22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0068 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0068  cytochrome c family protein  100 
 
 		 126 aa  270  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.424004 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1777  cytochrome c family protein  90.48 
 
 		 126 aa  250  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2273  cytochrome c family protein  77.78 
 
 		 126 aa  229  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.758488  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0237  cytochrome c family protein  60.32 
 
 		 139 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0449  cytochrome c family protein  53.97 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27221  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0452  cytochrome c family protein  49.61 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.653469  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0272  cytochrome c family protein  49.6 
 
 		 128 aa  145  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000807332  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1605  cytochrome c family protein  50.37 
 
 		 134 aa  143  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.362415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1148  cytochrome c family protein  44.53 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.839058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0258  cytochrome c family protein  38.89 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0039  hypothetical protein  41.53 
 
 		 129 aa  99.4  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0138  hypothetical protein  45.26 
 
 		 131 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0581411  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1946  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0705  hypothetical protein  45.12 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1847  cytochrome c family protein  38.94 
 
 		 120 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374574  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0046  hypothetical protein  41.18 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2311  hypothetical protein  40.7 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2476  hypothetical protein  30.1 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2194  hypothetical protein  28.69 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1707  hypothetical protein  32.53 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1662  hypothetical protein  27.94 
 
 		 188 aa  47  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1960  hypothetical protein  30.47 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>