More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0048 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0248  argininosuccinate lyase  69.15 
 
 
466 aa  647  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192442  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0048  argininosuccinate lyase  100 
 
 
460 aa  937  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2530  argininosuccinate lyase  75.33 
 
 
460 aa  724  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212855  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1094  argininosuccinate lyase  69.87 
 
 
466 aa  665  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0434705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1901  argininosuccinate lyase  82.31 
 
 
460 aa  791  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1728  argininosuccinate lyase  65.58 
 
 
470 aa  609  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.365452  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  57.11 
 
 
478 aa  504  1e-142  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0522  argininosuccinate lyase  52.94 
 
 
467 aa  493  1e-138  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  55.65 
 
 
475 aa  486  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  52.55 
 
 
467 aa  482  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  52.65 
 
 
466 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  51.23 
 
 
462 aa  483  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
462 aa  480  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  52.21 
 
 
467 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
462 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  53.26 
 
 
460 aa  478  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 
462 aa  479  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  52.55 
 
 
458 aa  480  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1520  argininosuccinate lyase  50.65 
 
 
466 aa  479  1e-134  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  54.36 
 
 
460 aa  481  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  51.54 
 
 
458 aa  481  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  51.88 
 
 
458 aa  481  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  50.88 
 
 
458 aa  478  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  3.46068e-07 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  51.54 
 
 
458 aa  478  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
462 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0607  argininosuccinate lyase  51.75 
 
 
463 aa  475  1e-133  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 
462 aa  476  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 
463 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 
462 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  55.53 
 
 
467 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
462 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
463 aa  476  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 
504 aa  477  1e-133  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 
462 aa  475  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  50.78 
 
 
458 aa  475  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
462 aa  472  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 
458 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  53.27 
 
 
456 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  51.77 
 
 
467 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  53.5 
 
 
462 aa  473  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  50.89 
 
 
461 aa  471  1e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1738  argininosuccinate lyase  52.29 
 
 
462 aa  469  1e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.44445  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  51.8 
 
 
461 aa  469  1e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  52.13 
 
 
465 aa  465  1e-130  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  54 
 
 
468 aa  466  1e-130  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  5.98016e-12 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  53.27 
 
 
468 aa  467  1e-130  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  51.1 
 
 
466 aa  465  1e-130  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  52.7 
 
 
459 aa  465  1e-130  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  51.1 
 
 
493 aa  462  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  55.75 
 
 
462 aa  463  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  51.45 
 
 
491 aa  463  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  55.75 
 
 
462 aa  463  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  51.1 
 
 
466 aa  462  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  49.55 
 
 
459 aa  461  1e-128  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  53.02 
 
 
467 aa  458  1e-128  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  51.22 
 
 
473 aa  458  1e-128  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3477  argininosuccinate lyase  51.42 
 
 
465 aa  456  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  51.58 
 
 
457 aa  456  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1145  argininosuccinate lyase  51.2 
 
 
463 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  50.77 
 
 
488 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  52.35 
 
 
469 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 
462 aa  455  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0827  argininosuccinate lyase  51.2 
 
 
465 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332857  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  52.43 
 
 
469 aa  456  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0936  argininosuccinate lyase  50.77 
 
 
465 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  51.36 
 
 
457 aa  455  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  51.79 
 
 
455 aa  452  1e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  52.46 
 
 
459 aa  452  1e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  53.79 
 
 
466 aa  452  1e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0715  argininosuccinate lyase  52.01 
 
 
465 aa  453  1e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  50.88 
 
 
476 aa  453  1e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  48.55 
 
 
458 aa  454  1e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  54.09 
 
 
463 aa  453  1e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5225  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 
465 aa  452  1e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  48.58 
 
 
461 aa  450  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  51.09 
 
 
493 aa  451  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  52.01 
 
 
464 aa  451  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.75067e-05 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  52.48 
 
 
469 aa  450  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  51.24 
 
 
464 aa  449  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  52.3 
 
 
485 aa  451  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1484  argininosuccinate lyase  49.24 
 
 
460 aa  451  1e-125  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.209695  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1072  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 
461 aa  450  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  1.43666e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2429  argininosuccinate lyase  51.36 
 
 
469 aa  445  1e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1261  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
461 aa  447  1e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  4.76291e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  51.75 
 
 
463 aa  447  1e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  50.65 
 
 
485 aa  446  1e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  52.77 
 
 
467 aa  447  1e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  49.33 
 
 
481 aa  445  1e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1818  argininosuccinate lyase  51.36 
 
 
469 aa  445  1e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  51.75 
 
 
463 aa  445  1e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  47.37 
 
 
459 aa  445  1e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  51.12 
 
 
464 aa  445  1e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  51.88 
 
 
476 aa  446  1e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0866  argininosuccinate lyase  48.91 
 
 
460 aa  445  1e-124  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  51.8 
 
 
467 aa  445  1e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  51.24 
 
 
489 aa  446  1e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  51.65 
 
 
464 aa  446  1e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  51.24 
 
 
469 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2664  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 
486 aa  444  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  50.9 
 
 
499 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>