293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0087 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  100 
 
 
61 aa  120  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  77.05 
 
 
62 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.85964e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  68.33 
 
 
61 aa  80.9  5e-15  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2766  ribosomal protein L29  60 
 
 
67 aa  73.2  1e-12  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  1.05507e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  53.33 
 
 
67 aa  69.7  1e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0668  ribosomal protein L29  58.62 
 
 
76 aa  68.2  4e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0746889  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2057  ribosomal protein L29  51.67 
 
 
67 aa  65.1  3e-10  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00051227  normal  0.0499513 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 
66 aa  64.7  4e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  53.45 
 
 
88 aa  64.7  4e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1348  ribosomal protein L29  48.33 
 
 
72 aa  64.7  4e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 
67 aa  63.9  7e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
68 aa  63.9  7e-10  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  56.36 
 
 
64 aa  62.8  1e-09  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  1.5632e-06 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 
66 aa  62.8  1e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  50 
 
 
77 aa  63.2  1e-09  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 
66 aa  62.8  1e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
66 aa  62  2e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 
66 aa  62.8  2e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  50.85 
 
 
85 aa  61.6  3e-09  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  46.67 
 
 
71 aa  61.2  5e-09  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 
66 aa  61.2  5e-09  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  54.55 
 
 
64 aa  60.5  9e-09  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 
66 aa  59.7  1e-08  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 
66 aa  59.7  1e-08  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  51.67 
 
 
71 aa  59.7  1e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
66 aa  60.1  1e-08  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  8.68112e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
79 aa  60.1  1e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
66 aa  60.1  1e-08  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  5.55374e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0696  ribosomal protein L29  46.67 
 
 
83 aa  58.9  2e-08  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 
68 aa  59.3  2e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 
68 aa  59.3  2e-08  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 
74 aa  59.3  2e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
68 aa  59.3  2e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  58.9  2e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
74 aa  58.5  3e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  48.21 
 
 
78 aa  58.5  3e-08  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  48.28 
 
 
83 aa  58.5  3e-08  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 
77 aa  58.5  3e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  48.28 
 
 
76 aa  58.5  3e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 
77 aa  57.8  4e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
66 aa  57.8  5e-08  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  2.47048e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
66 aa  57.8  5e-08  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  5.0767e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  52.54 
 
 
83 aa  57.8  5e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0459  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
65 aa  57.8  5e-08  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  4.24556e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0716  ribosomal protein L29  49.12 
 
 
62 aa  57.4  7e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.762697  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  52.73 
 
 
69 aa  57.4  7e-08  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  1.27538e-06  hitchhiker  8.55419e-07 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  46.55 
 
 
67 aa  57  8e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  2.5985e-05  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  46.55 
 
 
77 aa  57  8e-08  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  48.33 
 
 
77 aa  57  8e-08  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
77 aa  57  9e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  48.33 
 
 
68 aa  56.6  1e-07  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 
68 aa  56.6  1e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  48.21 
 
 
83 aa  56.6  1e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29660  LSU ribosomal protein L29P  50.88 
 
 
79 aa  56.6  1e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_425  ribosomal protein L29  45 
 
 
65 aa  56.2  1e-07  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.92974e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 
77 aa  55.8  2e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1094  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
78 aa  55.8  2e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 
77 aa  55.8  2e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 
77 aa  55.8  2e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0709  ribosomal protein L29  50 
 
 
62 aa  55.5  2e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.96069e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  45 
 
 
92 aa  56.2  2e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
68 aa  56.2  2e-07  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1177  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 
71 aa  55.8  2e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267445  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
64 aa  56.2  2e-07  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 
78 aa  56.2  2e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
69 aa  55.1  3e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1715  50S ribosomal protein L29  55.81 
 
 
83 aa  55.1  3e-07  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
64 aa  55.5  3e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  2.58995e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
69 aa  55.1  3e-07  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_002936  DET0482  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
65 aa  55.5  3e-07  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.411328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4018  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 
66 aa  55.1  3e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186553  hitchhiker  4.57744e-06 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  48.28 
 
 
80 aa  55.1  3e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 
67 aa  55.1  3e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
69 aa  54.7  4e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0961  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  54.7  4e-07  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00226195  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  45 
 
 
84 aa  54.7  4e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
68 aa  54.3  5e-07  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
62 aa  54.3  6e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.69135e-08  hitchhiker  3.34263e-09 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  45.61 
 
 
71 aa  54.3  6e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  45.61 
 
 
71 aa  54.3  6e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  45.61 
 
 
71 aa  54.3  6e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0599  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 
69 aa  54.3  6e-07  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17080  LSU ribosomal protein L29P  45 
 
 
89 aa  53.9  7e-07  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00253403  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
69 aa  53.9  7e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  43.86 
 
 
77 aa  53.9  7e-07  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2967  50S ribosomal protein L29P  43.33 
 
 
109 aa  53.9  7e-07  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115661  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0635  ribosomal protein L29  45 
 
 
78 aa  53.9  7e-07  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  45 
 
 
63 aa  53.9  8e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
70 aa  53.5  9e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  4.11175e-07  hitchhiker  3.90358e-09 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  46.43 
 
 
68 aa  53.5  9e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0727  ribosomal protein L29  48.33 
 
 
63 aa  53.1  1e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000905771  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2651  ribosomal protein L29  45 
 
 
78 aa  53.5  1e-06  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  43.33 
 
 
65 aa  53.1  1e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2679  ribosomal protein L29  45.61 
 
 
109 aa  53.1  1e-06  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  52.73 
 
 
68 aa  53.5  1e-06  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  50.88 
 
 
68 aa  53.1  1e-06  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1131  ribosomal protein L29  43.86 
 
 
80 aa  53.5  1e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1938  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 
73 aa  52.8  2e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  39.34 
 
 
68 aa  52.4  2e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  44.83 
 
 
71 aa  52.4  2e-06  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  2.0056e-07  hitchhiker  2.41726e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>