More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0089 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
122 aa  244  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  93.44 
 
 
122 aa  234  4e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  88.52 
 
 
122 aa  224  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  88.52 
 
 
122 aa  221  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  202  9e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  8.16669e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2055  ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  197  4e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000741427  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5060  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  196  1e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.750337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2746  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  196  1e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.014298  normal  0.185382 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  195  2e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3438  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  195  2e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  194  4e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3174  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  194  4e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2305  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  194  4e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0162624  normal  0.103415 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  193  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3657  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  193  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  193  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  193  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1374  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  193  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.439933  normal  0.532331 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1555  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  192  9e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0769  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  192  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234537  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0857  50S ribosomal protein L14P  75.41 
 
 
122 aa  191  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  4.5914e-05  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1259  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  191  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.959032  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3995  ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  191  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219417  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  190  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1364  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  190  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0203367 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0264  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  189  8e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188398  normal  0.453731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0570  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  189  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0295  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  189  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2808  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  187  3e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0601  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  187  3e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0343  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  187  3e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867842  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0636  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  188  3e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.43899e-10  hitchhiker  1.09372e-08 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  187  3e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  187  3e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  187  3e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  187  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2191  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  187  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0996  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  187  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1668  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  187  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0136083  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1440  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  187  6e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4594  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1076  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  187  6e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2208  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  186  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.905763  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1850  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  186  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1342  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0385141  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2028  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479722  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0676  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  185  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  4.48087e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1936  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0708  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  185  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000253605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3318  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  185  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.62831e-12 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1943  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0943  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  185  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00200525  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0337  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  184  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15874  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0507  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  184  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0120188  hitchhiker  2.90326e-10 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1343  50S ribosomal protein MRPL14P  73.98 
 
 
123 aa  185  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0499  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  184  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  1.01997e-08  decreased coverage  0.00104649 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1356  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  185  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0481946  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0494  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  184  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  5.12994e-07  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00948  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  184  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  6.86211e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1936  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  184  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0969  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  184  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  4.61836e-05  hitchhiker  1.00945e-06 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  73.77 
 
 
122 aa  183  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0729  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  184  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0102983  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0436  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  183  6e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  4.33356e-11  hitchhiker  9.95227e-05 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2976  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  183  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4266  ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  183  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  8.98489e-08  unclonable  3.02699e-12 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0766  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  2e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115755  normal  0.0767388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3899  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  2e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00304511  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  181  2e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2362  ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  182  2e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.956656  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0711  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  182  2e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.21544e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5069  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  1.72755e-14  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0636  ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  3.79152e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0494  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0424686  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3058  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000279075  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0464  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825158  hitchhiker  2.7231e-06 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3794  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4739  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0254345  normal  0.940147 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3488  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2622  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328806  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1275  ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  181  3e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0497  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  3.05715e-05  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0259  ribosomal protein L14  72.95 
 
 
162 aa  181  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00518224  hitchhiker  0.00445283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1918  50S ribosomal protein L14  73.11 
 
 
119 aa  181  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.320617  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1934  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  3.3095e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2469  50S ribosomal protein L14  73.11 
 
 
119 aa  181  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.315328  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3159  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  9.01692e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3766  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000108255  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3736  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  1.83624e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2154  50S ribosomal protein L14  73.11 
 
 
119 aa  181  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.776638 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4538  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.118021 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2940  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  181  4e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  1.58675e-06  hitchhiker  3.86502e-06 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3287  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  181  4e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  1.57529e-09  decreased coverage  5.79661e-07 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1624  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  181  4e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118658  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4233  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  181  4e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  9.45972e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3009  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  181  4e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000263087  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3307  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  180  5e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  5.45042e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3169  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  180  5e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  2.5532e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08950  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  180  5e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.459474  normal  0.0351235 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0408  ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  180  5e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.900032  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0847  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  180  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.226508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>