More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0077 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  59.23 
 
 
698 aa  850  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  5.05947e-07 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  63 
 
 
704 aa  899  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.62154e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  60.79 
 
 
693 aa  880  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  61.88 
 
 
691 aa  898  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.12943e-07  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04525  elongation factor G  60.2 
 
 
690 aa  851  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00693327  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3300  elongation factor G  60.45 
 
 
723 aa  885  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00108075  hitchhiker  0.00222959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  62.86 
 
 
700 aa  899  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  6.46434e-05  hitchhiker  4.15866e-10 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3172  elongation factor G  62.34 
 
 
701 aa  884  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384126  hitchhiker  0.00453685 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4484  elongation factor G  63.43 
 
 
700 aa  871  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.707132  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3714  elongation factor G  61.17 
 
 
704 aa  881  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.97299e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1424  translation elongation factor G  57.58 
 
 
700 aa  837  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.477133  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  63.57 
 
 
700 aa  911  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0561  translation elongation factor G  63.48 
 
 
701 aa  897  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432328  hitchhiker  0.000385562 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2102  elongation factor G  60.2 
 
 
705 aa  858  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.990923  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2446  elongation factor G  63.48 
 
 
703 aa  899  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  1.47912e-07 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0273  elongation factor G  64 
 
 
700 aa  909  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823209  normal  0.369004 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0047  elongation factor G  62.14 
 
 
700 aa  863  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  2.9839e-09  decreased coverage  6.96868e-24 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  66.14 
 
 
692 aa  964  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  61.77 
 
 
704 aa  880  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  62.52 
 
 
704 aa  903  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  3.38261e-05  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3341  elongation factor G  62.29 
 
 
699 aa  884  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  5.27224e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  60.03 
 
 
691 aa  848  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  63.39 
 
 
692 aa  904  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.90247e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4649  elongation factor G  61.17 
 
 
704 aa  881  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  3.44499e-07  normal  0.01673 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0312  elongation factor G  59.91 
 
 
695 aa  836  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000568119  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  61.98 
 
 
699 aa  910  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  1.39334e-08 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3814  elongation factor G  61.74 
 
 
704 aa  860  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133333  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3643  elongation factor G  61.74 
 
 
704 aa  860  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  6.61479e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  65.8 
 
 
692 aa  955  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  63.19 
 
 
697 aa  929  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  58.47 
 
 
692 aa  849  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  8.15728e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3642  elongation factor G  61.74 
 
 
704 aa  860  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.156207  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3751  elongation factor G  61.74 
 
 
704 aa  860  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.491712  normal  0.0846164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3716  elongation factor G  61.74 
 
 
704 aa  860  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0927216  normal  0.0969109 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0753  elongation factor G  61.24 
 
 
713 aa  882  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.026843  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0286  elongation factor G  62 
 
 
704 aa  888  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00220543  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3863  elongation factor G  61.2 
 
 
700 aa  871  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2192  elongation factor G  60.2 
 
 
705 aa  860  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.857068  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0356  elongation factor G  58.99 
 
 
691 aa  840  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2307  translation elongation factor G  60.71 
 
 
700 aa  868  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0388  elongation factor G  59.14 
 
 
702 aa  852  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00665506  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0237  elongation factor G  59.89 
 
 
705 aa  859  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000318631  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  59.23 
 
 
698 aa  850  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  1.82182e-05 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3277  elongation factor G  61.66 
 
 
701 aa  864  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0394176  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  61.58 
 
 
698 aa  884  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  63.64 
 
 
698 aa  895  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0181  elongation factor G  60.63 
 
 
698 aa  839  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  3.44622e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4549  elongation factor G  60.88 
 
 
704 aa  884  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  4.85563e-08  normal  0.0800773 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2537  translation elongation factor G  59.2 
 
 
701 aa  857  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3809  elongation factor G  61.17 
 
 
704 aa  881  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.25417e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3536  elongation factor G  61.17 
 
 
704 aa  881  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.52954e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00055  elongation factor G  60.57 
 
 
699 aa  852  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  62.91 
 
 
701 aa  882  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  4.45234e-07 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  61.55 
 
 
699 aa  889  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1676  elongation factor G  59.86 
 
 
691 aa  848  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377788  hitchhiker  0.000311159 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  64.57 
 
 
700 aa  913  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0766  elongation factor G  64.05 
 
 
701 aa  907  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  3.20192e-05 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  61.55 
 
 
699 aa  889  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.03691e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2552  elongation factor G  64.62 
 
 
703 aa  913  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975271  hitchhiker  0.000776621 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0324  elongation factor G  64 
 
 
700 aa  910  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00564924  normal  0.0493558 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4693  elongation factor G  60.29 
 
 
698 aa  838  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  8.36363e-06  unclonable  6.46786e-08 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2215  elongation factor G  58.99 
 
 
691 aa  841  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226947  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4752  elongation factor G  58.26 
 
 
714 aa  858  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0168923  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3385  elongation factor G  57.29 
 
 
703 aa  838  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3621  elongation factor G  61.17 
 
 
704 aa  881  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.94361e-06  hitchhiker  0.000724432 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0373  elongation factor G  61.17 
 
 
704 aa  881  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  4.19107e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0277  elongation factor G  62.34 
 
 
702 aa  890  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  1.12388e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  60.87 
 
 
689 aa  877  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3684  elongation factor G  57.37 
 
 
706 aa  837  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312611  hitchhiker  0.00286415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0481  elongation factor G  58.26 
 
 
714 aa  858  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0301247  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  63.97 
 
 
689 aa  909  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  3.06199e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  63.82 
 
 
692 aa  908  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.76822e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2159  elongation factor G  58.7 
 
 
691 aa  839  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.894134 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3675  elongation factor G  62.34 
 
 
702 aa  890  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  1.79981e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2733  translation elongation factor G  61.16 
 
 
691 aa  874  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.167208 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  60.35 
 
 
692 aa  860  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002299  translation elongation factor G  60.57 
 
 
699 aa  866  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.15857e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3804  translation elongation factor G  61.68 
 
 
701 aa  878  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587249  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0320  translation elongation factor G  61.66 
 
 
699 aa  871  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  4.39347e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4007  elongation factor G  61.02 
 
 
704 aa  851  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  2.80538e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  63.44 
 
 
689 aa  911  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  61.88 
 
 
690 aa  872  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  8.16454e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1117  elongation factor G  61.33 
 
 
698 aa  853  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  70.14 
 
 
689 aa  1033  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  4.50896e-07  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  63.11 
 
 
691 aa  914  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.88442e-06  decreased coverage  2.4327e-05 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  63.19 
 
 
691 aa  905  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0960  translation elongation factor G  61.86 
 
 
705 aa  875  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000224995  decreased coverage  7.93105e-13 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  61.39 
 
 
698 aa  875  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  3.82661e-07  hitchhiker  1.23904e-06 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  61.63 
 
 
699 aa  876  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  71.45 
 
 
689 aa  1028  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  57.68 
 
 
690 aa  856  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  62.93 
 
 
700 aa  883  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  1.70843e-05  decreased coverage  8.39395e-11 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  61.36 
 
 
706 aa  867  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  63.49 
 
 
703 aa  897  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  60.98 
 
 
692 aa  895  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  1.42734e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  60.84 
 
 
704 aa  870  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  62.5 
 
 
700 aa  884  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3467  translation elongation factor G  60.52 
 
 
701 aa  866  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0283568  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2662  translation elongation factor G  61.34 
 
 
700 aa  868  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  60.81 
 
 
699 aa  862  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>