127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0057 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0057  protein of unknown function DUF147  100 
 
 
247 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1785  hypothetical protein  86.29 
 
 
248 aa  410  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.334778 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1515  hypothetical protein  67.21 
 
 
249 aa  347  8e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.189008  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0255  protein of unknown function DUF147  57.38 
 
 
251 aa  291  7e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000845039  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1725  protein of unknown function DUF147  57.26 
 
 
252 aa  278  5e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.175281  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1715  protein of unknown function DUF147  55.14 
 
 
279 aa  273  2e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.188569  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0999  hypothetical protein  43.7 
 
 
261 aa  222  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000188135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0361  protein of unknown function DUF147  44.21 
 
 
285 aa  201  8e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.566401  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0370  protein of unknown function DUF147  43.7 
 
 
275 aa  200  2e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0292  hypothetical protein  44.31 
 
 
274 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00100621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2248  hypothetical protein  43.95 
 
 
277 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.356629  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1807  hypothetical protein  42.17 
 
 
261 aa  192  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.895114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0155  hypothetical protein  41.45 
 
 
273 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0240  protein of unknown function DUF147  41.94 
 
 
272 aa  190  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0156  protein of unknown function DUF147  45.73 
 
 
273 aa  189  3e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  6.02517e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5137  hypothetical protein  40.6 
 
 
273 aa  188  6e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0832  protein of unknown function DUF147  42.5 
 
 
271 aa  188  6e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  5.26426e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0187  conserved hypothetical protein TIGR00159  41.03 
 
 
273 aa  188  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0290754  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0148  hypothetical protein  41.03 
 
 
273 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0102847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0150  hypothetical protein  41.03 
 
 
273 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.888291  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0156  hypothetical protein  41.03 
 
 
273 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.374627  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0199  conserved hypothetical protein TIGR00159  41.03 
 
 
273 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0155  hypothetical protein  41.03 
 
 
273 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0837  protein of unknown function DUF147  41.42 
 
 
275 aa  187  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0178  conserved hypothetical protein TIGR00159  41.03 
 
 
273 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1888  hypothetical protein  41.32 
 
 
255 aa  186  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.52181e-06  hitchhiker  1.69292e-09 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0148  hypothetical protein  40.85 
 
 
276 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0152  protein of unknown function DUF147  44.26 
 
 
273 aa  185  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0110  protein of unknown function DUF147  43.46 
 
 
275 aa  185  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0006  protein of unknown function DUF147  41.7 
 
 
248 aa  183  2e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  1.63488e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2336  hypothetical protein  43.93 
 
 
296 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0149  hypothetical protein  40.17 
 
 
273 aa  182  5e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0604  protein of unknown function DUF147  41.43 
 
 
275 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  6.75285e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0934  hypothetical protein  39.68 
 
 
277 aa  182  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1166  hypothetical protein  40.08 
 
 
292 aa  181  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  5.52202e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1201  protein of unknown function DUF147  40.89 
 
 
309 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2186  protein of unknown function DUF147  40.89 
 
 
260 aa  180  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2672  protein of unknown function DUF147  42.21 
 
 
273 aa  179  5e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0161  protein of unknown function DUF147  40.68 
 
 
239 aa  179  5e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1497  hypothetical protein  46.03 
 
 
293 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1656  hypothetical protein  40.59 
 
 
297 aa  178  7e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3366  protein of unknown function DUF147  43.75 
 
 
388 aa  178  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1367  hypothetical protein  42.44 
 
 
470 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.010131  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0868  hypothetical protein  42.26 
 
 
470 aa  175  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1568  hypothetical protein  39.57 
 
 
273 aa  172  3e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3986  hypothetical protein  42.06 
 
 
294 aa  172  4e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0895  protein of unknown function DUF147  41.67 
 
 
388 aa  171  8e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.36651e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3416  hypothetical protein  41.08 
 
 
267 aa  171  8e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2732  hypothetical protein  41.18 
 
 
275 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.76859  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3551  hypothetical protein  39.11 
 
