237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0073 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0073  protein of unknown function DUF45  100 
 
 		 316 aa  617  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.658711 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  36.43 
 
 		 244 aa  146  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2109  protein of unknown function DUF45  32.46 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1657  protein of unknown function DUF45  35.77 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1535  hypothetical protein  34.6 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.714061 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1561  zinc protease, putative  33.09 
 
 		 244 aa  136  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0788  protein of unknown function DUF45  32.33 
 
 		 241 aa  133  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0661  zinc protease, putative  33.2 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  0.0577046 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0875  protein of unknown function DUF45  34.62 
 
 		 240 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0904  hypothetical protein  31.03 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1772  hypothetical protein  34.07 
 
 		 232 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236777  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2732  hypothetical protein  30.3 
 
 		 240 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1381  protein of unknown function DUF45  32.08 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.263783  normal  0.318048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  25.5 
 
 		 262 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2267  hypothetical protein  40.62 
 
 		 217 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.083076  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  38.1 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  31.06 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  23.92 
 
 		 240 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  22.31 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  43.48 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  39.74 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  22.52 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  29.37 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  30.6 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  33.64 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  22.96 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  39.47 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  23.18 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  42.22 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  28.06 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  23.63 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  45.83 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  34.43 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  44.44 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  36.08 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  24.9 
 
 		 241 aa  67  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  27.34 
 
 		 265 aa  67  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  32.26 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  37.18 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  32.26 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  36.19 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  36.19 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  36.94 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  34.81 
 
 		 237 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  33.68 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  36.8 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  47.62 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  19.35 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  38.24 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  37.88 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  31.47 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  36.94 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  42.11 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  34.62 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  33.04 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  25.9 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  37.08 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  37.74 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  35.16 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  24.9 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  24.03 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  28.1 
 
 		 239 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  32.23 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  34.31 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  23.02 
 
 		 481 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  32.69 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  26.51 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  34.69 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  30.97 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  31.15 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  31.15 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  31.86 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  31.15 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  31.86 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  31.15 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  31.15 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  28.38 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  32.38 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  34.09 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  36.19 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  36.19 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  31.73 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  30.97 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  41.79 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  24.55 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  30.97 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  25.93 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  30.97 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  30.97 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  30.97 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  30.97 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  30.97 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  30.6 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  30.63 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2818  hypothetical protein  39.78 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2855  hypothetical protein  37.14 
 
 		 252 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  31.06 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0060  protein of unknown function DUF45  27.98 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>