More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0038 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0038  protein of unknown function DUF140  100 
 
 
381 aa  743  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1058  protein of unknown function DUF140  54.96 
 
 
375 aa  363  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00141261  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2637  hypothetical protein  52.34 
 
 
401 aa  328  1e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  57.01 
 
 
384 aa  325  7e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1985  ABC transporter permease protein  55.59 
 
 
373 aa  316  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  43.33 
 
 
370 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0670  hypothetical protein  40.38 
 
 
369 aa  244  2e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3136  hypothetical protein  45.04 
 
 
386 aa  240  3e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  37.53 
 
 
376 aa  234  2e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2445  hypothetical protein  41.15 
 
 
389 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  37.82 
 
 
380 aa  212  8e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  37.22 
 
 
377 aa  202  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3498  hypothetical protein  42.35 
 
 
382 aa  202  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231207  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  42.47 
 
 
372 aa  201  1e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1228  protein of unknown function DUF140  39.32 
 
 
383 aa  197  4e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.319892  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  39.74 
 
 
375 aa  193  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 
413 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  43.98 
 
 
386 aa  190  3e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  35.9 
 
 
383 aa  190  3e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1711  hypothetical protein  37.93 
 
 
369 aa  190  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.95041e-09 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  41.09 
 
 
382 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  36.25 
 
 
365 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  33.68 
 
 
387 aa  185  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  28.93 
 
 
376 aa  184  2e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  34.88 
 
 
364 aa  184  2e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  36.73 
 
 
368 aa  184  2e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  35.39 
 
 
385 aa  183  5e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  39.44 
 
 
373 aa  182  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  38.26 
 
 
370 aa  182  8e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  39.04 
 
 
396 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  30.79 
 
 
374 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  38.8 
 
 
372 aa  180  5e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  2.96062e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  31.4 
 
 
374 aa  179  6e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  33.13 
 
 
377 aa  179  7e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  33.13 
 
 
377 aa  179  9e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  40.74 
 
 
406 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  33.72 
 
 
374 aa  174  2e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  36.36 
 
 
430 aa  173  4e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  36.8 
 
 
381 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  36.33 
 
 
366 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  27.32 
 
 
370 aa  171  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  32.95 
 
 
376 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 
374 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  38.91 
 
 
384 aa  171  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  36.33 
 
 
366 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  26.51 
 
 
373 aa  170  3e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  36.33 
 
 
366 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  27.72 
 
 
369 aa  169  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  33.33 
 
 
374 aa  169  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  27.37 
 
 
369 aa  169  7e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  28.79 
 
 
369 aa  169  8e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  36.86 
 
 
371 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  36.8 
 
 
381 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  38.04 
 
 
382 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  33.68 
 
 
382 aa  167  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  33.46 
 
 
383 aa  164  2e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  37.1 
 
 
382 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  32.31 
 
 
377 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  41.67 
 
 
257 aa  163  5e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  36.8 
 
 
384 aa  163  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  41.85 
 
 
266 aa  162  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  33.06 
 
 
388 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  35.5 
 
 
370 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  32.8 
 
 
379 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  35.25 
 
 
378 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  31.17 
 
 
378 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  32.61 
 
 
368 aa  160  5e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  35.19 
 
 
344 aa  159  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  38.31 
 
 
377 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  38.87 
 
 
362 aa  159  9e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  30.45 
 
 
368 aa  159  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  35.41 
 
 
377 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  35.69 
 
 
377 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  35.03 
 
 
377 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  34.62 
 
 
378 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  28.31 
 
 
379 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  32.92 
 
 
375 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  36.23 
 
 
364 aa  154  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  35.77 
 
 
393 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  34.2 
 
 
382 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0101  hypothetical protein  32.43 
 
 
357 aa  154  3e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218333  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  33.22 
 
 
377 aa  153  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  30.94 
 
 
371 aa  152  6e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  29.91 
 
 
383 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  37.44 
 
 
384 aa  152  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  36.72 
 
 
260 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  36.72 
 
 
260 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  29.72 
 
 
447 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  29.72 
 
 
374 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  29.72 
 
 
374 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  31.27 
 
 
383 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1017  hypothetical protein  37.92 
 
 
385 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  29.72 
 
 
374 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  25.27 
 
 
367 aa  150  4e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  27.67 
 
 
368 aa  150  5e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  30.62 
 
 
383 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  34.09 
 
 
376 aa  149  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  34.1 
 
 
388 aa  149  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0365  hypothetical protein  32.33 
 
 
376 aa  149  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  39.72 
 
 
256 aa  149  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>