293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0087 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 61 aa  120  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  77.05 
 
 		 62 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  68.33 
 
 		 61 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2766  ribosomal protein L29  60 
 
 		 67 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105507  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  53.33 
 
 		 67 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0668  ribosomal protein L29  58.62 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0746889  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2057  ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00051227  normal  0.0499513 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  53.45 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1348  ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 72 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 67 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 68 aa  63.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  50 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  56.36 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 66 aa  62  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  50.85 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  54.55 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0696  ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  48.21 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  48.28 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0459  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424556  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  52.54 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  52.73 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0716  ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.762697  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  46.55 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  48.33 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  46.55 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 77 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_425  ribosomal protein L29  45 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192974  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  48.21 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29660  LSU ribosomal protein L29P  50.88 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1094  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0709  ribosomal protein L29  50 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1177  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267445  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  45 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0482  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.411328  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  48.28 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1715  50S ribosomal protein L29  55.81 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4018  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186553  hitchhiker  0.00000457744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  45 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0961  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00226195  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0599  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0635  ribosomal protein L29  45 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17080  LSU ribosomal protein L29P  45 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00253403  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2967  50S ribosomal protein L29P  43.33 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115661  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  43.86 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  46.43 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  43.33 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  52.73 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1131  ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 80 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2651  ribosomal protein L29  45 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2679  ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  50.88 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0727  ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000905771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 66 aa  52  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1941  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1938  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>