More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0084 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0084  50S ribosomal protein L22  100 
 
 
112 aa  227  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100288 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1760  50S ribosomal protein L22  83.04 
 
 
112 aa  204  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0923883  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0665  50S ribosomal protein L22  79.46 
 
 
112 aa  192  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2252  50S ribosomal protein L22  78.9 
 
 
110 aa  180  5e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  4.07093e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2060  ribosomal protein L22  63.3 
 
 
110 aa  151  3e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  3.00396e-06  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2769  ribosomal protein L22  57.8 
 
 
110 aa  129  1e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  9.88714e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  56.88 
 
 
110 aa  127  5e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  58.56 
 
 
111 aa  127  5e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  53.21 
 
 
110 aa  124  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.43227e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  58.72 
 
 
110 aa  124  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  56.07 
 
 
118 aa  122  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0761  50S ribosomal protein L22  55.14 
 
 
111 aa  121  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305048  decreased coverage  0.00987219 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  54.05 
 
 
111 aa  121  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  50.89 
 
 
113 aa  120  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  53.27 
 
 
113 aa  121  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  7.20413e-06  hitchhiker  8.29756e-05 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04516  50S ribosomal protein L22  55.14 
 
 
111 aa  120  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  2.01226e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  53.21 
 
 
110 aa  118  2e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.16767e-06  hitchhiker  1.3248e-09 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  51.38 
 
 
110 aa  119  2e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  3.32367e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  51.43 
 
 
114 aa  118  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0298  ribosomal protein L22  52.29 
 
 
112 aa  117  4e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.495087  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4312  50S ribosomal protein L22  53.21 
 
 
110 aa  117  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.84145e-06  unclonable  4.44445e-11 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0189  50S ribosomal protein L22  53.21 
 
 
110 aa  117  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  9.13672e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4685  50S ribosomal protein L22  53.21 
 
 
110 aa  117  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  4.90323e-05  unclonable  1.56346e-08 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  50.46 
 
 
110 aa  117  8e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  50.45 
 
 
114 aa  116  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0175  50S ribosomal protein L22  52.29 
 
 
110 aa  115  1e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.21106e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  51.38 
 
 
110 aa  116  1e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  8.50597e-05  decreased coverage  4.66099e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  52.29 
 
 
110 aa  116  1e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  2.02891e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  49.55 
 
 
111 aa  115  2e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  2.33531e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  50.46 
 
 
110 aa  115  2e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  9.66371e-07  unclonable  7.08625e-06 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3519  ribosomal protein L22  49.54 
 
 
111 aa  115  2e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000743779  hitchhiker  8.6131e-07 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  51.82 
 
 
110 aa  114  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0204  50S ribosomal protein L22  51.38 
 
 
110 aa  114  4e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.3887e-09  hitchhiker  1.2298e-09 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4051  50S ribosomal protein L22  51.38 
 
 
110 aa  114  4e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  6.08091e-06  unclonable  5.72517e-12 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0199  50S ribosomal protein L22  51.38 
 
 
110 aa  114  4e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0119828  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0201  50S ribosomal protein L22  51.38 
 
 
110 aa  114  4e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.91248e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  51.38 
 
 
110 aa  114  4e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0204  50S ribosomal protein L22  51.38 
 
 
110 aa  114  4e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.74538e-05  unclonable  1.70547e-11 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  51.38 
 
 
110 aa  114  4e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  3.7277e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  51.38 
 
 
110 aa  114  4e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  7.08825e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0205  50S ribosomal protein L22  51.38 
 
 
110 aa  114  4e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.76221e-05  unclonable  8.89639e-06 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  53.7 
 
 
115 aa  114  4e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1916  50S ribosomal protein L22  50.93 
 
 
144 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.58558 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  53.21 
 
 
111 aa  114  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  1.86157e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  47.71 
 
 
158 aa  113  9e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  55.05 
 
 
115 aa  112  2e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
117 aa  112  2e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  4.19164e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  51.38 
 
 
118 aa  112  2e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  51.4 
 
 
125 aa  112  2e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
117 aa  112  2e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
117 aa  112  2e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  6.96854e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0332  50S ribosomal protein L22  55.05 
 
 
111 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  50.98 
 
 
152 aa  111  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  50.98 
 
 
152 aa  111  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 
110 aa  111  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  9.51613e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  54.95 
 
 
113 aa  111  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.76049e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0502  50S ribosomal protein L22  55.05 
 
 
111 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195927  hitchhiker  2.90326e-10 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  50.46 
 
 
110 aa  111  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  3.77263e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 
113 aa  111  4e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.08329e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 
113 aa  111  4e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 
113 aa  111  4e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  6.21136e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 
113 aa  111  4e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 
113 aa  111  4e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 
113 aa  111  4e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.6654e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  50.46 
 
 
110 aa  110  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 
113 aa  110  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.05775e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0724  50S ribosomal protein L22  53.21 
 
 
110 aa  110  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  9.76773e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  47.32 
 
 
113 aa  110  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.70436e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  53.21 
 
 
111 aa  110  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  53.21 
 
 
111 aa  110  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.76786e-14 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  50.47 
 
 
125 aa  110  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
113 aa  110  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 
113 aa  110  8e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  9.071e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 
113 aa  110  8e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  8.18335e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 
113 aa  110  8e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.64158e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 
113 aa  110  8e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.02093e-10  unclonable  1.16173e-25 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  50.89 
 
 
113 aa  109  1e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  1.99226e-06  hitchhiker  1.04974e-07 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2164  ribosomal protein L22  50.46 
 
 
112 aa  109  1e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.135391 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  50.94 
 
 
136 aa  109  1e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  50.45 
 
 
111 aa  109  1e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  47.32 
 
 
113 aa  109  1e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0342  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 
115 aa  108  2e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.62922e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  49.53 
 
 
117 aa  109  2e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  52.34 
 
 
114 aa  108  2e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1849  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 
115 aa  108  2e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000192046  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  48.54 
 
 
146 aa  108  2e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
120 aa  108  2e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  1.68861e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  52.34 
 
 
114 aa  108  2e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 
110 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  45.54 
 
 
113 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.93561e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  50.46 
 
 
113 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  50 
 
 
120 aa  107  4e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  4.40865e-07  hitchhiker  5.62165e-07 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 
159 aa  107  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  7.88979e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  49.54 
 
 
110 aa  107  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  51.85 
 
 
116 aa  107  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  46.73 
 
 
159 aa  107  7e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  4.69382e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  46.43 
 
 
113 aa  107  8e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2150  50S ribosomal protein L22P  52.38 
 
 
127 aa  106  9e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0058  50S ribosomal protein L22  47.22 
 
 
109 aa  106  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  6.80937e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  53.7 
 
 
136 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>