21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0071 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0071  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  371  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233632 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2270  hypothetical protein  53.14 
 
 		 176 aa  205  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1774  hypothetical protein  47.73 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.428331  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0452  hypothetical protein  37.65 
 
 		 175 aa  140  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0660965  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1145  hypothetical protein  33.52 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.731789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0234  hypothetical protein  33.14 
 
 		 189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.621002 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0255  hypothetical protein  35.19 
 
 		 196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1607  hypothetical protein  35.76 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0269  hypothetical protein  30.23 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133845  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0449  hypothetical protein  30.41 
 
 		 173 aa  87  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000134264  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1949  hypothetical protein  35.24 
 
 		 136 aa  57  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.372883  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2314  hypothetical protein  26.95 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0043  hypothetical protein  23.72 
 
 		 147 aa  50.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.798492 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1850  hypothetical protein  22.82 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000113368  normal  0.143422 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0036  hypothetical protein  25.16 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2296  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  29.81 
 
 		 860 aa  45.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.990921  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2667  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  29.19 
 
 		 860 aa  43.9  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.389508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0702  hypothetical protein  23.46 
 
 		 148 aa  42.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.171887  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29981  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  29.81 
 
 		 874 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.306827 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1305  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  32.64 
 
 		 856 aa  41.6  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0531747  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3206  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  28.57 
 
 		 869 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.375887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>