More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0061 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1781  primosomal protein N'  65.96 
 
 
792 aa  1040  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0061  primosomal protein N'  100 
 
 
806 aa  1621  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1711  primosomal protein N'  61.21 
 
 
794 aa  892  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0259  primosomal protein N'  50.81 
 
 
769 aa  736  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1519  replication restart DNA helicase PriA  62.5 
 
 
823 aa  981  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1720  primosomal protein N'  52.38 
 
 
778 aa  768  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.31928  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  36.04 
 
 
801 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  43.04 
 
 
751 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  34.2 
 
 
804 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  35.21 
 
 
752 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  32.49 
 
 
809 aa  404  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  39.46 
 
 
746 aa  399  1e-110  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  35.48 
 
 
732 aa  399  1e-110  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.07652e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  34.76 
 
 
752 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  33.54 
 
 
754 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  37.13 
 
 
801 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  34.74 
 
 
758 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  33.25 
 
 
803 aa  390  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  34.46 
 
 
744 aa  391  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  34.13 
 
 
801 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  34.13 
 
 
801 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  36.4 
 
 
801 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  36.4 
 
 
801 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  34.36 
 
 
801 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  38.45 
 
 
738 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  36.35 
 
 
801 aa  385  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  36.21 
 
 
801 aa  386  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45063e-13 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  36.21 
 
 
801 aa  385  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  36.21 
 
 
801 aa  386  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  33.76 
 
 
813 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  36.21 
 
 
801 aa  385  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  37.17 
 
 
775 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  30.84 
 
 
798 aa  382  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  5.70984e-05  hitchhiker  7.45488e-06 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  34.93 
 
 
815 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  36.45 
 
 
802 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  36.78 
 
 
732 aa  376  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  35.34 
 
 
724 aa  375  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  31.45 
 
 
818 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  37.41 
 
 
803 aa  369  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  38.52 
 
 
858 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  34.1 
 
 
768 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  36.2 
 
 
781 aa  368  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  34.72 
 
 
802 aa  369  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  34.72 
 
 
802 aa  369  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  36.88 
 
 
749 aa  366  1e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  33.54 
 
 
743 aa  365  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  35.19 
 
 
814 aa  365  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  33.87 
 
 
812 aa  363  5e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  32.8 
 
 
798 aa  363  9e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2267  primosome assembly protein PriA  43.25 
 
 
745 aa  362  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  32.59 
 
 
802 aa  363  1e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  37.36 
 
 
732 aa  360  8e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  37.59 
 
 
745 aa  359  9e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  30.41 
 
 
796 aa  357  4e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  33.73 
 
 
828 aa  356  8e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  35.23 
 
 
849 aa  355  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  39.78 
 
 
739 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  39.53 
 
 
731 aa  354  3e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  36.68 
 
 
733 aa  354  3e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  32.41 
 
 
738 aa  353  1e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  41.25 
 
 
738 aa  352  1e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  39.59 
 
 
746 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  36.04 
 
 
731 aa  352  2e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  39.59 
 
 
739 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  36.04 
 
 
731 aa  351  3e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  34.49 
 
 
661 aa  351  3e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4079  primosomal protein N'  35.35 
 
 
724 aa  350  7e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  37.79 
 
 
730 aa  350  7e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  39.41 
 
 
739 aa  349  9e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  40.51 
 
 
739 aa  349  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  38.2 
 
 
679 aa  349  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  39.59 
 
 
744 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  39.41 
 
 
739 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  32.11 
 
 
715 aa  347  4e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  37.48 
 
 
732 aa  347  4e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  34.98 
 
 
815 aa  345  1e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6575  primosomal protein N'  30.43 
 
 
815 aa  345  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2781  replication restart DNA helicase PriA  41.65 
 
 
719 aa  346  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  35.9 
 
 
747 aa  346  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  39.49 
 
 
738 aa  346  1e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  39.41 
 
 
739 aa  346  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0535  primosome assembly protein PriA  40.33 
 
 
738 aa  345  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381236  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0799  primosomal protein N'  40.66 
 
 
774 aa  344  3e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0402  primosome assembly protein PriA  41.62 
 
 
736 aa  344  3e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.106987 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09963  primosomal protein N' (replication factor Y)  29.61 
 
 
815 aa  344  4e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  31.93 
 
 
811 aa  343  7e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  35.92 
 
 
733 aa  343  7e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  34.56 
 
 
815 aa  343  9e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  1.50971e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  34.2 
 
 
739 aa  342  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  35.75 
 
 
848 aa  342  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  34.24 
 
 
739 aa  341  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  34.32 
 
 
835 aa  341  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  36.34 
 
 
835 aa  340  6e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0682  replication restart DNA helicase PriA  39.39 
 
 
749 aa  339  1e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.235726 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  34.19 
 
 
810 aa  339  1e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  37.16 
 
 
733 aa  339  1e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0028  primosome assembly protein PriA  31.24 
 
 
736 aa  339  1e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2672  replication restart DNA helicase PriA  33.81 
 
 
738 aa  339  2e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.868647 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  35.81 
 
 
815 aa  338  2e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  36.11 
 
 
745 aa  338  2e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.240357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>