44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0037 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  452  1e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  72.28 
 
 
226 aa  304  7e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  44.12 
 
 
222 aa  163  2e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0689  hypothetical protein  29.95 
 
 
227 aa  110  2e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3853  hypothetical protein  27.48 
 
 
231 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3499  hypothetical protein  27.43 
 
 
231 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1080  putative lipoprotein  30.32 
 
 
226 aa  98.6  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00439977  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1467  hypothetical protein  32.03 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3047  putative lipoprotein  32.08 
 
 
222 aa  84.7  1e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.566933  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20600  hypothetical protein  32.71 
 
 
224 aa  81.3  1e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.61916e-05  normal  0.707445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1768  putative lipoprotein  32.71 
 
 
224 aa  80.5  2e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2516  hypothetical protein  30.63 
 
 
223 aa  80.5  2e-14  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0400  hypothetical protein  28.57 
 
 
233 aa  77  2e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  30.19 
 
 
232 aa  76.6  2e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  28.38 
 
 
225 aa  75.9  5e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2710  hypothetical protein  30.32 
 
 
225 aa  75.1  8e-13  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2569  hypothetical protein  27.72 
 
 
225 aa  72.8  4e-12  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2705  hypothetical protein  26.79 
 
 
226 aa  72.4  5e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3145  hypothetical protein  27.57 
 
 
273 aa  71.2  1e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1978  putative outer membrane lipoprotein  28.02 
 
 
223 aa  69.3  5e-11  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.931993 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1721  putative lipoprotein  27.12 
 
 
222 aa  66.2  4e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1785  hypothetical protein  27.12 
 
 
222 aa  66.2  4e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1554  putative lipoprotein  27.12 
 
 
222 aa  66.2  4e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1735  putative lipoprotein  27.12 
 
 
222 aa  66.2  4e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1724  putative lipoprotein  27.12 
 
 
222 aa  65.5  6e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0895113  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1609  putative lipoprotein  28.18 
 
 
222 aa  65.5  6e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01399  hypothetical protein  27.62 
 
 
222 aa  64.3  2e-09  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2036  putative lipoprotein  27.62 
 
 
222 aa  64.3  2e-09  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  4.23707e-09  unclonable  9.72589e-25 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0167  hypothetical protein  33.63 
 
 
220 aa  64.3  2e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1513  putative lipoprotein  27.62 
 
 
222 aa  64.3  2e-09  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2216  conserved hypothetical protein  27.62 
 
 
222 aa  64.3  2e-09  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.90262  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01388  predicted lipoprotein  27.62 
 
 
222 aa  64.3  2e-09  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1744  putative lipoprotein  27.62 
 
 
222 aa  64.3  2e-09  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.16724e-09  unclonable  1.13256e-21 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2229  hypothetical protein  27.62 
 
 
222 aa  64.3  2e-09  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3250  hypothetical protein  24.43 
 
 
223 aa  58.9  7e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3873  hypothetical protein  27.51 
 
 
223 aa  58.2  1e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3425  putative lipoprotein  24.21 
 
 
231 aa  58.2  1e-07  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33730  hypothetical protein  28.37 
 
 
225 aa  52.8  4e-06  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2561  putative lipoprotein  23.28 
 
 
237 aa  52.4  6e-06  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.45576  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6350  putative lipoprotein  29.13 
 
 
230 aa  51.2  1e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.483058 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1448  putative lipoprotein  22.75 
 
 
220 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288417  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2893  lipoprotein  24.29 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  2.97735e-05  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2390  hypothetical protein  20.42 
 
 
220 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  0.832106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>