49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0025 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0025  protein of unknown function DUF1121  100 
 
 
228 aa  465  1e-130  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0228107 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1094  hypothetical protein  69.91 
 
 
217 aa  331  6e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2335  hypothetical protein  57.33 
 
 
227 aa  274  8e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0478428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0236  hypothetical protein  54.67 
 
 
217 aa  241  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000188385  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1232  hypothetical protein  52.78 
 
 
217 aa  236  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2126  protein of unknown function DUF1121  50.94 
 
 
216 aa  234  1e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.901834 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0958  protein of unknown function DUF1121  47.6 
 
 
213 aa  198  5e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  1.55501e-10  decreased coverage  3.58592e-10 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2935  protein of unknown function DUF1121  39.91 
 
 
217 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3856  protein of unknown function DUF1121  41.98 
 
 
217 aa  150  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00447083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3772  protein of unknown function DUF1121  41.51 
 
 
217 aa  150  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.602543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3334  hypothetical protein  42.5 
 
 
217 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2921  protein of unknown function DUF1121  42.79 
 
 
216 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.257573 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1837  protein of unknown function DUF1121  41.24 
 
 
219 aa  148  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0125  hypothetical protein  43 
 
 
217 aa  148  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.776517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4126  hypothetical protein  40.83 
 
 
217 aa  148  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.96501e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2929  hypothetical protein  39.32 
 
 
213 aa  147  1e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2612  hypothetical protein  39.32 
 
 
213 aa  147  1e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1893  protein of unknown function DUF1121  38.25 
 
 
213 aa  145  4e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1542  protein of unknown function DUF1121  39.81 
 
 
213 aa  139  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13570  Protein of unknown function (DUF1121)  36.67 
 
 
213 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1287  protein of unknown function DUF1121  37.95 
 
 
210 aa  134  1e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2470  protein of unknown function DUF1121  33.82 
 
 
212 aa  130  1e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1905  hypothetical protein  39.02 
 
 
213 aa  130  2e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0446817  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0911  hypothetical protein  34.5 
 
 
213 aa  130  2e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.849271  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0096  protein of unknown function DUF1121  38.92 
 
 
205 aa  129  4e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1410  hypothetical protein  36.97 
 
 
213 aa  129  5e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.836587  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0762  hypothetical protein  38.12 
 
 
217 aa  128  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3273  hypothetical protein  41.21 
 
 
212 aa  125  4e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  8.62286e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2382  protein of unknown function DUF1121  38.12 
 
 
212 aa  125  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21950  Protein of unknown function (DUF1121)  39.39 
 
 
211 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1208  hypothetical protein  37.26 
 
 
213 aa  125  7e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1422  hypothetical protein  35.75 
 
 
213 aa  124  8e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0835369  normal  0.792436 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1212  hypothetical protein  33.18 
 
 
213 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0773  hypothetical protein  41.01 
 
 
215 aa  121  1e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00386698  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0796  hypothetical protein  41.01 
 
 
215 aa  121  1e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.160214  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0486  hypothetical protein  31.75 
 
 
213 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2993  protein of unknown function DUF1121  33.33 
 
 
224 aa  117  1e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.665625  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1793  protein of unknown function DUF1121  33.33 
 
 
210 aa  115  7e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0753  protein of unknown function DUF1121  34.29 
 
 
198 aa  112  4e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1305  protein of unknown function DUF1121  34.17 
 
 
203 aa  111  1e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0598  protein of unknown function DUF1121  31.86 
 
 
214 aa  108  9e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0424  hypothetical protein  41.13 
 
 
213 aa  103  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1347  hypothetical protein  33.5 
 
 
200 aa  103  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0720312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3138  protein of unknown function DUF1121  32.84 
 
 
209 aa  80.1  3e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2285  hypothetical protein  29.75 
 
 
223 aa  67  3e-10  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2663  protein of unknown function DUF1121  36 
 
 
218 aa  53.5  3e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4815  hypothetical protein  27.48 
 
 
209 aa  51.2  1e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640334  normal  0.0869756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8703  hypothetical protein  29.28 
 
 
213 aa  51.6  1e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.265431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4871  hypothetical protein  26.74 
 
 
209 aa  48.5  8e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0163871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>