More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0086 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0086  50S ribosomal protein L16  100 
 
 
137 aa  274  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391105 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1758  50S ribosomal protein L16  91.97 
 
 
137 aa  258  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.160083  normal  0.394515 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0667  50S ribosomal protein L16  89.78 
 
 
137 aa  256  5e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00972373  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2250  50S ribosomal protein L16  82.48 
 
 
137 aa  232  1e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  6.31878e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2767  ribosomal protein L16  79.26 
 
 
135 aa  220  5e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  1.62016e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2058  ribosomal protein L16  66.91 
 
 
137 aa  192  9e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000772955  normal  0.0851183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  67.15 
 
 
138 aa  188  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  64.96 
 
 
144 aa  179  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 
140 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 
141 aa  178  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0854  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 
137 aa  178  3e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  6.06887e-05  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 
139 aa  177  5e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 
141 aa  176  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.40858e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 
139 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 
147 aa  175  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.21329e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 
139 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  62.77 
 
 
151 aa  174  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3436  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 
138 aa  174  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.109776  normal  0.197856 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0412  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 
138 aa  174  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  7.49036e-07  normal  0.231316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 
137 aa  174  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 
142 aa  174  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1961  ribosomal protein L16  61.03 
 
 
141 aa  173  7e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.564853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
140 aa  173  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.66771e-08  hitchhiker  4.46584e-09 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 
145 aa  173  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1931  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
138 aa  172  1e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  2.46201e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0967  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
137 aa  172  1e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104122  hitchhiker  1.06632e-06 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 
139 aa  172  1e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3739  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
138 aa  172  1e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3061  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
138 aa  172  1e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000117854  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 
144 aa  172  1e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3797  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
138 aa  172  1e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3485  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
138 aa  172  1e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00369776  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3162  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
138 aa  172  1e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  3.64503e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3769  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
138 aa  172  1e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  1.65417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2625  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
138 aa  172  1e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.623647  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3992  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
138 aa  171  3e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.29687e-05 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2833  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
138 aa  171  3e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  2.61677e-05  normal  0.482727 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0256  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
138 aa  171  3e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00173139  normal  0.0172892 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 
139 aa  171  3e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
140 aa  171  4e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47904e-12 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
140 aa  171  4e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1697  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 
141 aa  171  4e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000686182  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2074  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 
141 aa  171  4e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0136024  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1868  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 
141 aa  171  4e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0066  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
141 aa  171  4e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0038879  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  61.19 
 
 
140 aa  170  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3637  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
138 aa  170  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  6.27073e-06  hitchhiker  1.81124e-11 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1037  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 
138 aa  170  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688868  normal  0.447674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0321  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
138 aa  170  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  9.04365e-05  decreased coverage  0.00244098 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1020  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 
138 aa  170  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190561  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1047  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 
138 aa  170  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.962938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 
140 aa  170  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.19005e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0057  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 
137 aa  170  6e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  2.74594e-14  hitchhiker  4.45125e-19 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0060  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 
137 aa  170  6e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  2.62847e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0283  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
138 aa  170  6e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  4.5602e-08  normal  0.0248702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0274  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
138 aa  170  6e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4019  50S ribosomal protein L16  62.77 
 
 
141 aa  170  7e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261659  hitchhiker  5.10081e-06 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5131  ribosomal protein L16  61.03 
 
 
137 aa  169  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77654 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0428  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
137 aa  169  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0983834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
140 aa  169  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0355  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
138 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  1.76857e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3454  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
138 aa  168  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  5.81922e-08  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0293  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
141 aa  168  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0021896  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2752  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
138 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  9.62733e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
140 aa  168  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0334  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
138 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  8.96805e-05  normal  0.0198335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  62.04 
 
 
145 aa  168  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0401  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
137 aa  167  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1026  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 
141 aa  168  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00185253  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0376  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
137 aa  167  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  59.12 
 
 
144 aa  167  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5042  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 
138 aa  168  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00611241  normal  0.174144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3441  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 
137 aa  167  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3310  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 
138 aa  167  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  3.36027e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1178  50S ribosomal protein L16  62.77 
 
 
141 aa  167  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371003  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0496  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
137 aa  167  4e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  8.77255e-09  hitchhiker  0.00385796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2302  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 
137 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.102886 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 
142 aa  167  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3751  ribosomal protein L16  61.48 
 
 
138 aa  167  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.596484  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  62.22 
 
 
145 aa  167  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3177  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
137 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.943989 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2317  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
137 aa  167  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  2.21172e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10722  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 
138 aa  167  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.567895  normal  0.164294 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0491  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
137 aa  167  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  4.19023e-07  normal  0.026966 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  59.12 
 
 
139 aa  167  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  3.86576e-07  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 
158 aa  166  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2943  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
138 aa  166  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000488638  hitchhiker  7.40815e-07 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3290  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
138 aa  166  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  4.83098e-05  decreased coverage  5.29176e-07 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2162  ribosomal protein L16  60 
 
 
137 aa  166  8e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00554254  normal  0.180391 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3012  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
138 aa  166  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  5.99816e-08  normal  0.0124022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1312  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 
138 aa  166  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158825 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 
139 aa  166  9e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.57972e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 
139 aa  166  9e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3172  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
138 aa  166  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  5.21521e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4269  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
137 aa  166  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  8.32167e-07  unclonable  3.55687e-12 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0398  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 
138 aa  166  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0041  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 
141 aa  166  1e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.123597  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0465  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 
137 aa  166  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  58.52 
 
 
137 aa  165  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 
139 aa  165  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>