223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0069 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0045  DsrK protein  67.61 
 
 
549 aa  765  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1147  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  69.72 
 
 
539 aa  812  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63071  normal  0.964876 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0257  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  67.8 
 
 
542 aa  764  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1947  DsrK protein  67.51 
 
 
549 aa  749  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.364031  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0271  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  66.48 
 
 
543 aa  760  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000185698  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1848  DsrK protein  68.54 
 
 
549 aa  767  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.189216  normal  0.170119 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0704  DsrK protein  66.21 
 
 
549 aa  752  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186975  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0450  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  78.36 
 
 
547 aa  907  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.136958  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2272  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  82.65 
 
 
536 aa  950  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1606  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  71.35 
 
 
541 aa  823  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0069  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  100 
 
 
536 aa  1125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.481368 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1776  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  91.03 
 
 
536 aa  1046  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.279132  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0137  DsrK protein  68.16 
 
 
549 aa  763  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.258854  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0038  DsrK protein  67.18 
 
 
549 aa  756  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2312  DsrK protein  66.6 
 
 
550 aa  748  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0236  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  71.54 
 
 
534 aa  833  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.942909 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0451  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  67.04 
 
 
549 aa  754  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.961487  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2478  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  44.58 
 
 
507 aa  400  1e-110  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2192  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  44.56 
 
 
496 aa  399  1e-110  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0050  Fe-S oxidoreductase  42.83 
 
 
500 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00237763  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1958  hypothetical protein  42.05 
 
 
517 aa  392  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1660  Fe-S oxidoreductase  41.43 
 
 
515 aa  363  6e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0034  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.55 
 
 
466 aa  291  3e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2191  hypothetical protein  37.1 
 
 
461 aa  285  1e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1534  hypothetical protein  36.57 
 
 
446 aa  284  3e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0076  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.42 
 
 
454 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1219  hypothetical protein  34.45 
 
 
490 aa  267  5e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.158423  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1439  hypothetical protein  33.27 
 
 
492 aa  266  5e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174659 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3198  hypothetical protein  37.5 
 
 
464 aa  256  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0851  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.49 
 
 
493 aa  242  1e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0341  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.46 
 
 
471 aa  204  2e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00798095 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0174  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.52 
 
 
471 aa  201  3e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1633  hypothetical protein  30.57 
 
 
459 aa  200  4e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0915  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.85 
 
 
472 aa  197  5e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0839  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.44 
 
 
533 aa  179  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00734731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0249  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.32 
 
 
537 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1446  hypothetical protein  28.93 
 
 
542 aa  159  9e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1188  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  28.69 
 
 
457 aa  154  3e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1267  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.34 
 
 
453 aa  151  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0339  hypothetical protein  27.19 
 
 
534 aa  145  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.495442  normal  0.0503197 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0574  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.34 
 
 
531 aa  145  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.158943  normal  0.0218676 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2883  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.63 
 
 
453 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.945638 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3285  iron-sulfur cluster-binding protein  26.63 
 
 
453 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0899  hypothetical protein  28.51 
 
 
520 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27 
 
 
534 aa  143  9e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2145  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.73 
 
 
419 aa  139  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1333  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.75 
 
 
505 aa  135  2e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265785 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2555  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.68 
 
 
445 aa  135  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.92 
 
 
392 aa  134  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.683323  normal  0.0188161 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0302  hypothetical protein  28.34 
 
 
444 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4179  hypothetical protein  26.55 
 
 
515 aa  134  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1376  heterodisulfide reductase  26.51 
 
 
420 aa  133  8e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0673613  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.37 
 
 
438 aa  131  4e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.742352  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3709  ferredoxin, 4Fe-4S, putative  26.34 
 
 
439 aa  130  8e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.38 
 
 
411 aa  129  1e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0142218  hitchhiker  2.91974e-12 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0093  hypothetical protein  26.71 
 
 
423 aa  127  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2714  hypothetical protein  27.08 
 
 
439 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.17 
 
 
431 aa  124  6e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0678003 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0872  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.96 
 
 
461 aa  122  2e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.301742  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  26.92 
 
 
412 aa  121  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1028  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.12 
 
 
451 aa  121  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0406  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.63 
 
 
431 aa  119  2e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0694601 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.18 
 
 
463 aa  118  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2255  hypothetical protein  25.2 
 
 
460 aa  116  1e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2410  hypothetical protein  25.07 
 
 
461 aa  116  1e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.688183  normal  0.0784806 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0573  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.06 
 
 
460 aa  116  1e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0648  hmc operon protein 6  25.07 
 
 
462 aa  113  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0845  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.82 
 
 
462 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  3.35873e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1884  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.11 
 
 
402 aa  107  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.561608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0142  hypothetical protein  25.52 
 
 
418 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0594  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.76 
 
 
446 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1282  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.7 
 
 
416 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.438227 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1299  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.35 
 
 
419 aa  99  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1599  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  23.11 
 
 
409 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2146  hypothetical protein  23.1 
 
 
441 aa  83.6  8e-15  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1577  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.53 
 
 
427 aa  82.8  1e-14  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1023  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.89 
 
 
436 aa  76.6  1e-12  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0947  Fe-S oxidoreductase-like protein  22.44 
 
 
400 aa  76.3  1e-12  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.118909  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2437  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  25 
 
 
415 aa  70.5  7e-11  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2341  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  21.35 
 
 
439 aa  63.5  1e-08  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3399  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23 
 
 
629 aa  62.8  2e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58436  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.08 
 
 
722 aa  60.5  8e-08  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0414  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.26 
 
 
451 aa  59.3  2e-07  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.137763 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  24.8 
 
 
711 aa  58.5  3e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3531  DNA binding domain-containing protein  24.05 
 
 
308 aa  58.2  3e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.635038  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  21.12 
 
 
752 aa  58.2  4e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  7.71252e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.55 
 
 
713 aa  57.4  6e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0207  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.81 
 
 
774 aa  57.4  6e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.987392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3961  DNA binding domain-containing protein  24.37 
 
 
314 aa  57  8e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.66 
 
 
711 aa  56.2  1e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0009  hypothetical protein  43.21 
 
 
678 aa  55.8  2e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.15 
 
 
699 aa  56.2  2e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  1.10964e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0952  hypothetical protein  23.41 
 
 
365 aa  55.5  2e-06  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.53 
 
 
711 aa  56.2  2e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.787604  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0139  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  21.55 
 
 
481 aa  55.5  2e-06  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  21.49 
 
 
683 aa  55.5  2e-06  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0220  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  22.84 
 
 
487 aa  55.5  2e-06  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.804076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  21.53 
 
 
658 aa  55.1  3e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.03 
 
 
694 aa  54.3  5e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  22.96 
 
 
727 aa  53.9  6e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>