More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0056 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0056  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 332 aa  670    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1786  dihydropteroate synthase  61.2 
 
 		 286 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1514  dihydropteroate synthase  58.25 
 
 		 286 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0169529  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1726  dihydropteroate synthase  50.48 
 
 		 289 aa  296  3e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0955248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1716  dihydropteroate synthase  51.26 
 
 		 300 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.46526  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0254  dihydropteroate synthase  50.83 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00676186  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  40.94 
 
 		 397 aa  216  5e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1386  dihydropteroate synthase  44.85 
 
 		 279 aa  209  7e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0675469  hitchhiker  0.00645369 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  38 
 
 		 275 aa  208  8e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  40 
 
 		 376 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  40.45 
 
 		 279 aa  202  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  40.26 
 
 		 271 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  36.03 
 
 		 397 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  36.91 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  37.86 
 
 		 280 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  38.44 
 
 		 277 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1012  dihydropteroate synthase  40.4 
 
 		 287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.561685  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  41.23 
 
 		 291 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  37.11 
 
 		 259 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  38.44 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  38.78 
 
 		 284 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  38.78 
 
 		 277 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  38.78 
 
 		 277 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  36.36 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  40.68 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  38.64 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  37.86 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  37.86 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  36.83 
 
 		 279 aa  193  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  38.78 
 
 		 280 aa  193  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  38.78 
 
 		 279 aa  193  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  37.22 
 
 		 282 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1513  dihydropteroate synthase  41.37 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  34.67 
 
 		 266 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  36.57 
 
 		 277 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  35.29 
 
 		 276 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  37.63 
 
 		 394 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1720  dihydropteroate synthase  40.14 
 
 		 265 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270791  normal  0.815616 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  39.72 
 
 		 291 aa  189  5.999999999999999e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  35.91 
 
 		 278 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  37.22 
 
 		 277 aa  189  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1483  dihydropteroate synthase  41.04 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0778  dihydropteroate synthase  41.69 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1616  dihydropteroate synthase  41.04 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.282934  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0572  dihydropteroate synthase  41.69 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0579  dihydropteroate synthase  41.69 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.601672  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1289  dihydropteroate synthase  41.69 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  38.31 
 
 		 291 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2169  dihydropteroate synthase  40.07 
 
 		 316 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  37.58 
 
 		 278 aa  186  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  36.61 
 
 		 277 aa  186  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  37.38 
 
 		 282 aa  185  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2028  dihydropteroate synthase  38.93 
 
 		 265 aa  185  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  33.9 
 
 		 270 aa  185  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  36.61 
 
 		 286 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2618  dihydropteroate synthase  42.52 
 
 		 292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.103274  normal  0.519468 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  43.2 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3497  dihydropteroate synthase  33.9 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24342  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2303  dihydropteroate synthase  39.8 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933807  normal  0.841212 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2775  dihydropteroate synthase  40.39 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0570609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  37.29 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  35.35 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  35.25 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1476  dihydropteroate synthase  40.68 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  35.25 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2382  dihydropteroate synthase  40.68 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  36.61 
 
 		 280 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  36.58 
 
 		 278 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  35.05 
 
 		 281 aa  183  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  36.27 
 
 		 277 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  37.29 
 
 		 283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  36.61 
 
 		 280 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  36.61 
 
 		 280 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  36.61 
 
 		 280 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  36.61 
 
 		 280 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  36.61 
 
 		 277 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  34.48 
 
 		 286 aa  182  8.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  38.64 
 
 		 394 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  36.27 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  36.05 
 
 		 393 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  37.42 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  37.46 
 
 		 400 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  37.29 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0210  dihydropteroate synthase  41.55 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  34.73 
 
 		 277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2625  dihydropteroate synthase  40.88 
 
 		 286 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2187  dihydropteroate synthase  39.53 
 
 		 289 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.999142  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  40.54 
 
 		 298 aa  178  9e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  38.91 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  34.53 
 
 		 412 aa  178  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  36.75 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  35.03 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  36.7 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0880  dihydropteroate synthase  38.82 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.0771022 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  34.71 
 
 		 282 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  34.71 
 
 		 282 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  34.71 
 
 		 282 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  34.71 
 
 		 282 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  38.26 
 
 		 281 aa  177  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  34.71 
 
 		 282 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>