More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0046 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0046  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 300 aa  629  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1899  ornithine carbamoyltransferase  84.67 
 
 		 300 aa  553  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2532  ornithine carbamoyltransferase  80.07 
 
 		 300 aa  518  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  63.97 
 
 		 298 aa  413  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1731  ornithine carbamoyltransferase  65.22 
 
 		 304 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  54.03 
 
 		 303 aa  342  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  54.03 
 
 		 303 aa  338  7e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  53.02 
 
 		 305 aa  333  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  51.68 
 
 		 303 aa  331  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  54.03 
 
 		 309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2691  ornithine carbamoyltransferase  57.05 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  56.71 
 
 		 309 aa  318  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  56.71 
 
 		 309 aa  318  5e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  52.36 
 
 		 303 aa  318  6e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  50.34 
 
 		 303 aa  316  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 		 312 aa  317  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  52.36 
 
 		 303 aa  316  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 304 aa  315  7e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 302 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  53.64 
 
 		 305 aa  309  4e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 		 321 aa  306  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 		 298 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  49.32 
 
 		 305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  51.52 
 
 		 300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  48.99 
 
 		 305 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  48.15 
 
 		 309 aa  301  8.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  48.48 
 
 		 300 aa  301  1e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 304 aa  299  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 310 aa  298  5e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  48.01 
 
 		 302 aa  297  1e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  48.99 
 
 		 306 aa  296  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1573  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 		 309 aa  296  2e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0157636  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  48.15 
 
 		 306 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  48.66 
 
 		 323 aa  294  1e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  47.47 
 
 		 307 aa  294  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  48 
 
 		 306 aa  293  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  49.66 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  46.84 
 
 		 303 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  46.31 
 
 		 301 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  46.46 
 
 		 309 aa  291  6e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  47.68 
 
 		 319 aa  291  8e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  47.83 
 
 		 305 aa  291  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  47.14 
 
 		 308 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  45.7 
 
 		 304 aa  289  4e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  46.13 
 
 		 309 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  46.13 
 
 		 329 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  48.92 
 
 		 315 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 		 312 aa  288  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  47.23 
 
 		 320 aa  288  6e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  48.33 
 
 		 305 aa  288  7e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  48.33 
 
 		 305 aa  288  7e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  46.13 
 
 		 306 aa  288  9e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  48.17 
 
 		 312 aa  288  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  47.67 
 
 		 310 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  47.23 
 
 		 313 aa  287  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  46.67 
 
 		 305 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  46.13 
 
 		 306 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  47.14 
 
 		 306 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  46.82 
 
 		 312 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  47.14 
 
 		 306 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  47 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  47.84 
 
 		 312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 		 302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 		 313 aa  286  4e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  47.14 
 
 		 306 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  46.41 
 
 		 311 aa  285  5e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  44.52 
 
 		 305 aa  285  5.999999999999999e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  50.51 
 
 		 318 aa  285  8e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  47.33 
 
 		 311 aa  285  8e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  47.33 
 
 		 311 aa  285  8e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  47.65 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  46.67 
 
 		 304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  47.14 
 
 		 305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19151  ornithine carbamoyltransferase  48.47 
 
 		 318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  45.45 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  45.82 
 
 		 308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  46.67 
 
 		 309 aa  282  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  46.86 
 
 		 308 aa  282  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  44.52 
 
 		 307 aa  281  8.000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  44.78 
 
 		 302 aa  281  9e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  46.31 
 
 		 305 aa  281  9e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  46.64 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  46.6 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  44.52 
 
 		 306 aa  280  1e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  48.82 
 
 		 303 aa  280  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  46.26 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  46.44 
 
 		 355 aa  280  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  47.71 
 
 		 331 aa  280  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  45.97 
 
 		 311 aa  279  3e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0382  ornithine carbamoyltransferase  47.18 
 
 		 308 aa  280  3e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.539911  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  45.79 
 
 		 303 aa  279  4e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  46 
 
 		 309 aa  279  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  46 
 
 		 309 aa  278  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  46.67 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  46.46 
 
 		 312 aa  278  8e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  46.33 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  47.23 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  44.88 
 
 		 317 aa  277  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  46.51 
 
 		 308 aa  276  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  46.33 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>