 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2916  30S ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1099  ribosomal protein S14  73.77 
 
 
61 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1172  30S ribosomal protein S14  72.13 
 
 
61 aa  94.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992885  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2320  ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  94.4  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  2.05328e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0299  ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  94  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.07212e-10  normal  0.0939197 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0771  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 
61 aa  93.6  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.76242e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4013  30S ribosomal protein S14  70.49 
 
 
61 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000290289  hitchhiker  5.94153e-05 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5137  ribosomal protein S14  72.13 
 
 
61 aa  92.8  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.410721 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0575  30S ribosomal protein S14  70.49 
 
 
61 aa  92  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1511  ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3892  SSU ribosomal protein S14P  70.49 
 
 
61 aa  92  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2698  ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  91.3  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0207  SSU ribosomal protein S14P  65.57 
 
 
61 aa  91.3  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00665329  normal  0.463134 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0728  ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  90.5  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1732  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  90.1  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.29581e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4927  ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  3.98171e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3900  30S ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  89.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.119779  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2633  SSU ribosomal protein S14P  70.49 
 
 
61 aa  89.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0670776  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1198  30S ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  89.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0428154 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0319  30S ribosomal protein S14  68.85 
 
 
61 aa  89.4  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0032985 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1849  ribosomal protein S14  60.66 
 
 
61 aa  88.2  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.94553e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0639  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  88.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  5.59173e-13  hitchhiker  9.26519e-09 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0435  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 
61 aa  87.8  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000657507  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2844  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  87.8  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0517993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1079  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  87.8  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0153689  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0238  ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  88.2  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.267646  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2165  ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  87.8  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0123488  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23670  SSU ribosomal protein S14P  65.57 
 
 
61 aa  87.4  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143448  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1148  ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  87.4  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  3.24715e-07  hitchhiker  0.00150384 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09870  SSU ribosomal protein S14P  63.93 
 
 
61 aa  87  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000893021  hitchhiker  1.77439e-05 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264a  30S ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  87  8e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1561  ribosomal protein S14  60.66 
 
 
61 aa  86.7  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000971035  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0860  SSU ribosomal protein S14P  62.3 
 
 
61 aa  86.7  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00017465  hitchhiker  0.00181207 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0714  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  86.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000170249  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0701  ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2447  SSU ribosomal protein S14P  65.57 
 
 
61 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2894  ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  86.3  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2646  ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  86.3  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1720  30S ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  86.7  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4302  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604005  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_002936  DET0487  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 
61 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  1.60451e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3910  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  85.9  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229481  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0464  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 
61 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  3.29078e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_429a  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 
61 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  6.56242e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3130  ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  85.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3654  ribosomal protein S14  58.93 
 
 
56 aa  85.1  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  6.78184e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1171  ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  84.7  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0923192  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1136  ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0600  ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  84.7  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.516663  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0228  ribosomal protein S14  59.02 
 
 
61 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  2.29015e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0278  30S ribosomal protein S14  64.52 
 
 
62 aa  84.3  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00090484  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3992  ribosomal protein S14  72 
 
 
59 aa  84.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116963  normal  0.878683 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0880  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 
61 aa  84.3  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0994  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 
61 aa  84.3  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.106756  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3710  ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  84  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01300  ribosomal protein S14  60.66 
 
 
61 aa  84  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29610  SSU ribosomal protein S14P  65.57 
 
 
61 aa  84  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.975596 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0299  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 
61 aa  84  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0322273  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0777  ribosomal protein S14  60.66 
 
 
61 aa  83.6  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10731  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.606007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5034  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  82.8  1e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  5.80616e-05  normal  0.481269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1335  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  82.8  1e-15  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  1.48473e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1057  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  83.2  1e-15  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  7.11569e-05  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1045  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  83.2  1e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000910706  normal  0.188139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1028  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  83.2  1e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  5.64921e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3418  ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  83.2  1e-15  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0640  ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  83.2  1e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04110  SSU ribosomal protein S14P  63.93 
 
 
61 aa  82.8  2e-15  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1946  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  82  2e-15  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1933  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  82  2e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf429  ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  82.4  2e-15  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2031  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  82  2e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42292  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4494  ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  82  2e-15  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20740  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  82.4  2e-15  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.905824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6601  ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  82.4  2e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1359  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 
61 aa  81.6  3e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  2.05599e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0946  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 
61 aa  82  3e-15  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0139949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3315  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 
61 aa  82  3e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.49399e-10 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1924  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 
61 aa  81.6  3e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.416936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6036  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  82  3e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1818  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  81.3  4e-15  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0693  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  80.9  6e-15  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.180319  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23340  SSU ribosomal protein S14P  57.38 
 
 
61 aa  80.5  7e-15  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  9.71203e-07  hitchhiker  1.3579e-07 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2264  30S ribosomal protein S14  55.74 
 
 
61 aa  80.5  8e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00143207  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2305  30S ribosomal protein S14  55.74 
 
 
61 aa  80.5  8e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00385731  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0490  ribosomal protein S14  59.02 
 
 
61 aa  80.5  8e-15  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0863269  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2142  SSU ribosomal protein S14P  60.66 
 
 
61 aa  80.1  9e-15  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21315  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0340  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  80.1  1e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0510  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  80.1  1e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0183715  hitchhiker  3.49266e-10 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2386  30S ribosomal protein S14  52.46 
 
 
74 aa  79  2e-14  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0124  30S ribosomal protein S14  55.74 
 
 
61 aa  79.3  2e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>