237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0073 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0073  protein of unknown function DUF45  100 
 
 
316 aa  617  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.658711 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  36.43 
 
 
244 aa  146  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2109  protein of unknown function DUF45  32.46 
 
 
249 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1657  protein of unknown function DUF45  35.77 
 
 
244 aa  141  1e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1535  hypothetical protein  34.6 
 
 
238 aa  140  2e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.714061 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1561  zinc protease, putative  33.09 
 
 
244 aa  136  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0788  protein of unknown function DUF45  32.33 
 
 
241 aa  133  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0661  zinc protease, putative  33.2 
 
 
243 aa  127  2e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  0.0577046 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0875  protein of unknown function DUF45  34.62 
 
 
240 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0904  hypothetical protein  31.03 
 
 
251 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1772  hypothetical protein  34.07 
 
 
232 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236777  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2732  hypothetical protein  30.3 
 
 
240 aa  111  2e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1381  protein of unknown function DUF45  32.08 
 
 
229 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.263783  normal  0.318048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  25.5 
 
 
262 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2267  hypothetical protein  40.62 
 
 
217 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.083076  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  38.1 
 
 
249 aa  82.8  7e-15  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  31.06 
 
 
244 aa  80.1  4e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  23.92 
 
 
240 aa  79  1e-13  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  22.31 
 
 
252 aa  78.2  2e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  43.48 
 
 
241 aa  77  4e-13  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  39.74 
 
 
217 aa  75.1  1e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  22.52 
 
 
245 aa  74.7  2e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  29.37 
 
 
245 aa  73.9  3e-12  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  33.64 
 
 
240 aa  73.9  3e-12  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  30.6 
 
 
240 aa  73.9  3e-12  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  22.96 
 
 
242 aa  72.8  7e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  39.47 
 
 
243 aa  72.4  9e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  23.18 
 
 
237 aa  70.5  3e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  42.22 
 
 
221 aa  70.1  5e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  28.06 
 
 
244 aa  69.7  7e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  23.63 
 
 
237 aa  68.6  1e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  45.83 
 
 
242 aa  68.2  2e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  44.44 
 
 
268 aa  67.4  3e-10  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  34.43 
 
 
288 aa  67.8  3e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  36.08 
 
 
238 aa  67.4  3e-10  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  27.34 
 
 
265 aa  67  4e-10  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  32.26 
 
 
300 aa  67  4e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  24.9 
 
 
241 aa  67  4e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  37.18 
 
 
251 aa  66.6  5e-10  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  32.26 
 
 
300 aa  66.2  6e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  36.19 
 
 
292 aa  66.2  7e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  36.19 
 
 
292 aa  66.2  8e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  36.8 
 
 
303 aa  65.1  1e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  34.81 
 
 
237 aa  65.5  1e-09  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  36.94 
 
 
228 aa  65.1  1e-09  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  33.68 
 
 
261 aa  65.5  1e-09  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  47.62 
 
 
258 aa  64.7  2e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  42.11 
 
 
227 aa  64.7  2e-09  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  38.24 
 
 
242 aa  64.7  2e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  31.47 
 
 
256 aa  64.3  2e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  19.35 
 
 
224 aa  64.3  2e-09  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  37.88 
 
 
225 aa  65.1  2e-09  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  36.94 
 
 
228 aa  65.1  2e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  34.62 
 
 
318 aa  64.3  3e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  25.9 
 
 
249 aa  63.9  4e-09  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  33.04 
 
 
292 aa  63.5  4e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  37.08 
 
 
240 aa  63.5  5e-09  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  35.16 
 
 
249 aa  63.5  5e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  37.74 
 
 
310 aa  63.2  5e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  24.03 
 
 
227 aa  63.2  6e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  24.9 
 
 
251 aa  63.2  6e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  31.15 
 
 
303 aa  62  1e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  32.23 
 
 
286 aa  62  1e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  28.1 
 
 
239 aa  62  1e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  34.69 
 
 
246 aa  62  1e-08  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  26.51 
 
 
266 aa  61.6  1e-08  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  34.31 
 
 
278 aa  61.6  1e-08  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  23.02 
 
 
481 aa  62  1e-08  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  30.97 
 
 
301 aa  62.4  1e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  31.15 
 
 
295 aa  61.6  1e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  32.69 
 
 
279 aa  62  1e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  31.15 
 
 
295 aa  61.6  2e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  31.15 
 
 
316 aa  61.2  2e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  28.38 
 
 
235 aa  61.2  2e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  31.86 
 
 
295 aa  61.6  2e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  31.86 
 
 
285 aa  61.2  2e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  33.33 
 
 
219 aa  61.6  2e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  31.15 
 
 
295 aa  61.6  2e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  36.19 
 
 
306 aa  60.8  3e-08  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  34.09 
 
 
198 aa  60.8  3e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  32.38 
 
 
263 aa  60.5  3e-08  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  36.19 
 
 
306 aa  60.8  3e-08  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  41.79 
 
 
270 aa  60.5  4e-08  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  31.73 
 
 
285 aa  60.1  4e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  30.97 
 
 
292 aa  60.5  4e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  30.97 
 
 
292 aa  60.1  5e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  25.93 
 
 
224 aa  60.1  5e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  30.97 
 
 
292 aa  60.1  5e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  24.55 
 
 
223 aa  60.1  5e-08  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  30.97 
 
 
292 aa  60.1  5e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  30.97 
 
 
292 aa  60.1  5e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  30.97 
 
 
292 aa  60.1  5e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  30.97 
 
 
292 aa  60.1  5e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  30.6 
 
 
340 aa  59.7  6e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  30.63 
 
 
238 aa  59.7  6e-08  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  28.57 
 
 
244 aa  59.7  6e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0060  protein of unknown function DUF45  27.98 
 
 
259 aa  58.5  1e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2855  hypothetical protein  37.14 
 
 
252 aa  58.9  1e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  36.79 
 
 
227 aa  58.9  1e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  31.06 
 
 
314 aa  58.9  1e-07  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>