94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0066 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 387 aa  779    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  86.56 
 
 		 387 aa  673    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  73.58 
 
 		 387 aa  597  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  71.69 
 
 		 389 aa  553  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  65.45 
 
 		 386 aa  502  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  58.75 
 
 		 383 aa  472  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  58.7 
 
 		 389 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  58.22 
 
 		 384 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  57.55 
 
 		 385 aa  451  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  57.25 
 
 		 385 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  55.44 
 
 		 384 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  54.05 
 
 		 385 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  53.54 
 
 		 383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  53.79 
 
 		 383 aa  399  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  39.12 
 
 		 417 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  36.6 
 
 		 416 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  36.34 
 
 		 416 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  34.54 
 
 		 416 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0048  polysulfide reductase, subunit C, putative  31.36 
 
 		 391 aa  192  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.939472 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2309  Polysulphide reductase NrfD  32.02 
 
 		 358 aa  189  8e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  28.11 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  28.07 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  28.25 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  26.03 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  26.7 
 
 		 389 aa  113  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  29.53 
 
 		 414 aa  110  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  26.05 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  29.77 
 
 		 406 aa  103  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  25.82 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  24.67 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  27.76 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  25.31 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1944  polysulfide reductase, subunit C, putative  30.77 
 
 		 339 aa  90.5  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  24.3 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  24.38 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  26.12 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  25.72 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  24.19 
 
 		 624 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  24.78 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  23.98 
 
 		 348 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  22.76 
 
 		 624 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  23.35 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  24.58 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  24.75 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  21.9 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  25.89 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  24.87 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  21.67 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  22.05 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  24.66 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0273  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  23.06 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  24.8 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  21.29 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2602  polysulphide reductase, NrfD  24.07 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3393  Polysulphide reductase NrfD  20.69 
 
 		 411 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  24.4 
 
 		 476 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  21.43 
 
 		 593 aa  54.7  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  21.72 
 
 		 603 aa  53.1  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  21.91 
 
 		 466 aa  53.1  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  24.1 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  22.56 
 
 		 484 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  20.83 
 
 		 445 aa  50.4  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  20.44 
 
 		 393 aa  50.1  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02400  polysulphide reductase  21.13 
 
 		 378 aa  50.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  19.67 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  20.06 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  22.58 
 
 		 477 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  19.85 
 
 		 494 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  22.64 
 
 		 483 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  26.49 
 
 		 469 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  24.63 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  24.07 
 
 		 468 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1061  polysulphide reductase, NrfD  27.63 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.079733 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  20.82 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  23.68 
 
 		 361 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  30.2 
 
 		 453 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  21.65 
 
 		 466 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  21.26 
 
 		 445 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0779  formate dehydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  24.93 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  21.88 
 
 		 482 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3282  Polysulphide reductase NrfD  23.18 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3188  Polysulphide reductase NrfD  23.18 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0920163  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0055  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.3 
 
 		 515 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0898  tetrathionate reductase, subunit C  28.57 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.392425  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3088  polysulphide reductase, NrfD  23.64 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.187838  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2935  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  22.52 
 
 		 418 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.52066  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1229  Polysulphide reductase NrfD  21.28 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3997  polysulphide reductase NrfD  24.86 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2271  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  21.34 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  21.92 
 
 		 486 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2687  Polysulphide reductase NrfD  21.5 
 
 		 417 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1962  polysulphide reductase, NrfD  26.56 
 
 		 416 aa  44.3  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0166  polysulphide reductase, NrfD  22.41 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.391929  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  21.28 
 
 		 478 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>