 
293 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000686428  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0008  hypothetical protein  35.51 
 
 
256 aa  169  3e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.487751  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1145  hypothetical protein  41.73 
 
 
279 aa  169  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586351 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2640  hypothetical protein  42.08 
 
 
471 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.911515  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0278  hypothetical protein  40.51 
 
 
292 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911032  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1168  hypothetical protein  38.91 
 
 
471 aa  166  3e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.42282e-06  normal  0.0311733 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1288  hypothetical protein  40.25 
 
 
282 aa  165  5e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.08276e-07  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0885  hypothetical protein  39.08 
 
 
283 aa  164  2e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.296803  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2370  protein of unknown function DUF147  45.19 
 
 
293 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2458  protein of unknown function DUF147  45.19 
 
 
293 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0146  protein of unknown function DUF147  40.33 
 
 
269 aa  162  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2233  hypothetical protein  40.81 
 
 
269 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.785168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2195  hypothetical protein  40.81 
 
 
269 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1817  protein of unknown function DUF147  40.46 
 
 
266 aa  161  8e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0135  hypothetical protein  41.53 
 
 
278 aa  161  9e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.575815  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1909  hypothetical protein  36.8 
 
 
274 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1764  hypothetical protein  40.09 
 
 
269 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3055  protein of unknown function DUF147  39.5 
 
 
382 aa  159  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0416862  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2337  protein of unknown function DUF147  40.24 
 
 
276 aa  159  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3550  protein of unknown function DUF147  36.69 
 
 
480 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000131066  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0407  hypothetical protein  35.68 
 
 
283 aa  156  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000461408  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2103  hypothetical protein  40.76 
 
 
288 aa  155  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2637  protein of unknown function DUF147  38.71 
 
 
252 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2346  hypothetical protein  39.06 
 
 
285 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2660  hypothetical protein  39.06 
 
 
285 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1597  protein of unknown function DUF147  38.71 
 
 
252 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2254  hypothetical protein  38.43 
 
 
261 aa  152  6e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0477  hypothetical protein  36.13 
 
 
292 aa  151  8e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0400  protein of unknown function DUF147  36.73 
 
 
291 aa  147  1e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1932  hypothetical protein  38.66 
 
 
266 aa  147  2e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3222  hypothetical protein  34.78 
 
 
282 aa  145  4e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1232  hypothetical protein  36.92 
 
 
235 aa  145  7e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4701  protein of unknown function DUF147  39.43 
 
 
327 aa  145  7e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2524  protein of unknown function DUF147  36.36 
 
 
248 aa  144  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74845  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0224  protein of unknown function DUF147  36 
 
 
267 aa  143  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  4.24846e-09  normal  0.0474831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0843  protein of unknown function DUF147  37.1 
 
 
293 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2433  hypothetical protein  37.19 
 
 
304 aa  140  2e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0471214  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0263  hypothetical protein  38.43 
 
 
306 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4735  hypothetical protein  38.27 
 
 
325 aa  135  6e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0913  hypothetical protein  37.7 
 
 
321 aa  134  1e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3455  hypothetical protein  34.29 
 
 
483 aa  132  7e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000996769 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0127  protein of unknown function DUF147  39.83 
 
 
298 aa  131  1e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0124  protein of unknown function DUF147  39.83 
 
 
298 aa  131  1e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0678781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5466  protein of unknown function DUF147  33.74 
 
 
270 aa  131  1e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200654  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2673  protein of unknown function DUF147  35.71 
 
 
272 aa  130  2e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0979308 
 
 
-
 
NC_002950  PG1588  hypothetical protein  32.66 
 
 
255 aa  129  5e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1392  hypothetical protein  33.33 
 
 
276 aa  127  1e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1981  protein of unknown function DUF147  45.95 
 
 
203 aa  127  2e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00327586  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1630  hypothetical protein  33.2 
 
 
276 aa  124  9e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0696242  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3664  protein of unknown function DUF147  29.96 
 
 
263 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2107  protein of unknown function DUF147  32.89 
 
 
258 aa  123  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>