97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0041 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  100 
 
 
197 aa  377  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  41.49 
 
 
201 aa  109  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  37.7 
 
 
204 aa  108  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  35.03 
 
 
199 aa  105  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  41.76 
 
 
196 aa  101  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  38.86 
 
 
195 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  37.17 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  35.12 
 
 
198 aa  98.6  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  35.85 
 
 
212 aa  95.5  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  38.15 
 
 
205 aa  94.7  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  39.16 
 
 
203 aa  92.8  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  37.02 
 
 
201 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  35 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  32.76 
 
 
197 aa  89.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.2506e-07 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  32.31 
 
 
231 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  31.94 
 
 
232 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  34.25 
 
 
204 aa  84  1e-15  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  33.95 
 
 
236 aa  83.6  2e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  33.86 
 
 
196 aa  80.9  1e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  32.1 
 
 
214 aa  78.6  6e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  31.48 
 
 
251 aa  75.9  3e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  31 
 
 
209 aa  75.5  4e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  31.48 
 
 
251 aa  75.9  4e-13  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  40.91 
 
 
206 aa  75.1  7e-13  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  30.26 
 
 
237 aa  73.9  1e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  31.94 
 
 
217 aa  72.8  3e-12  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  30.65 
 
 
225 aa  71.6  6e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  38.57 
 
 
200 aa  70.5  2e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0600  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  69.3  3e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  25.12 
 
 
211 aa  67  2e-10  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  31.71 
 
 
208 aa  67  2e-10  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  26.45 
 
 
241 aa  66.2  3e-10  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  29.23 
 
 
207 aa  65.5  5e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  30.27 
 
 
236 aa  64.7  8e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  31.97 
 
 
242 aa  64.7  8e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  27.14 
 
 
241 aa  64.3  1e-09  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  30.27 
 
 
236 aa  63.9  2e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  27.6 
 
 
187 aa  62  5e-09  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.82452e-07  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  25.28 
 
 
199 aa  62  5e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  30.05 
 
 
207 aa  61.2  9e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  27.23 
 
 
182 aa  60.5  2e-08  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.76204e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  27.23 
 
 
182 aa  60.5  2e-08  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  4.61465e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  27.08 
 
 
187 aa  59.7  3e-08  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.40203e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  27.08 
 
 
187 aa  59.7  3e-08  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.51515e-06  hitchhiker  2.97897e-06 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  27.08 
 
 
187 aa  59.7  3e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.85697e-13  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  27.08 
 
 
187 aa  59.7  3e-08  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.27636e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  27.08 
 
 
187 aa  59.3  4e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  4.2581e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  29.3 
 
 
238 aa  58.5  7e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  26.98 
 
 
187 aa  58.2  8e-08  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  27.41 
 
 
187 aa  56.6  2e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  29.82 
 
 
191 aa  56.6  2e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  27.41 
 
 
187 aa  57  2e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.48477e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  28.03 
 
 
240 aa  57  2e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  27.93 
 
 
240 aa  57  2e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  27.41 
 
 
187 aa  57  2e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  27.41 
 
 
187 aa  57  2e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  27.41 
 
 
187 aa  57  2e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  28.57 
 
 
182 aa  57  2e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  28.57 
 
 
182 aa  57  2e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  28.66 
 
 
238 aa  56.2  3e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  28.66 
 
 
242 aa  56.2  3e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  28.66 
 
 
239 aa  56.2  3e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  31.32 
 
 
194 aa  54.7  9e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1714  hypothetical protein  28.29 
 
 
232 aa  54.7  9e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.67749e-09 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  28.86 
 
 
207 aa  53.5  2e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  31.34 
 
 
183 aa  52.8  3e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  27.37 
 
 
253 aa  53.1  3e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  27.16 
 
 
185 aa  52.4  4e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  3.70009e-07 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  31.87 
 
 
221 aa  52  6e-06  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4622  hypothetical protein  32.03 
 
 
214 aa  51.6  8e-06  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  25.69 
 
 
202 aa  51.6  8e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  22.46 
 
 
189 aa  50.1  2e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  26.88 
 
 
250 aa  50.1  2e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  28.47 
 
 
188 aa  49.3  3e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  29.05 
 
 
215 aa  49.7  3e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  22.56 
 
 
192 aa  49.3  4e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  23.4 
 
 
188 aa  48.9  4e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.57242e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  32.14 
 
 
186 aa  48.9  5e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  26.25 
 
 
248 aa  48.5  6e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  26.56 
 
 
192 aa  48.5  6e-05  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3138  hypothetical protein  32.86 
 
 
176 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  30.67 
 
 
188 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  23.47 
 
 
211 aa  46.6  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  24.46 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  1.61061e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2075  hypothetical protein  30.28 
 
 
191 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00929812  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2578  hypothetical protein  29.61 
 
 
176 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130696  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  26.04 
 
 
192 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  28.12 
 
 
243 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  26.04 
 
 
192 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  31.96 
 
 
212 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3377  hypothetical protein  26.97 
 
 
201 aa  45.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237475  normal  0.194903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  26.71 
 
 
195 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3078  putative lipoprotein  35.9 
 
 
186 aa  44.7  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  30.14 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1703  hypothetical protein  33.73 
 
 
197 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  32 
 
 
201 aa  42.4  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  31.88 
 
 
210 aa  41.2  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>